57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_0629 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008309  HS_0629  hypothetical protein  100 
 
 		 225 aa  462  1e-129  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4667  von Willebrand factor, type A  54.98 
 
 		 213 aa  247  8e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.40968  normal  0.0500765 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3685  von Willebrand factor type A  50.71 
 
 		 212 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.523422  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1170  von Willebrand factor type A  52.38 
 
 		 211 aa  222  4e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.906773 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0568  von Willebrand factor type A  51.18 
 
 		 233 aa  219  1.9999999999999999e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0506  putative tellurium resistance protein  51.18 
 
 		 212 aa  220  1.9999999999999999e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1088  putative tellurium resistance protein  50.71 
 
 		 222 aa  218  7e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0628  hypothetical protein  50.23 
 
 		 212 aa  191  7e-48  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4669  von Willebrand factor, type A  44.19 
 
 		 212 aa  179  2e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.264174  normal  0.0341202 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1166  von Willebrand factor type A  45.12 
 
 		 212 aa  177  8e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1086  putative tellurium resistance protein  43.15 
 
 		 212 aa  166  2.9999999999999998e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0570  von Willebrand factor type A  43.15 
 
 		 212 aa  166  2.9999999999999998e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0508  putative tellurium resistance protein  43.15 
 
 		 212 aa  166  2.9999999999999998e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3687  von Willebrand factor type A  39.59 
 
 		 212 aa  161  6e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.189845  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2991  von Willebrand factor type A  35.91 
 
 		 219 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00948375  normal  0.342829 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0567  von Willebrand factor type A  31.34 
 
 		 346 aa  117  1.9999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1089  putative tellurium resistance protein  31.34 
 
 		 346 aa  117  1.9999999999999998e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0505  putative tellurium resistance protein  31.34 
 
 		 346 aa  117  1.9999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3684  von Willebrand factor type A  32.34 
 
 		 346 aa  116  3e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.497723  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4666  von Willebrand factor, type A  32.49 
 
 		 350 aa  111  8.000000000000001e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.404551  normal  0.0464435 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1172  von Willebrand factor type A  34.41 
 
 		 352 aa  110  1.0000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0810  von Willebrand factor, type A  28.02 
 
 		 233 aa  79.7  0.00000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0630  hypothetical protein  28.07 
 
 		 343 aa  73.6  0.000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2368  von Willebrand factor, type A  30.39 
 
 		 220 aa  72.8  0.000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2727  von Willebrand factor, type A  25.47 
 
 		 233 aa  70.5  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1917  von Willebrand factor, type A  27.09 
 
 		 1204 aa  69.3  0.00000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.137165 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3006  hypothetical protein  28.28 
 
 		 222 aa  69.3  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0637  von Willebrand factor, type A  27.5 
 
 		 224 aa  65.1  0.0000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1103  von Willebrand factor, type A  33.91 
 
 		 224 aa  63.5  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4762  von Willebrand factor type A domain protein  25.41 
 
 		 224 aa  62.8  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4203  von Willebrand factor type A  28.85 
 
 		 244 aa  62.4  0.000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.258867  normal  0.0187609 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3137  von Willebrand factor type A  24.62 
 
 		 224 aa  62  0.000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0482  von Willebrand factor type A  24.62 
 
 		 222 aa  59.7  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0560  von Willebrand factor type A  27.92 
 
 		 230 aa  58.5  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1498  von Willebrand factor type A  29.91 
 
 		 228 aa  58.5  0.00000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1568  von Willebrand factor type A  35.04 
 
 		 219 aa  57.4  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.921097  normal  0.435058 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0987  von Willebrand factor type A domain-containing protein  35.04 
 
 		 219 aa  57.4  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.233145 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2215  von Willebrand factor type A domain-containing protein  35.04 
 
 		 219 aa  57.4  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3010  von Willebrand factor type A domain protein  35.04 
 
 		 219 aa  57.4  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.136954 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01978  hypothetical protein  35.04 
 
 		 219 aa  57.4  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2365  von Willebrand factor type A domain-containing protein  35.04 
 
 		 219 aa  57  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01967  hypothetical protein  35.04 
 
 		 219 aa  57.4  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1584  von Willebrand factor type A  35.04 
 
 		 219 aa  57.4  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.154972  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0134  von Willebrand factor, type A  27.86 
 
 		 218 aa  57  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.864003  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2880  von Willebrand factor type A domain protein  26.88 
 
 		 225 aa  55.5  0.0000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.158441  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2499  von Willebrand factor type A  26.88 
 
 		 225 aa  55.5  0.0000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.950174  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1643  von Willebrand factor type A  27.42 
 
 		 223 aa  54.7  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4255  von Willebrand factor, type A  28.92 
 
 		 240 aa  54.7  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1160  von Willebrand factor type A domain protein  34.19 
 
 		 219 aa  53.9  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7176  von Willebrand factor type A  27.27 
 
 		 238 aa  51.6  0.000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.135257  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2107  von Willebrand factor type A  30.77 
 
 		 254 aa  50.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5987  von Willebrand factor, type A  24.79 
 
 		 248 aa  45.4  0.0007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.919016  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28661  hypothetical protein  25.74 
 
 		 252 aa  45.4  0.0007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.889517 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0408  von Willebrand factor type A  27.16 
 
 		 236 aa  44.3  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1830  von Willebrand factor type A  26.99 
 
 		 573 aa  43.9  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04030  hypothetical protein  26.7 
 
 		 268 aa  42.7  0.004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.827686 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2129  von Willebrand factor type A  25.47 
 
 		 833 aa  41.6  0.01  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>