123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_01450 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_01450  hypothetical protein  100 
 
 
744 aa  1527    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.657991  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1364  von Willebrand factor type A  27.9 
 
 
1188 aa  70.5  0.0000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000145336  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2842  lipolytic protein G-D-S-L family  26.96 
 
 
353 aa  68.6  0.0000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00148431  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0195  hypothetical protein  23.6 
 
 
323 aa  68.6  0.0000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3119  von Willebrand factor type A  30.39 
 
 
393 aa  64.7  0.000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3263  secreted hydrolase  29.67 
 
 
298 aa  63.9  0.000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3260  von Willebrand factor type A  30.15 
 
 
903 aa  63.5  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0740764 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2246  hypothetical protein  24.5 
 
 
446 aa  60.8  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.421702  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2191  von Willebrand factor type A  34.06 
 
 
546 aa  60.5  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0123  von Willebrand factor type A  33.94 
 
 
491 aa  60.1  0.0000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0626455  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0166  hypothetical protein  25 
 
 
367 aa  60.1  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1017  von Willebrand factor type A; type II secretion system protein  27.96 
 
 
643 aa  58.5  0.0000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4585  Triacylglycerol lipase  25.78 
 
 
257 aa  57.8  0.0000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0559591  normal  0.168211 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0477  von Willebrand factor, type A  26.95 
 
 
571 aa  57  0.000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0012  YD repeat protein  29.89 
 
 
3027 aa  57  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0036  von Willebrand factor type A  30.06 
 
 
1446 aa  56.2  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3332  von Willebrand factor, type A  28.03 
 
 
477 aa  56.2  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0350677  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2451  von Willebrand factor type A domain protein  32.17 
 
 
598 aa  56.2  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3203  von Willebrand factor type A  31.58 
 
 
421 aa  56.2  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.231871  normal  0.719364 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4380  putative secreted hydrolase  25.86 
 
 
305 aa  55.5  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.784206  normal  0.181391 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5073  hypothetical protein  25.93 
 
 
1349 aa  55.5  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.528473  hitchhiker  0.000168425 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1139  von Willebrand factor type A  34.51 
 
 
642 aa  55.8  0.000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3252  von Willebrand factor type A  34.51 
 
 
627 aa  55.8  0.000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00246065 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1307  von Willebrand factor, type A  30.12 
 
 
418 aa  55.5  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2659  von Willebrand factor, type A  31.47 
 
 
593 aa  55.1  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.101316  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1830  von Willebrand factor type A  29.11 
 
 
573 aa  54.7  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3212  von Willebrand factor type A  29.01 
 
 
514 aa  54.3  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0502803  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0610  hypothetical protein  23.98 
 
 
455 aa  53.9  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.457827  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1244  von Willebrand factor, type A  28.68 
 
 
412 aa  53.5  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.427731  normal  0.129489 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1038  von Willebrand factor type A  32.86 
 
 
642 aa  53.9  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5207  von Willebrand factor type A  29.41 
 
 
412 aa  53.9  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000146018 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1492  von Willebrand factor, type A  28.04 
 
 
892 aa  53.1  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6113  von Willebrand factor type A  31.87 
 
 
430 aa  53.1  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3131  von Willebrand factor, type A  34.78 
 
 
565 aa  53.5  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1542  Triacylglycerol lipase  22.33 
 
 
259 aa  53.1  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.429303  normal  0.462707 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02345  von Willebrand factor type A domain protein  28.66 
 
 
335 aa  53.1  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4974  Triacylglycerol lipase  23.74 
 
 
261 aa  52.8  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.809775  normal  0.295048 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2700  von Willebrand factor, type A  31.1 
 
 
566 aa  52.4  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.557808  normal  0.158328 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2575  von Willebrand factor type A  30.43 
 
 
547 aa  52.4  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0755  von Willebrand factor type A  26.2 
 
 
418 aa  52.4  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.802956 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7173  von Willebrand factor type A  22.77 
 
 
462 aa  52.4  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00690211  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5121  von Willebrand factor type A  29.25 
 
 
419 aa  52.4  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.104188  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2932  von Willebrand factor, type A  29.33 
 
 
334 aa  52  0.00004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.922939  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2154  Triacylglycerol lipase  27.93 
 
 
274 aa  51.6  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.349109 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1077  von Willebrand factor, type A  30.46 
 
 
612 aa  52  0.00005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0195033  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0197  von Willebrand factor, type A  28.8 
 
 
795 aa  51.6  0.00005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.48931  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3694  hypothetical protein  24.08 
 
 
1357 aa  51.6  0.00005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2914  hypothetical protein  27.59 
 
 
344 aa  51.2  0.00006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2768  hypothetical protein  27.59 
 
 
344 aa  51.2  0.00007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3756  hypothetical protein  30.22 
 
 
437 aa  51.2  0.00007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2796  von Willebrand factor, type A  30.43 
 
 
543 aa  51.2  0.00008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.110662  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1105  von Willebrand factor type A  33.1 
 
 
642 aa  50.8  0.00008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2244  von Willebrand factor, type A  30.94 
 
 
416 aa  50.1  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0785649  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1043  von Willebrand factor, type A  34.04 
 
 
633 aa  50.4  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.359154  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0482  von Willebrand factor type A  26.67 
 
 
222 aa  50.1  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3153  von Willebrand factor, type A  32.62 
 
 
613 aa  49.3  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.573485  normal  0.703806 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1733  von Willebrand factor type A  28.57 
 
 
342 aa  49.7  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.818001  normal  0.561199 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2394  von Willebrand factor type A  28.43 
 
 
412 aa  49.7  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3687  von Willebrand factor type A  31.3 
 
 
212 aa  49.7  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.189845  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1234  von Willebrand factor type A  27.72 
 
 
412 aa  50.1  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.723207  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2086  von Willebrand factor type A  27.32 
 
 
327 aa  48.9  0.0003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1538  von Willebrand factor type A  30.66 
 
 
347 aa  48.9  0.0003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.634535  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3085  batB protein, putative  28.48 
 
 
328 aa  48.5  0.0004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0508  putative tellurium resistance protein  31.3 
 
 
212 aa  48.5  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1086  putative tellurium resistance protein  31.3 
 
 
212 aa  48.5  0.0004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0570  von Willebrand factor type A  31.3 
 
 
212 aa  48.5  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1007  von Willebrand factor type A  30.87 
 
 
324 aa  48.5  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0193109  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2631  von Willebrand factor type A domain-containing protein  26.5 
 
 
442 aa  48.1  0.0005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.813188  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3055  von Willebrand factor, type A  32.62 
 
 
625 aa  48.5  0.0005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.548122 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0791  von Willebrand factor type A  32.08 
 
 
339 aa  48.5  0.0005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.719983  normal  0.0260765 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3232  von Willebrand factor type A  24.84 
 
 
334 aa  48.5  0.0005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.34963  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1166  von Willebrand factor type A  31.3 
 
 
212 aa  48.5  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4904  Triacylglycerol lipase  27.5 
 
 
257 aa  48.1  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2951  von Willebrand factor type A  31.39 
 
 
418 aa  48.1  0.0006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4925  hypothetical protein  26.92 
 
 
295 aa  48.1  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0028  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  29.83 
 
 
701 aa  47.8  0.0007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.880979  normal  0.680993 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3380  von Willebrand factor, type A  27.78 
 
 
459 aa  47.8  0.0008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.178617  hitchhiker  0.00546751 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1851  type II secretion system protein  30.48 
 
 
660 aa  47.8  0.0008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00122698  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0051  von Willebrand factor type A  26.67 
 
 
325 aa  47.4  0.0009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.901325  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2973  von Willebrand factor, type A  31.91 
 
 
624 aa  47  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00160061  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2920  von Willebrand factor, type A  33.02 
 
 
528 aa  47  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.236566  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2469  von Willebrand factor type A  31.1 
 
 
325 aa  47.4  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.597694 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3551  von Willebrand factor type A  30.15 
 
 
505 aa  47.4  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.104304  normal  0.664507 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3552  von Willebrand factor type A domain-containing protein  31.21 
 
 
621 aa  46.2  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007411  Ava_A0006  von Willebrand factor, type A  27.97 
 
 
592 aa  46.6  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0254  von Willebrand factor, type A  28.68 
 
 
615 aa  46.2  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000000406076  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0648  von Willebrand factor, type A  27.95 
 
 
307 aa  46.2  0.002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2655  BatA-like protein, aerotolerance-related  28.06 
 
 
351 aa  46.2  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3488  von Willebrand factor, type A  30.87 
 
 
268 aa  46.2  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.259485 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1128  von Willebrand factor, type A  29.93 
 
 
282 aa  46.6  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0959166  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0719  von Willebrand factor, type A  26.81 
 
 
334 aa  46.2  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.887647  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5503  von Willebrand factor, type A  26.46 
 
 
315 aa  46.2  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0866133  normal  0.0446961 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3726  GDSL family lipase  26.67 
 
 
388 aa  46.2  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0442  von Willebrand factor type A  27.34 
 
 
329 aa  46.2  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.570722  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1123  von Willebrand factor type A  27.74 
 
 
373 aa  46.2  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2319  von Willebrand factor type A  30.71 
 
 
331 aa  46.6  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1797  von Willebrand factor type A  25.58 
 
 
315 aa  46.2  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.152806  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4796  secreted hydrolase  23.16 
 
 
280 aa  46.2  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.31907  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0430  hypothetical protein  31.39 
 
 
336 aa  46.2  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0397  von Willebrand factor type A  26.32 
 
 
579 aa  45.8  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00126629  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>