46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_3582 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_3582  hypothetical protein  100 
 
 		 202 aa  402  1e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.857055  normal  0.123891 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1498  von Willebrand factor type A  35.57 
 
 		 228 aa  96.7  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1643  von Willebrand factor type A  33.56 
 
 		 223 aa  79  0.00000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5987  von Willebrand factor, type A  33.85 
 
 		 248 aa  68.9  0.00000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.919016  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4666  von Willebrand factor, type A  33.56 
 
 		 350 aa  61.2  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.404551  normal  0.0464435 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7176  von Willebrand factor type A  32.5 
 
 		 238 aa  59.7  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.135257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1166  von Willebrand factor type A  27.33 
 
 		 212 aa  56.2  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0570  von Willebrand factor type A  30.83 
 
 		 212 aa  55.8  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1086  putative tellurium resistance protein  30.83 
 
 		 212 aa  55.8  0.0000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0508  putative tellurium resistance protein  30.83 
 
 		 212 aa  55.8  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3687  von Willebrand factor type A  30.83 
 
 		 212 aa  55.1  0.0000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.189845  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4669  von Willebrand factor, type A  26 
 
 		 212 aa  54.7  0.0000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.264174  normal  0.0341202 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2215  von Willebrand factor type A domain-containing protein  28.3 
 
 		 219 aa  53.9  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1568  von Willebrand factor type A  28.3 
 
 		 219 aa  53.9  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.921097  normal  0.435058 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1584  von Willebrand factor type A  28.3 
 
 		 219 aa  53.9  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.154972  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2365  von Willebrand factor type A domain-containing protein  27.67 
 
 		 219 aa  52.4  0.000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01967  hypothetical protein  27.67 
 
 		 219 aa  51.6  0.000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01978  hypothetical protein  27.67 
 
 		 219 aa  51.6  0.000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0987  von Willebrand factor type A domain-containing protein  27.67 
 
 		 219 aa  51.6  0.000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.233145 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0628  hypothetical protein  31.71 
 
 		 212 aa  50.8  0.00001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3010  von Willebrand factor type A domain protein  28.47 
 
 		 219 aa  50.4  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.136954 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0482  von Willebrand factor type A  27.81 
 
 		 222 aa  49.7  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1170  von Willebrand factor type A  28.8 
 
 		 211 aa  49.7  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.906773 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1172  von Willebrand factor type A  27.1 
 
 		 352 aa  49.3  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3684  von Willebrand factor type A  28 
 
 		 346 aa  48.5  0.00006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.497723  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2107  von Willebrand factor type A  29.45 
 
 		 254 aa  48.5  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2368  von Willebrand factor, type A  22.02 
 
 		 220 aa  48.5  0.00007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1160  von Willebrand factor type A domain protein  27.04 
 
 		 219 aa  48.5  0.00007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0630  hypothetical protein  27.81 
 
 		 343 aa  48.1  0.00008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2991  von Willebrand factor type A  22.82 
 
 		 219 aa  47.4  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00948375  normal  0.342829 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0134  von Willebrand factor, type A  27.4 
 
 		 218 aa  47.4  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.864003  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0506  putative tellurium resistance protein  26.97 
 
 		 212 aa  46.6  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0637  von Willebrand factor, type A  31.25 
 
 		 224 aa  46.6  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0810  von Willebrand factor, type A  28.77 
 
 		 233 aa  47  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3137  von Willebrand factor type A  26.17 
 
 		 224 aa  46.2  0.0003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0568  von Willebrand factor type A  26.97 
 
 		 233 aa  46.2  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0567  von Willebrand factor type A  27.92 
 
 		 346 aa  46.6  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1089  putative tellurium resistance protein  27.92 
 
 		 346 aa  46.6  0.0003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0505  putative tellurium resistance protein  27.92 
 
 		 346 aa  46.6  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3685  von Willebrand factor type A  26.85 
 
 		 212 aa  45.4  0.0005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.523422  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0560  von Willebrand factor type A  26.22 
 
 		 230 aa  45.4  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2727  von Willebrand factor, type A  27.83 
 
 		 233 aa  45.4  0.0006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7212  von Willebrand factor type A domain protein  30.73 
 
 		 490 aa  45.1  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.548543  normal  0.0992669 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1088  putative tellurium resistance protein  26.32 
 
 		 222 aa  44.3  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3006  hypothetical protein  24.39 
 
 		 222 aa  42.7  0.004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4667  von Willebrand factor, type A  26.32 
 
 		 213 aa  41.6  0.009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.40968  normal  0.0500765 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>