85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1166 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_1166  von Willebrand factor type A  100 
 
 		 212 aa  426  1e-119  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4669  von Willebrand factor, type A  70.28 
 
 		 212 aa  304  6e-82  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.264174  normal  0.0341202 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1086  putative tellurium resistance protein  68.4 
 
 		 212 aa  290  1e-77  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0508  putative tellurium resistance protein  68.4 
 
 		 212 aa  290  1e-77  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0570  von Willebrand factor type A  68.4 
 
 		 212 aa  290  1e-77  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0628  hypothetical protein  67.45 
 
 		 212 aa  287  7e-77  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3687  von Willebrand factor type A  67.92 
 
 		 212 aa  287  9e-77  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.189845  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3685  von Willebrand factor type A  49.07 
 
 		 212 aa  217  1e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.523422  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1170  von Willebrand factor type A  51.85 
 
 		 211 aa  212  3.9999999999999995e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.906773 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4667  von Willebrand factor, type A  51.4 
 
 		 213 aa  209  2e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.40968  normal  0.0500765 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2991  von Willebrand factor type A  49.53 
 
 		 219 aa  203  2e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00948375  normal  0.342829 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0506  putative tellurium resistance protein  48.61 
 
 		 212 aa  201  9e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0568  von Willebrand factor type A  48.61 
 
 		 233 aa  200  9.999999999999999e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1088  putative tellurium resistance protein  48.15 
 
 		 222 aa  198  3.9999999999999996e-50  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0629  hypothetical protein  45.12 
 
 		 225 aa  189  2.9999999999999997e-47  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0567  von Willebrand factor type A  41.88 
 
 		 346 aa  157  1e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1089  putative tellurium resistance protein  41.88 
 
 		 346 aa  157  1e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0505  putative tellurium resistance protein  41.88 
 
 		 346 aa  157  1e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3684  von Willebrand factor type A  41.88 
 
 		 346 aa  156  3e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.497723  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4666  von Willebrand factor, type A  38.32 
 
 		 350 aa  151  8.999999999999999e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.404551  normal  0.0464435 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1172  von Willebrand factor type A  36.36 
 
 		 352 aa  145  5e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0630  hypothetical protein  41.62 
 
 		 343 aa  135  4e-31  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1917  von Willebrand factor, type A  30.39 
 
 		 1204 aa  88.2  8e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.137165 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0637  von Willebrand factor, type A  30.05 
 
 		 224 aa  86.3  3e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0134  von Willebrand factor, type A  30.24 
 
 		 218 aa  84.3  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.864003  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1498  von Willebrand factor type A  35.83 
 
 		 228 aa  84.3  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0560  von Willebrand factor type A  32.37 
 
 		 230 aa  82.8  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4203  von Willebrand factor type A  35.29 
 
 		 244 aa  82.8  0.000000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.258867  normal  0.0187609 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4762  von Willebrand factor type A domain protein  31.67 
 
 		 224 aa  82.8  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2365  von Willebrand factor type A domain-containing protein  34.62 
 
 		 219 aa  82.8  0.000000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1643  von Willebrand factor type A  28.26 
 
 		 223 aa  82  0.000000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3010  von Willebrand factor type A domain protein  33.97 
 
 		 219 aa  82  0.000000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.136954 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2880  von Willebrand factor type A domain protein  28.49 
 
 		 225 aa  80.9  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.158441  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0987  von Willebrand factor type A domain-containing protein  33.97 
 
 		 219 aa  81.3  0.00000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.233145 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2499  von Willebrand factor type A  28.49 
 
 		 225 aa  80.9  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.950174  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01967  hypothetical protein  33.97 
 
 		 219 aa  81.3  0.00000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01978  hypothetical protein  33.97 
 
 		 219 aa  81.3  0.00000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1568  von Willebrand factor type A  33.33 
 
 		 219 aa  79.7  0.00000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.921097  normal  0.435058 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1584  von Willebrand factor type A  33.33 
 
 		 219 aa  79.7  0.00000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.154972  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2215  von Willebrand factor type A domain-containing protein  33.33 
 
 		 219 aa  79.7  0.00000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3006  hypothetical protein  31.25 
 
 		 222 aa  78.6  0.00000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2727  von Willebrand factor, type A  31.18 
 
 		 233 aa  77.4  0.0000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1160  von Willebrand factor type A domain protein  33.33 
 
 		 219 aa  77.8  0.0000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2107  von Willebrand factor type A  29.78 
 
 		 254 aa  76.3  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0482  von Willebrand factor type A  29.35 
 
 		 222 aa  75.1  0.0000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2368  von Willebrand factor, type A  30 
 
 		 220 aa  72.8  0.000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7176  von Willebrand factor type A  34.38 
 
 		 238 aa  70.5  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.135257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0810  von Willebrand factor, type A  28.44 
 
 		 233 aa  70.1  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3137  von Willebrand factor type A  27.8 
 
 		 224 aa  69.3  0.00000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1103  von Willebrand factor, type A  27.8 
 
 		 224 aa  69.3  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4255  von Willebrand factor, type A  30.73 
 
 		 240 aa  65.5  0.0000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04030  hypothetical protein  31.55 
 
 		 268 aa  65.1  0.0000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.827686 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5987  von Willebrand factor, type A  32.03 
 
 		 248 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.919016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04060  hypothetical protein  26.44 
 
 		 272 aa  58.9  0.00000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.151575 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2191  von Willebrand factor type A  31.87 
 
 		 546 aa  57.4  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1244  von Willebrand factor, type A  32.77 
 
 		 412 aa  57  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.427731  normal  0.129489 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2951  von Willebrand factor type A  35.77 
 
 		 418 aa  56.2  0.0000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3582  hypothetical protein  27.33 
 
 		 202 aa  56.6  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.857055  normal  0.123891 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5207  von Willebrand factor type A  30.3 
 
 		 412 aa  55.5  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000146018 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0408  von Willebrand factor type A  28.06 
 
 		 236 aa  54.3  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28661  hypothetical protein  23.08 
 
 		 252 aa  54.7  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.889517 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2796  von Willebrand factor, type A  31.32 
 
 		 543 aa  54.3  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.110662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2575  von Willebrand factor type A  29.35 
 
 		 547 aa  52.8  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3203  von Willebrand factor type A  33.91 
 
 		 421 aa  51.2  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.231871  normal  0.719364 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01450  hypothetical protein  31.3 
 
 		 744 aa  48.9  0.00006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.657991  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3342  hypothetical protein  32.12 
 
 		 447 aa  48.5  0.00007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1307  von Willebrand factor, type A  33.61 
 
 		 418 aa  48.5  0.00008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1830  von Willebrand factor type A  31.4 
 
 		 573 aa  47.8  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0031  hypothetical protein  31.82 
 
 		 442 aa  46.6  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.305172  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0723  von Willebrand factor type A  29.88 
 
 		 419 aa  45.1  0.0007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0959383  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3119  von Willebrand factor type A  26.88 
 
 		 393 aa  45.1  0.0007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1625  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  32.77 
 
 		 722 aa  45.4  0.0007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.466384  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0264  von Willebrand factor type A  31.71 
 
 		 418 aa  44.3  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0262  von Willebrand factor type A  31.71 
 
 		 418 aa  44.3  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2065  von Willebrand factor type A  33.61 
 
 		 380 aa  43.9  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1492  von Willebrand factor, type A  33.62 
 
 		 383 aa  43.9  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2206  BatA  26.92 
 
 		 317 aa  44.3  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0553658  normal  0.0945164 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4309  hypothetical protein  31.61 
 
 		 455 aa  43.5  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1017  von Willebrand factor type A; type II secretion system protein  34.01 
 
 		 643 aa  43.1  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2454  von Willebrand factor type A  33.06 
 
 		 332 aa  43.1  0.003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00561279 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2799  von Willebrand factor, type A  26.99 
 
 		 561 aa  43.1  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2162  von Willebrand factor type A  29.9 
 
 		 425 aa  42.7  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.314741  hitchhiker  0.000328198 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2950  von Willebrand factor type A  26.44 
 
 		 426 aa  42.4  0.005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_54892  predicted protein  30.23 
 
 		 523 aa  42  0.007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2768  von Willebrand factor, type A  28.42 
 
 		 412 aa  41.6  0.009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.271285  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>