69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_4255 on replicon NC_008757
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008757  Pnap_4255  von Willebrand factor, type A  100 
 
 
240 aa  479  1e-134  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4203  von Willebrand factor type A  45.27 
 
 
244 aa  166  2.9999999999999998e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.258867  normal  0.0187609 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0408  von Willebrand factor type A  32.59 
 
 
236 aa  87  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04060  hypothetical protein  28.24 
 
 
272 aa  80.5  0.00000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.151575 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28661  hypothetical protein  34.81 
 
 
252 aa  79  0.00000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.889517 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2991  von Willebrand factor type A  29.38 
 
 
219 aa  75.5  0.0000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00948375  normal  0.342829 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1160  von Willebrand factor type A domain protein  34.76 
 
 
219 aa  72  0.000000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04030  hypothetical protein  28.5 
 
 
268 aa  70.9  0.00000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.827686 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01978  hypothetical protein  34.15 
 
 
219 aa  70.1  0.00000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01967  hypothetical protein  34.15 
 
 
219 aa  70.1  0.00000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2215  von Willebrand factor type A domain-containing protein  36.14 
 
 
219 aa  70.1  0.00000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1568  von Willebrand factor type A  36.14 
 
 
219 aa  70.1  0.00000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.921097  normal  0.435058 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0987  von Willebrand factor type A domain-containing protein  34.15 
 
 
219 aa  70.1  0.00000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.233145 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3010  von Willebrand factor type A domain protein  34.15 
 
 
219 aa  70.1  0.00000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.136954 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1584  von Willebrand factor type A  36.14 
 
 
219 aa  70.1  0.00000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.154972  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3006  hypothetical protein  31.4 
 
 
222 aa  69.7  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2365  von Willebrand factor type A domain-containing protein  33.13 
 
 
219 aa  67.8  0.0000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2880  von Willebrand factor type A domain protein  29.47 
 
 
225 aa  67  0.0000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.158441  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2499  von Willebrand factor type A  29.47 
 
 
225 aa  67  0.0000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.950174  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0810  von Willebrand factor, type A  30.77 
 
 
233 aa  66.6  0.0000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1917  von Willebrand factor, type A  30.25 
 
 
1204 aa  65.5  0.0000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.137165 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0560  von Willebrand factor type A  31.19 
 
 
230 aa  65.5  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1166  von Willebrand factor type A  30.05 
 
 
212 aa  64.7  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0134  von Willebrand factor, type A  31.25 
 
 
218 aa  64.7  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.864003  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1643  von Willebrand factor type A  30.57 
 
 
223 aa  61.6  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3685  von Willebrand factor type A  27.64 
 
 
212 aa  60.5  0.00000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.523422  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3684  von Willebrand factor type A  26.17 
 
 
346 aa  60.1  0.00000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.497723  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4669  von Willebrand factor, type A  31.98 
 
 
212 aa  60.1  0.00000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.264174  normal  0.0341202 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0505  putative tellurium resistance protein  28.17 
 
 
346 aa  58.9  0.00000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0567  von Willebrand factor type A  28.17 
 
 
346 aa  58.9  0.00000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1089  putative tellurium resistance protein  28.17 
 
 
346 aa  58.9  0.00000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2727  von Willebrand factor, type A  30.25 
 
 
233 aa  57.8  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1086  putative tellurium resistance protein  27.46 
 
 
212 aa  57.8  0.0000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0637  von Willebrand factor, type A  27.4 
 
 
224 aa  57.8  0.0000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0508  putative tellurium resistance protein  27.46 
 
 
212 aa  57.8  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4762  von Willebrand factor type A domain protein  29.94 
 
 
224 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0570  von Willebrand factor type A  27.46 
 
 
212 aa  57.8  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2107  von Willebrand factor type A  27.78 
 
 
254 aa  55.1  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3687  von Willebrand factor type A  27.32 
 
 
212 aa  54.7  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.189845  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0629  hypothetical protein  28.92 
 
 
225 aa  53.9  0.000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5987  von Willebrand factor, type A  30.23 
 
 
248 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.919016  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0568  von Willebrand factor type A  26.49 
 
 
233 aa  53.1  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0506  putative tellurium resistance protein  27.61 
 
 
212 aa  53.1  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2088  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  31.3 
 
 
600 aa  52.8  0.000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7176  von Willebrand factor type A  33.88 
 
 
238 aa  51.6  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.135257  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1088  putative tellurium resistance protein  25.41 
 
 
222 aa  50.8  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4667  von Willebrand factor, type A  29.13 
 
 
213 aa  50.4  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.40968  normal  0.0500765 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1498  von Willebrand factor type A  26.35 
 
 
228 aa  49.7  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2026  von Willebrand factor type A  26.59 
 
 
599 aa  49.3  0.00006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1319  hypothetical protein  27.42 
 
 
229 aa  47.8  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.643261 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1621  von Willebrand factor type A  29.31 
 
 
699 aa  47.4  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.921819  normal  0.480885 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1170  von Willebrand factor type A  30.65 
 
 
211 aa  46.6  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.906773 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1309  cobaltochelatase subunit  31.03 
 
 
657 aa  46.6  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.441078  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0628  hypothetical protein  27.47 
 
 
212 aa  46.2  0.0004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2489  von Willebrand factor type A  30.77 
 
 
690 aa  45.8  0.0006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.325588 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4666  von Willebrand factor, type A  28.28 
 
 
350 aa  45.4  0.0009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.404551  normal  0.0464435 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12865  magnesium chelatase  29.37 
 
 
629 aa  45.1  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.498334  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6039  Magnesium chelatase  29.69 
 
 
719 aa  44.7  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2889  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  27.69 
 
 
653 aa  44.3  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1172  von Willebrand factor type A  26.01 
 
 
352 aa  44.3  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0446  Mg-chelatase subunit ChlD-like protein  28.87 
 
 
592 aa  43.1  0.004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1513  hypothetical protein  25.37 
 
 
605 aa  43.1  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00594342 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2117  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  30.17 
 
 
622 aa  42.7  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0165109 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2054  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  30.17 
 
 
622 aa  42.7  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.457872  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2071  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  30.17 
 
 
622 aa  42.7  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.498251  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5861  Magnesium chelatase  31.62 
 
 
680 aa  42.7  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0159  Magnesium chelatase  30.58 
 
 
705 aa  42.4  0.007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0546  cobaltochelatase subunit  29.51 
 
 
674 aa  42.4  0.007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.200541  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0636  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  30 
 
 
616 aa  41.6  0.01  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.122113  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>