65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1643 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_1643  von Willebrand factor type A  100 
 
 
223 aa  456  1e-127  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1498  von Willebrand factor type A  66.67 
 
 
228 aa  289  2e-77  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7176  von Willebrand factor type A  37.61 
 
 
238 aa  142  3e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.135257  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5987  von Willebrand factor, type A  38.81 
 
 
248 aa  138  4.999999999999999e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.919016  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3687  von Willebrand factor type A  29.35 
 
 
212 aa  85.9  4e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.189845  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2991  von Willebrand factor type A  28.06 
 
 
219 aa  82.8  0.000000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00948375  normal  0.342829 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1166  von Willebrand factor type A  28.26 
 
 
212 aa  81.6  0.000000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4669  von Willebrand factor, type A  28.49 
 
 
212 aa  80.9  0.00000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.264174  normal  0.0341202 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3582  hypothetical protein  33.56 
 
 
202 aa  79  0.00000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.857055  normal  0.123891 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0508  putative tellurium resistance protein  27.57 
 
 
212 aa  79  0.00000000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1086  putative tellurium resistance protein  27.57 
 
 
212 aa  79  0.00000000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0570  von Willebrand factor type A  27.57 
 
 
212 aa  79  0.00000000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3684  von Willebrand factor type A  30.06 
 
 
346 aa  72.4  0.000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.497723  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4667  von Willebrand factor, type A  33.06 
 
 
213 aa  72  0.000000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.40968  normal  0.0500765 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0630  hypothetical protein  26.01 
 
 
343 aa  70.5  0.00000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4666  von Willebrand factor, type A  26.63 
 
 
350 aa  67.8  0.0000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.404551  normal  0.0464435 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0628  hypothetical protein  32.2 
 
 
212 aa  67.4  0.0000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0505  putative tellurium resistance protein  28.11 
 
 
346 aa  67.4  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1917  von Willebrand factor, type A  26.88 
 
 
1204 aa  67  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.137165 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1089  putative tellurium resistance protein  28.11 
 
 
346 aa  67.4  0.0000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0567  von Willebrand factor type A  28.11 
 
 
346 aa  67.4  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1170  von Willebrand factor type A  31.67 
 
 
211 aa  66.6  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.906773 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3685  von Willebrand factor type A  30.25 
 
 
212 aa  65.9  0.0000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.523422  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1584  von Willebrand factor type A  29.56 
 
 
219 aa  65.5  0.0000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.154972  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1568  von Willebrand factor type A  29.56 
 
 
219 aa  65.5  0.0000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.921097  normal  0.435058 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2215  von Willebrand factor type A domain-containing protein  29.56 
 
 
219 aa  65.5  0.0000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0506  putative tellurium resistance protein  28.68 
 
 
212 aa  65.5  0.0000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0568  von Willebrand factor type A  28.68 
 
 
233 aa  65.5  0.0000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2365  von Willebrand factor type A domain-containing protein  28.93 
 
 
219 aa  63.9  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01978  hypothetical protein  28.39 
 
 
219 aa  63.9  0.000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01967  hypothetical protein  28.39 
 
 
219 aa  63.9  0.000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3010  von Willebrand factor type A domain protein  28.93 
 
 
219 aa  63.5  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.136954 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0987  von Willebrand factor type A domain-containing protein  28.93 
 
 
219 aa  63.9  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.233145 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1088  putative tellurium resistance protein  27.94 
 
 
222 aa  63.2  0.000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2880  von Willebrand factor type A domain protein  25.59 
 
 
225 aa  63.2  0.000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.158441  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2499  von Willebrand factor type A  25.59 
 
 
225 aa  63.2  0.000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.950174  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0637  von Willebrand factor, type A  25.13 
 
 
224 aa  62  0.000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1103  von Willebrand factor, type A  28.75 
 
 
224 aa  62  0.000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1172  von Willebrand factor type A  23.44 
 
 
352 aa  61.6  0.000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4255  von Willebrand factor, type A  30.57 
 
 
240 aa  61.6  0.000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1160  von Willebrand factor type A domain protein  27.74 
 
 
219 aa  60.8  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3137  von Willebrand factor type A  28.12 
 
 
224 aa  60.1  0.00000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0482  von Willebrand factor type A  29.17 
 
 
222 aa  59.7  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0560  von Willebrand factor type A  28.31 
 
 
230 aa  59.7  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0810  von Willebrand factor, type A  28.45 
 
 
233 aa  58.9  0.00000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4203  von Willebrand factor type A  27.37 
 
 
244 aa  57  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.258867  normal  0.0187609 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04060  hypothetical protein  26.44 
 
 
272 aa  55.8  0.0000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.151575 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0134  von Willebrand factor, type A  26.22 
 
 
218 aa  55.8  0.0000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.864003  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1244  von Willebrand factor, type A  25.38 
 
 
412 aa  55.5  0.0000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.427731  normal  0.129489 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2727  von Willebrand factor, type A  29.82 
 
 
233 aa  55.1  0.0000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04030  hypothetical protein  25.96 
 
 
268 aa  55.1  0.0000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.827686 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0629  hypothetical protein  27.42 
 
 
225 aa  54.7  0.000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2107  von Willebrand factor type A  25.62 
 
 
254 aa  54.7  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2368  von Willebrand factor, type A  26.36 
 
 
220 aa  54.3  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3006  hypothetical protein  23.75 
 
 
222 aa  54.3  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4762  von Willebrand factor type A domain protein  27.12 
 
 
224 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0262  von Willebrand factor type A  25.26 
 
 
418 aa  45.8  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0264  von Willebrand factor type A  25.26 
 
 
418 aa  45.8  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5060  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  28.12 
 
 
5962 aa  45.1  0.0008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.943676 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1053  von Willebrand factor type A  28.99 
 
 
655 aa  44.3  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.463528  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3334  von Willebrand factor, type A  30.38 
 
 
441 aa  43.5  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0867289  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0442  von Willebrand factor, type A  26.6 
 
 
646 aa  44.3  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4211  von Willebrand factor type A  32.65 
 
 
415 aa  43.9  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.290242  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1307  von Willebrand factor, type A  25.33 
 
 
418 aa  43.1  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1830  von Willebrand factor type A  26.11 
 
 
573 aa  43.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>