42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_04060 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_04060  hypothetical protein  100 
 
 		 272 aa  550  1e-155  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.151575 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04030  hypothetical protein  66.67 
 
 		 268 aa  348  4e-95  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.827686 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0408  von Willebrand factor type A  39.77 
 
 		 236 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28661  hypothetical protein  33.33 
 
 		 252 aa  98.6  1e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.889517 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4203  von Willebrand factor type A  27.19 
 
 		 244 aa  87.4  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.258867  normal  0.0187609 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4255  von Willebrand factor, type A  28.24 
 
 		 240 aa  80.5  0.00000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4669  von Willebrand factor, type A  31.37 
 
 		 212 aa  63.2  0.000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.264174  normal  0.0341202 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1319  hypothetical protein  27.62 
 
 		 229 aa  62  0.00000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.643261 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0567  von Willebrand factor type A  27.8 
 
 		 346 aa  60.1  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1089  putative tellurium resistance protein  27.8 
 
 		 346 aa  60.1  0.00000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0505  putative tellurium resistance protein  27.8 
 
 		 346 aa  60.1  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1166  von Willebrand factor type A  29.47 
 
 		 212 aa  58.5  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2991  von Willebrand factor type A  28.49 
 
 		 219 aa  57  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00948375  normal  0.342829 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1643  von Willebrand factor type A  26.44 
 
 		 223 aa  55.8  0.0000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5987  von Willebrand factor, type A  28.51 
 
 		 248 aa  55.5  0.0000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.919016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3684  von Willebrand factor type A  28.32 
 
 		 346 aa  55.1  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.497723  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4666  von Willebrand factor, type A  27.75 
 
 		 350 aa  54.3  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.404551  normal  0.0464435 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3687  von Willebrand factor type A  29.22 
 
 		 212 aa  54.7  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.189845  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1498  von Willebrand factor type A  29.76 
 
 		 228 aa  53.5  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0628  hypothetical protein  28.16 
 
 		 212 aa  52.4  0.000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0630  hypothetical protein  31.07 
 
 		 343 aa  52.4  0.000008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1584  von Willebrand factor type A  30.06 
 
 		 219 aa  50.8  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.154972  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1568  von Willebrand factor type A  30.06 
 
 		 219 aa  50.8  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.921097  normal  0.435058 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0570  von Willebrand factor type A  27.85 
 
 		 212 aa  51.2  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1917  von Willebrand factor, type A  26.69 
 
 		 1204 aa  50.8  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.137165 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0508  putative tellurium resistance protein  27.85 
 
 		 212 aa  51.2  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2215  von Willebrand factor type A domain-containing protein  30.06 
 
 		 219 aa  50.8  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1086  putative tellurium resistance protein  27.85 
 
 		 212 aa  51.2  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01978  hypothetical protein  29.48 
 
 		 219 aa  50.1  0.00004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01967  hypothetical protein  29.48 
 
 		 219 aa  50.1  0.00004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0987  von Willebrand factor type A domain-containing protein  29.48 
 
 		 219 aa  49.7  0.00005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.233145 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3685  von Willebrand factor type A  28.71 
 
 		 212 aa  49.7  0.00006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.523422  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3010  von Willebrand factor type A domain protein  29.48 
 
 		 219 aa  49.3  0.00007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.136954 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2107  von Willebrand factor type A  32.37 
 
 		 254 aa  48.5  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1160  von Willebrand factor type A domain protein  29.14 
 
 		 219 aa  47.8  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2880  von Willebrand factor type A domain protein  25.77 
 
 		 225 aa  47  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.158441  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2365  von Willebrand factor type A domain-containing protein  28.9 
 
 		 219 aa  47  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2499  von Willebrand factor type A  25.77 
 
 		 225 aa  47  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.950174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0637  von Willebrand factor, type A  31.07 
 
 		 224 aa  44.3  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7212  von Willebrand factor type A domain protein  26.67 
 
 		 490 aa  43.9  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.548543  normal  0.0992669 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0134  von Willebrand factor, type A  30.22 
 
 		 218 aa  43.1  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.864003  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0568  von Willebrand factor type A  28.88 
 
 		 233 aa  42.4  0.007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>