57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4490 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_4490  GDSL family lipase  100 
 
 		 299 aa  589  1e-167  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.14839  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12270  hypothetical protein  44.15 
 
 		 295 aa  198  1.0000000000000001e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.57947  normal  0.510292 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1119  lipolytic protein G-D-S-L family  44.88 
 
 		 297 aa  172  7.999999999999999e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00446637  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5000  GDSL family lipase  38.31 
 
 		 304 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.189373  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1033  hypothetical protein  38.74 
 
 		 298 aa  147  3e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.468233  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03570  GDSL-like Lipase/Acylhydrolase  39.84 
 
 		 291 aa  141  9.999999999999999e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.312052  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0117  GDSL family lipase  38.24 
 
 		 304 aa  133  3e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.37  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4925  hypothetical protein  36.33 
 
 		 295 aa  134  3e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5610  GDSL family lipase  36.92 
 
 		 285 aa  133  5e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.593946  normal  0.651642 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4505  hypothetical protein  37.31 
 
 		 297 aa  132  5e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0494409 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3726  GDSL family lipase  36.57 
 
 		 388 aa  132  5e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0116  hypothetical protein  35.77 
 
 		 287 aa  132  1.0000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.307461  normal  0.0664489 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3218  secreted hydrolase  37.25 
 
 		 295 aa  127  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0134174  normal  0.246696 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4289  hypothetical protein  37.36 
 
 		 281 aa  126  5e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.967227  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0864  hypothetical protein  35.05 
 
 		 333 aa  123  4e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.159324  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1455  hypothetical protein  35.96 
 
 		 304 aa  122  8e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2886  hypothetical protein  34.11 
 
 		 295 aa  119  7.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.280434  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1805  hypothetical protein  31.37 
 
 		 281 aa  117  1.9999999999999998e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0114051  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0195  hypothetical protein  34.65 
 
 		 323 aa  110  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0548  hypothetical protein  34.77 
 
 		 253 aa  109  6e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.675038  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0538  hypothetical protein  34.65 
 
 		 249 aa  108  2e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2246  hypothetical protein  32.16 
 
 		 446 aa  107  3e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.421702  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0194  GDSL family lipase  36.23 
 
 		 253 aa  107  3e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2842  lipolytic protein G-D-S-L family  32.09 
 
 		 353 aa  105  1e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00148431  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0560  hypothetical protein  34.25 
 
 		 249 aa  105  1e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.483426 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3869  hypothetical protein  34.93 
 
 		 337 aa  105  1e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.00000000820088  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4904  Triacylglycerol lipase  34.01 
 
 		 257 aa  104  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2931  hypothetical protein  36.68 
 
 		 289 aa  102  7e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.538874  normal  0.280581 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1542  Triacylglycerol lipase  30.66 
 
 		 259 aa  100  4e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.429303  normal  0.462707 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0610  hypothetical protein  29.39 
 
 		 455 aa  97.1  3e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.457827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1522  hypothetical protein  31.64 
 
 		 289 aa  96.3  6e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0608193  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4380  putative secreted hydrolase  32.17 
 
 		 305 aa  95.5  1e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.784206  normal  0.181391 
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4280  hypothetical protein  32.43 
 
 		 263 aa  94.4  2e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3390  hypothetical protein  30.92 
 
 		 265 aa  93.2  4e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.402053  normal  0.0777437 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30530  hypothetical protein  30.6 
 
 		 265 aa  92  1e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.859475 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0711  hypothetical protein  35.56 
 
 		 248 aa  90.9  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0414517 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1035  hypothetical protein  31.69 
 
 		 346 aa  90.5  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0174734  hitchhiker  0.00616625 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2499  lipolytic protein G-D-S-L family  32.1 
 
 		 272 aa  87.4  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0683  hypothetical protein  32.7 
 
 		 256 aa  86.3  5e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4974  Triacylglycerol lipase  31.17 
 
 		 261 aa  84.3  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.809775  normal  0.295048 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4796  secreted hydrolase  28.44 
 
 		 280 aa  84.7  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.31907  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1672  GDSL-like lipase/acylhydrolase  30.8 
 
 		 295 aa  84  0.000000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3165  hypothetical protein  31.75 
 
 		 265 aa  82.8  0.000000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0214678 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0166  hypothetical protein  32.98 
 
 		 367 aa  80.9  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5827  Triacylglycerol lipase  30.71 
 
 		 266 aa  76.3  0.0000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4585  Triacylglycerol lipase  30.48 
 
 		 257 aa  76.3  0.0000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0559591  normal  0.168211 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0951  Triacylglycerol lipase  29.71 
 
 		 270 aa  75.1  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.105252  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1584  hypothetical protein  32.03 
 
 		 272 aa  73.2  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7234  lipolytic protein G-D-S-L family  27.59 
 
 		 270 aa  72.4  0.000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2154  Triacylglycerol lipase  29.55 
 
 		 274 aa  65.5  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.349109 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3263  secreted hydrolase  26.64 
 
 		 298 aa  63.2  0.000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3058  hypothetical protein  27.57 
 
 		 295 aa  57.4  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4993  hypothetical protein  30.12 
 
 		 350 aa  57.4  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3694  hypothetical protein  30.8 
 
 		 1357 aa  56.6  0.0000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5073  hypothetical protein  24.77 
 
 		 1349 aa  51.2  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.528473  hitchhiker  0.000168425 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2701  hypothetical protein  27.5 
 
 		 353 aa  46.6  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000302317  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4155  lipolytic protein G-D-S-L family  27.1 
 
 		 309 aa  45.4  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.285332  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>