84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1490 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_1490  lipolytic protein G-D-S-L family  100 
 
 
264 aa  503  1e-141  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31650  lysophospholipase L1-like esterase  55 
 
 
326 aa  255  6e-67  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0684  lipolytic protein G-D-S-L family  57.2 
 
 
273 aa  253  2.0000000000000002e-66  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0974788  hitchhiker  0.0000166957 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0811  lipolytic protein G-D-S-L family  52.07 
 
 
333 aa  248  1e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.258357  normal  0.0157392 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6531  hypothetical protein  51.95 
 
 
262 aa  246  3e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.735834  normal  0.0269756 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0855  hypothetical protein  52.02 
 
 
267 aa  239  2.9999999999999997e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.335493  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2945  lipolytic protein G-D-S-L family  54.07 
 
 
289 aa  234  2.0000000000000002e-60  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2060  lipolytic protein G-D-S-L family  51.33 
 
 
281 aa  233  3e-60  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34730  lysophospholipase L1-like esterase  47.6 
 
 
302 aa  232  5e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0437206  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19770  lysophospholipase L1-like esterase  54.03 
 
 
255 aa  231  7.000000000000001e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.057699  hitchhiker  0.000837214 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0732  lipolytic protein G-D-S-L family  51.21 
 
 
263 aa  231  8.000000000000001e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.10792  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06060  lysophospholipase L1-like esterase  50.58 
 
 
297 aa  230  2e-59  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.105705  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0386  lipolytic protein G-D-S-L family  49.6 
 
 
258 aa  227  1e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0854  hypothetical protein  52 
 
 
260 aa  227  2e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.231592  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2206  lipolytic protein G-D-S-L family  48.82 
 
 
261 aa  226  3e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.16188  normal  0.235445 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1363  lipolytic protein G-D-S-L family  48.61 
 
 
289 aa  223  3e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000348827 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0731  lipolytic protein G-D-S-L family  50.62 
 
 
265 aa  222  4e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645912  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1326  GDSL family lipase  47.83 
 
 
287 aa  221  7e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21860  GDSL-like Lipase/Acylhydrolase  50.76 
 
 
307 aa  219  3e-56  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00185801  normal  0.684974 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0269  GDSL family lipase  47.66 
 
 
296 aa  211  1e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4413  GDSL family lipase  50.2 
 
 
266 aa  210  2e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3727  lipolytic protein G-D-S-L family  46.43 
 
 
257 aa  204  1e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0072  GDSL family lipase  48.02 
 
 
294 aa  202  4e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0023  GDSL family lipase  49 
 
 
259 aa  201  9.999999999999999e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5844  lipolytic protein G-D-S-L family  46.72 
 
 
258 aa  199  3e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23280  lysophospholipase L1-like esterase  47.91 
 
 
290 aa  198  7e-50  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3925  GDSL family lipase  46.5 
 
 
253 aa  198  7.999999999999999e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0027  GDSL family lipase  46.8 
 
 
255 aa  196  2.0000000000000003e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0263  lipolytic protein G-D-S-L family  44.18 
 
 
301 aa  194  1e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4652  hypothetical protein  51 
 
 
270 aa  192  4e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0687952  normal  0.209987 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1978  hypothetical protein  44.44 
 
 
300 aa  191  1e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1065  lipolytic protein G-D-S-L family  43.43 
 
 
258 aa  189  2.9999999999999997e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.123175  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2275  lipolytic protein G-D-S-L family  44.36 
 
 
278 aa  189  2.9999999999999997e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3930  GDSL family lipase  42.42 
 
 
283 aa  184  2.0000000000000003e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2954  lipolytic protein G-D-S-L family  44.98 
 
 
319 aa  182  4.0000000000000006e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3730  lipolytic protein G-D-S-L family  42.58 
 
 
281 aa  176  4e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0254  lipolytic protein G-D-S-L family  39.85 
 
 
254 aa  157  2e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3065  lipolytic protein G-D-S-L family  39.38 
 
 
262 aa  147  2.0000000000000003e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2884  lipolytic enzyme, G-D-S-L  41.67 
 
 
258 aa  146  3e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0469503  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2928  GDSL family lipase  41.67 
 
 
256 aa  146  3e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2914  GDSL family lipase  41.67 
 
 
256 aa  146  3e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.308919 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5121  GDSL family lipase  40.32 
 
 
254 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.245752  normal  0.320087 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3183  GDSL family lipase  40.23 
 
 
256 aa  135  7.000000000000001e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.209984 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1905  lipolytic enzyme, G-D-S-L  36.96 
 
 
270 aa  107  2e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00675962  normal  0.682362 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2458  hypothetical protein  31.12 
 
 
196 aa  104  2e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.755507  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2877  hypothetical protein  30.46 
 
 
196 aa  102  8e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2589  putative lipase/acylhydrolase  30.26 
 
 
197 aa  100  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00217697  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2516  putative lipase/acylhydrolase  29.74 
 
 
197 aa  98.2  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.118211 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2501  lipase/acylhydrolase  29.74 
 
 
197 aa  98.2  1e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.125082  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2286  lipase/acylhydrolase  29.23 
 
 
211 aa  97.4  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000040763  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2242  lipase/acylhydrolase  29.23 
 
 
211 aa  96.7  3e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00129971  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2532  lipase/acylhydrolase, putative  28.72 
 
 
197 aa  94.4  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0234064  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2320  GDSL family lipase  29.08 
 
 
197 aa  92  9e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000848879  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2321  lipase/acylhydrolase  35.9 
 
 
143 aa  82  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.183981  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3278  hypothetical protein  30.43 
 
 
229 aa  80.9  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.548369 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1801  lipolytic protein G-D-S-L family  34.18 
 
 
210 aa  80.1  0.00000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.798982  normal  0.790129 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0156  lipolytic protein G-D-S-L family  33.87 
 
 
256 aa  79  0.00000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0132621  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2667  GDSL family lipase  34.36 
 
 
234 aa  72.8  0.000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.24646  hitchhiker  0.000175501 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2484  GDSL family lipase  32.82 
 
 
234 aa  67.8  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3955  GDSL family lipase  34.72 
 
 
218 aa  67.4  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00727916  normal  0.035201 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3268  lipolytic protein G-D-S-L family  34 
 
 
232 aa  62.8  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2237  GDSL family lipase  36.55 
 
 
284 aa  62.4  0.000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0161232 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2933  lipolytic enzyme, G-D-S-L  30.22 
 
 
218 aa  57.8  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.594206  normal  0.0718245 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07130  lysophospholipase L1-like esterase  31.68 
 
 
368 aa  55.8  0.0000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.39712  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21100  lysophospholipase L1-like esterase  31.34 
 
 
223 aa  52.8  0.000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0074  lipolytic protein G-D-S-L family  31.89 
 
 
249 aa  50.4  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0086  lipolytic protein G-D-S-L family  31.89 
 
 
240 aa  48.9  0.00008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0717597  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8567  hypothetical protein  29.36 
 
 
324 aa  47.4  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3153  lipolytic protein G-D-S-L family  27.88 
 
 
305 aa  47.4  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0068  lipolytic protein  32.98 
 
 
247 aa  47  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.523857  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3316  GDSL family lipase  29.84 
 
 
286 aa  46.6  0.0004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.17173  normal  0.550495 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3640  lipolytic protein G-D-S-L family  29.84 
 
 
275 aa  46.2  0.0006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.876075 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0503  lipase/acylhydrolase  35.96 
 
 
279 aa  46.2  0.0006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.833534  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0069  GDSL family lipase  29.95 
 
 
244 aa  45.8  0.0007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.074749  normal  0.034265 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0790  lipolytic protein  31.97 
 
 
318 aa  44.7  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0841274  normal  0.111603 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1047  lipolytic protein G-D-S-L family  31.38 
 
 
343 aa  44.3  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3119  lipolytic protein G-D-S-L family  31.63 
 
 
329 aa  44.7  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000200149 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4107  hypothetical protein  35.42 
 
 
312 aa  43.5  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0811428  decreased coverage  0.00630388 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0853  GDSL family lipase  33.33 
 
 
361 aa  43.5  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0761527 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2484  lipolytic protein G-D-S-L family  27.85 
 
 
265 aa  43.5  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1392  GDSL family lipase  32.39 
 
 
226 aa  43.5  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2989  GDSL family lipase  27.89 
 
 
203 aa  43.5  0.004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.816827  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0910  GDSL family lipase  34.09 
 
 
361 aa  43.1  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.526687  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3516  lipolytic protein G-D-S-L family  28.72 
 
 
275 aa  42.7  0.006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.537403  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>