56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1172 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_1172  von Willebrand factor type A  100 
 
 		 352 aa  731    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3684  von Willebrand factor type A  44.26 
 
 		 346 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.497723  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0567  von Willebrand factor type A  43.14 
 
 		 346 aa  296  4e-79  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1089  putative tellurium resistance protein  43.14 
 
 		 346 aa  296  4e-79  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0505  putative tellurium resistance protein  43.14 
 
 		 346 aa  296  4e-79  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4666  von Willebrand factor, type A  39.89 
 
 		 350 aa  290  2e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.404551  normal  0.0464435 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0630  hypothetical protein  34.34 
 
 		 343 aa  228  9e-59  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2991  von Willebrand factor type A  41.75 
 
 		 219 aa  161  2e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00948375  normal  0.342829 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4669  von Willebrand factor, type A  41.15 
 
 		 212 aa  152  1e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.264174  normal  0.0341202 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3687  von Willebrand factor type A  40.1 
 
 		 212 aa  149  5e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.189845  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1166  von Willebrand factor type A  38.69 
 
 		 212 aa  145  7.0000000000000006e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0570  von Willebrand factor type A  39.58 
 
 		 212 aa  145  8.000000000000001e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0508  putative tellurium resistance protein  39.58 
 
 		 212 aa  145  8.000000000000001e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1086  putative tellurium resistance protein  39.58 
 
 		 212 aa  145  8.000000000000001e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0628  hypothetical protein  39.89 
 
 		 212 aa  141  1.9999999999999998e-32  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1170  von Willebrand factor type A  40.21 
 
 		 211 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.906773 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3685  von Willebrand factor type A  35.4 
 
 		 212 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.523422  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0506  putative tellurium resistance protein  37.36 
 
 		 212 aa  121  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0568  von Willebrand factor type A  37.36 
 
 		 233 aa  120  3e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1088  putative tellurium resistance protein  36.81 
 
 		 222 aa  119  9.999999999999999e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4667  von Willebrand factor, type A  37.13 
 
 		 213 aa  117  3.9999999999999997e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.40968  normal  0.0500765 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0629  hypothetical protein  34.85 
 
 		 225 aa  115  7.999999999999999e-25  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2880  von Willebrand factor type A domain protein  28.28 
 
 		 225 aa  80.5  0.00000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.158441  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2499  von Willebrand factor type A  28.28 
 
 		 225 aa  80.5  0.00000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.950174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0637  von Willebrand factor, type A  29.7 
 
 		 224 aa  74.3  0.000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2727  von Willebrand factor, type A  28.08 
 
 		 233 aa  72  0.00000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0810  von Willebrand factor, type A  27.98 
 
 		 233 aa  68.6  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1643  von Willebrand factor type A  23.9 
 
 		 223 aa  67.8  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4762  von Willebrand factor type A domain protein  28.57 
 
 		 224 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1498  von Willebrand factor type A  29.73 
 
 		 228 aa  67  0.0000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3006  hypothetical protein  27.23 
 
 		 222 aa  65.9  0.0000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2365  von Willebrand factor type A domain-containing protein  33.33 
 
 		 219 aa  64.3  0.000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01967  hypothetical protein  32.62 
 
 		 219 aa  62  0.00000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01978  hypothetical protein  32.62 
 
 		 219 aa  62  0.00000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1917  von Willebrand factor, type A  24.87 
 
 		 1204 aa  61.6  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.137165 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3010  von Willebrand factor type A domain protein  32.62 
 
 		 219 aa  62  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.136954 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0987  von Willebrand factor type A domain-containing protein  32.62 
 
 		 219 aa  62  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.233145 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2107  von Willebrand factor type A  29.83 
 
 		 254 aa  60.5  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1584  von Willebrand factor type A  31.91 
 
 		 219 aa  60.5  0.00000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.154972  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1568  von Willebrand factor type A  31.91 
 
 		 219 aa  60.5  0.00000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.921097  normal  0.435058 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0134  von Willebrand factor, type A  24.76 
 
 		 218 aa  60.5  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.864003  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0482  von Willebrand factor type A  23.88 
 
 		 222 aa  60.5  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2215  von Willebrand factor type A domain-containing protein  31.91 
 
 		 219 aa  60.5  0.00000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7176  von Willebrand factor type A  31.29 
 
 		 238 aa  59.3  0.00000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.135257  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3137  von Willebrand factor type A  24.08 
 
 		 224 aa  58.2  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1160  von Willebrand factor type A domain protein  31.91 
 
 		 219 aa  58.5  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1103  von Willebrand factor, type A  26.04 
 
 		 224 aa  57.8  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2368  von Willebrand factor, type A  27.55 
 
 		 220 aa  55.1  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0560  von Willebrand factor type A  25.12 
 
 		 230 aa  54.7  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4203  von Willebrand factor type A  25.41 
 
 		 244 aa  53.9  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.258867  normal  0.0187609 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1463  von Willebrand factor, type A  26.16 
 
 		 425 aa  51.2  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.197313  normal  0.691375 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2162  von Willebrand factor type A  25 
 
 		 425 aa  50.4  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.314741  hitchhiker  0.000328198 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3582  hypothetical protein  27.1 
 
 		 202 aa  48.9  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.857055  normal  0.123891 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28661  hypothetical protein  23.77 
 
 		 252 aa  46.6  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.889517 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4255  von Willebrand factor, type A  26.87 
 
 		 240 aa  46.2  0.0008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5987  von Willebrand factor, type A  24.44 
 
 		 248 aa  43.5  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.919016  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>