76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4796 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_4796  secreted hydrolase  100 
 
 
280 aa  567  1e-161  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.31907  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7234  lipolytic protein G-D-S-L family  74.44 
 
 
270 aa  384  1e-106  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30530  hypothetical protein  48.68 
 
 
265 aa  236  2e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.859475 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3390  hypothetical protein  44.48 
 
 
265 aa  212  5.999999999999999e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.402053  normal  0.0777437 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3165  hypothetical protein  46.21 
 
 
265 aa  202  3e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0214678 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1542  Triacylglycerol lipase  43.02 
 
 
259 aa  192  7e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.429303  normal  0.462707 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4904  Triacylglycerol lipase  43.93 
 
 
257 aa  187  2e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2499  lipolytic protein G-D-S-L family  42.24 
 
 
272 aa  181  1e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2154  Triacylglycerol lipase  40.07 
 
 
274 aa  172  5e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.349109 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4974  Triacylglycerol lipase  42.86 
 
 
261 aa  167  1e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.809775  normal  0.295048 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0951  Triacylglycerol lipase  37.64 
 
 
270 aa  163  3e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.105252  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1584  hypothetical protein  36.9 
 
 
272 aa  148  1.0000000000000001e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4585  Triacylglycerol lipase  37.8 
 
 
257 aa  137  2e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0559591  normal  0.168211 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5827  Triacylglycerol lipase  35.27 
 
 
266 aa  126  4.0000000000000003e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03570  GDSL-like Lipase/Acylhydrolase  32.26 
 
 
291 aa  117  3e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.312052  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0195  hypothetical protein  33.47 
 
 
323 aa  116  3.9999999999999997e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4380  putative secreted hydrolase  33.82 
 
 
305 aa  115  5e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.784206  normal  0.181391 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0166  hypothetical protein  31.69 
 
 
367 aa  111  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0610  hypothetical protein  31.37 
 
 
455 aa  105  7e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.457827  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3726  GDSL family lipase  32.16 
 
 
388 aa  102  6e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2842  lipolytic protein G-D-S-L family  33.46 
 
 
353 aa  101  1e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00148431  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2246  hypothetical protein  29.59 
 
 
446 aa  99.4  6e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.421702  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1119  lipolytic protein G-D-S-L family  29.45 
 
 
297 aa  97.1  3e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00446637  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3218  secreted hydrolase  31.05 
 
 
295 aa  92.8  6e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0134174  normal  0.246696 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4925  hypothetical protein  28.99 
 
 
295 aa  89  9e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3058  hypothetical protein  31.34 
 
 
295 aa  88.6  1e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3263  secreted hydrolase  29.1 
 
 
298 aa  88.6  1e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0116  hypothetical protein  28.97 
 
 
287 aa  88.6  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.307461  normal  0.0664489 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4490  GDSL family lipase  29.11 
 
 
299 aa  88.2  1e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.14839  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4505  hypothetical protein  29.32 
 
 
297 aa  85.9  7e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0494409 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3125  hypothetical protein  28.4 
 
 
304 aa  85.9  7e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0607025  normal  0.039851 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1455  hypothetical protein  28.43 
 
 
304 aa  85.5  8e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1033  hypothetical protein  28.69 
 
 
298 aa  80.5  0.00000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.468233  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4289  hypothetical protein  27.78 
 
 
281 aa  79.3  0.00000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.967227  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5000  GDSL family lipase  28.64 
 
 
304 aa  78.2  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.189373  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5073  hypothetical protein  29.23 
 
 
1349 aa  77.4  0.0000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.528473  hitchhiker  0.000168425 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1522  hypothetical protein  22.94 
 
 
289 aa  76.3  0.0000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0608193  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2886  hypothetical protein  27.5 
 
 
295 aa  75.5  0.0000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.280434  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12270  hypothetical protein  28.07 
 
 
295 aa  73.9  0.000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.57947  normal  0.510292 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3869  hypothetical protein  24.04 
 
 
337 aa  72  0.000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.00000000820088  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3694  hypothetical protein  27.27 
 
 
1357 aa  71.2  0.00000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5610  GDSL family lipase  26.62 
 
 
285 aa  70.5  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.593946  normal  0.651642 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1805  hypothetical protein  31.84 
 
 
281 aa  69.3  0.00000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0114051  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1672  GDSL-like lipase/acylhydrolase  30.13 
 
 
295 aa  67  0.0000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0117  GDSL family lipase  26.4 
 
 
304 aa  65.9  0.0000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.37  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2931  hypothetical protein  28.63 
 
 
289 aa  65.9  0.0000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.538874  normal  0.280581 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1035  hypothetical protein  24.64 
 
 
346 aa  61.6  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0174734  hitchhiker  0.00616625 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0864  hypothetical protein  27.94 
 
 
333 aa  61.2  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.159324  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0548  hypothetical protein  29.08 
 
 
253 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.675038  n/a   
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4280  hypothetical protein  27.27 
 
 
263 aa  58.2  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0194  GDSL family lipase  29.29 
 
 
253 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0560  hypothetical protein  28.35 
 
 
249 aa  53.5  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.483426 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0711  hypothetical protein  28.33 
 
 
248 aa  53.1  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0414517 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0538  hypothetical protein  27.84 
 
 
249 aa  52.4  0.000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0522  lysophospholipase L1 related esterase  24.21 
 
 
279 aa  49.3  0.00008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1801  lipolytic protein G-D-S-L family  36.14 
 
 
210 aa  48.1  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.798982  normal  0.790129 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19770  lysophospholipase L1-like esterase  32.32 
 
 
255 aa  47.8  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.057699  hitchhiker  0.000837214 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1812  lipolytic protein G-D-S-L family  27.53 
 
 
264 aa  47.8  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000302668  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5529  hypothetical protein  25.28 
 
 
309 aa  48.1  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01450  hypothetical protein  23.43 
 
 
744 aa  46.6  0.0004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.657991  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0684  lipolytic protein G-D-S-L family  32.04 
 
 
273 aa  46.6  0.0005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0974788  hitchhiker  0.0000166957 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0773  GDSL family lipase  25.88 
 
 
308 aa  45.4  0.001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1589  lipolytic protein G-D-S-L family  23.96 
 
 
264 aa  45.1  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0691726  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0263  lipolytic protein G-D-S-L family  30 
 
 
301 aa  45.4  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1326  GDSL family lipase  29.27 
 
 
287 aa  44.7  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0269  GDSL family lipase  30 
 
 
296 aa  44.3  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4155  lipolytic protein G-D-S-L family  23.14 
 
 
309 aa  44.7  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.285332  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf366  putative esterase or lipase, membrane protein  25.38 
 
 
729 aa  45.1  0.002  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000987943  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2701  hypothetical protein  25.45 
 
 
353 aa  43.9  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000302317  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21860  hypothetical protein  24.73 
 
 
354 aa  43.9  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.218372  normal  0.0328594 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31650  lysophospholipase L1-like esterase  30.77 
 
 
326 aa  43.5  0.004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6745  hypothetical protein  25.45 
 
 
653 aa  43.5  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0419034  normal  0.323144 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4413  GDSL family lipase  35.63 
 
 
266 aa  42.7  0.006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1002  putative lipase/acylhydrolase  23.33 
 
 
259 aa  42.7  0.007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1490  lipolytic protein G-D-S-L family  33.71 
 
 
264 aa  42.4  0.008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5213  hypothetical protein  29.88 
 
 
423 aa  42  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0312335  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>