55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3869 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_3869  hypothetical protein  100 
 
 		 337 aa  686    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.00000000820088  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1035  hypothetical protein  39.37 
 
 		 346 aa  204  3e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0174734  hitchhiker  0.00616625 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03570  GDSL-like Lipase/Acylhydrolase  36.43 
 
 		 291 aa  129  5.0000000000000004e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.312052  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5000  GDSL family lipase  31.18 
 
 		 304 aa  119  9e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.189373  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5610  GDSL family lipase  36.77 
 
 		 285 aa  119  9e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.593946  normal  0.651642 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2842  lipolytic protein G-D-S-L family  34.06 
 
 		 353 aa  113  5e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00148431  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4505  hypothetical protein  33.22 
 
 		 297 aa  112  8.000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0494409 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12270  hypothetical protein  33.23 
 
 		 295 aa  112  1.0000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.57947  normal  0.510292 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2931  hypothetical protein  34.15 
 
 		 289 aa  107  4e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.538874  normal  0.280581 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4490  GDSL family lipase  34.47 
 
 		 299 aa  101  2e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.14839  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3726  GDSL family lipase  29.77 
 
 		 388 aa  98.6  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1119  lipolytic protein G-D-S-L family  30.99 
 
 		 297 aa  97.1  4e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00446637  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0116  hypothetical protein  31.07 
 
 		 287 aa  95.1  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.307461  normal  0.0664489 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4925  hypothetical protein  28.86 
 
 		 295 aa  89.4  7e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2886  hypothetical protein  30.75 
 
 		 295 aa  89.4  8e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.280434  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2246  hypothetical protein  25.97 
 
 		 446 aa  89  1e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.421702  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4585  Triacylglycerol lipase  27.52 
 
 		 257 aa  88.6  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0559591  normal  0.168211 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3218  secreted hydrolase  31.12 
 
 		 295 aa  85.9  9e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0134174  normal  0.246696 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1033  hypothetical protein  29.29 
 
 		 298 aa  85.9  0.000000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.468233  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0610  hypothetical protein  25.56 
 
 		 455 aa  85.1  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.457827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0166  hypothetical protein  30.19 
 
 		 367 aa  84.3  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4974  Triacylglycerol lipase  28.11 
 
 		 261 aa  82.4  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.809775  normal  0.295048 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0117  GDSL family lipase  26.55 
 
 		 304 aa  80.5  0.00000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.37  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1805  hypothetical protein  28.67 
 
 		 281 aa  78.6  0.0000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0114051  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0951  Triacylglycerol lipase  30.39 
 
 		 270 aa  75.9  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.105252  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1522  hypothetical protein  27.53 
 
 		 289 aa  74.3  0.000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0608193  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30530  hypothetical protein  25.95 
 
 		 265 aa  70.5  0.00000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.859475 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4904  Triacylglycerol lipase  24.63 
 
 		 257 aa  70.1  0.00000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4380  putative secreted hydrolase  24.47 
 
 		 305 aa  66.6  0.0000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.784206  normal  0.181391 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4289  hypothetical protein  27.44 
 
 		 281 aa  65.5  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.967227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3390  hypothetical protein  26.32 
 
 		 265 aa  64.3  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.402053  normal  0.0777437 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0195  hypothetical protein  30.56 
 
 		 323 aa  62.8  0.000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7234  lipolytic protein G-D-S-L family  28.93 
 
 		 270 aa  62.4  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1542  Triacylglycerol lipase  24.18 
 
 		 259 aa  61.6  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.429303  normal  0.462707 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1455  hypothetical protein  26.62 
 
 		 304 aa  60.5  0.00000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2154  Triacylglycerol lipase  29.68 
 
 		 274 aa  60.5  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.349109 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3165  hypothetical protein  25.63 
 
 		 265 aa  58.2  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0214678 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1672  GDSL-like lipase/acylhydrolase  26.09 
 
 		 295 aa  58.2  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3058  hypothetical protein  26.43 
 
 		 295 aa  57.4  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0194  GDSL family lipase  29.74 
 
 		 253 aa  57.4  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0864  hypothetical protein  27.68 
 
 		 333 aa  57  0.0000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.159324  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3125  hypothetical protein  25.71 
 
 		 304 aa  57  0.0000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0607025  normal  0.039851 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2499  lipolytic protein G-D-S-L family  28.83 
 
 		 272 aa  55.8  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5073  hypothetical protein  22.87 
 
 		 1349 aa  55.8  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.528473  hitchhiker  0.000168425 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4796  secreted hydrolase  23.69 
 
 		 280 aa  53.9  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.31907  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0548  hypothetical protein  29.35 
 
 		 253 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.675038  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5827  Triacylglycerol lipase  25.62 
 
 		 266 aa  50.4  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3263  secreted hydrolase  25.13 
 
 		 298 aa  50.1  0.00006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0560  hypothetical protein  26.15 
 
 		 249 aa  49.7  0.00007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.483426 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0538  hypothetical protein  25.89 
 
 		 249 aa  49.7  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0711  hypothetical protein  27.66 
 
 		 248 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0414517 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1584  hypothetical protein  28.5 
 
 		 272 aa  48.9  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4280  hypothetical protein  23.37 
 
 		 263 aa  46.2  0.0008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0683  hypothetical protein  33.93 
 
 		 256 aa  45.8  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4993  hypothetical protein  25 
 
 		 350 aa  43.1  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>