44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_5073 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_3694  hypothetical protein  35.55 
 
 
1357 aa  687    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5073  hypothetical protein  100 
 
 
1349 aa  2769    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.528473  hitchhiker  0.000168425 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4585  hypothetical protein  39.86 
 
 
1414 aa  595  1e-168  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33340  hypothetical protein  40.61 
 
 
1414 aa  591  1e-167  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.774424  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2644  hypothetical protein  32.36 
 
 
976 aa  437  1e-121  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00661972 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4974  Triacylglycerol lipase  34.01 
 
 
261 aa  105  5e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.809775  normal  0.295048 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1542  Triacylglycerol lipase  30.1 
 
 
259 aa  97.1  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.429303  normal  0.462707 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30530  hypothetical protein  27.63 
 
 
265 aa  91.3  1e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.859475 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3390  hypothetical protein  29.87 
 
 
265 aa  89.4  5e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.402053  normal  0.0777437 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1584  hypothetical protein  28.16 
 
 
272 aa  88.6  8e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4585  Triacylglycerol lipase  28.43 
 
 
257 aa  87.4  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0559591  normal  0.168211 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2842  lipolytic protein G-D-S-L family  28.48 
 
 
353 aa  87  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00148431  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4904  Triacylglycerol lipase  27.65 
 
 
257 aa  83.6  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5827  Triacylglycerol lipase  28.16 
 
 
266 aa  83.6  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3165  hypothetical protein  30.85 
 
 
265 aa  80.1  0.0000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0214678 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0610  hypothetical protein  26.13 
 
 
455 aa  80.1  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.457827  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7234  lipolytic protein G-D-S-L family  30.74 
 
 
270 aa  78.6  0.0000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0951  Triacylglycerol lipase  29.29 
 
 
270 aa  75.1  0.000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.105252  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0166  hypothetical protein  28.8 
 
 
367 aa  70.9  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2499  lipolytic protein G-D-S-L family  27 
 
 
272 aa  67.4  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2246  hypothetical protein  26.07 
 
 
446 aa  67  0.000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.421702  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4380  putative secreted hydrolase  25.83 
 
 
305 aa  64.3  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.784206  normal  0.181391 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3263  secreted hydrolase  28.92 
 
 
298 aa  61.2  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2154  Triacylglycerol lipase  28.52 
 
 
274 aa  60.1  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.349109 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0195  hypothetical protein  23.51 
 
 
323 aa  58.9  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4493  hypothetical protein  33.03 
 
 
308 aa  58.9  0.0000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000612564 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3869  hypothetical protein  22.87 
 
 
337 aa  55.8  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.00000000820088  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01450  hypothetical protein  25.93 
 
 
744 aa  55.8  0.000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.657991  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03570  GDSL-like Lipase/Acylhydrolase  27.78 
 
 
291 aa  54.3  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.312052  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6063  Ricin B lectin  24.56 
 
 
524 aa  53.9  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3218  secreted hydrolase  27.18 
 
 
295 aa  54.3  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0134174  normal  0.246696 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4505  hypothetical protein  26.56 
 
 
297 aa  52.8  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0494409 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4490  GDSL family lipase  24.77 
 
 
299 aa  52.4  0.00006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.14839  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1894  hypothetical protein  32.12 
 
 
413 aa  51.2  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1119  lipolytic protein G-D-S-L family  26.06 
 
 
297 aa  51.6  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00446637  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6745  hypothetical protein  22.78 
 
 
653 aa  50.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0419034  normal  0.323144 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3726  GDSL family lipase  24.53 
 
 
388 aa  49.3  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4993  hypothetical protein  26.07 
 
 
350 aa  48.9  0.0007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0116  hypothetical protein  26.33 
 
 
287 aa  48.1  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.307461  normal  0.0664489 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3058  hypothetical protein  23.46 
 
 
295 aa  47.8  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1805  hypothetical protein  27.76 
 
 
281 aa  48.1  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0114051  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2701  hypothetical protein  29.53 
 
 
353 aa  47.4  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000302317  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0117  GDSL family lipase  26.11 
 
 
304 aa  45.4  0.007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.37  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7163  hypothetical protein  22.95 
 
 
417 aa  45.4  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>