56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5610 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_5610  GDSL family lipase  100 
 
 
285 aa  566  1e-160  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.593946  normal  0.651642 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5000  GDSL family lipase  46.56 
 
 
304 aa  218  7.999999999999999e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.189373  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4505  hypothetical protein  46.59 
 
 
297 aa  215  5e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0494409 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3218  secreted hydrolase  46.27 
 
 
295 aa  188  9e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0134174  normal  0.246696 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3726  GDSL family lipase  41.54 
 
 
388 aa  184  1.0000000000000001e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0116  hypothetical protein  42.54 
 
 
287 aa  184  2.0000000000000003e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.307461  normal  0.0664489 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1119  lipolytic protein G-D-S-L family  44.8 
 
 
297 aa  166  4e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00446637  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12270  hypothetical protein  39.12 
 
 
295 aa  164  2.0000000000000002e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.57947  normal  0.510292 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4925  hypothetical protein  42.69 
 
 
295 aa  161  1e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2931  hypothetical protein  47.22 
 
 
289 aa  158  1e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.538874  normal  0.280581 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4289  hypothetical protein  40.93 
 
 
281 aa  157  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.967227  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03570  GDSL-like Lipase/Acylhydrolase  37.41 
 
 
291 aa  152  7e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.312052  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1033  hypothetical protein  40.94 
 
 
298 aa  150  3e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.468233  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4490  GDSL family lipase  36.86 
 
 
299 aa  125  8.000000000000001e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.14839  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3869  hypothetical protein  36.77 
 
 
337 aa  119  7e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.00000000820088  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1522  hypothetical protein  33.73 
 
 
289 aa  117  1.9999999999999998e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0608193  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1035  hypothetical protein  32.43 
 
 
346 aa  115  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0174734  hitchhiker  0.00616625 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2886  hypothetical protein  32.97 
 
 
295 aa  100  3e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.280434  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1805  hypothetical protein  33.46 
 
 
281 aa  98.2  1e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0114051  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0117  GDSL family lipase  31.14 
 
 
304 aa  89.4  6e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.37  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1455  hypothetical protein  31.02 
 
 
304 aa  84.3  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4974  Triacylglycerol lipase  33.47 
 
 
261 aa  84.7  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.809775  normal  0.295048 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2842  lipolytic protein G-D-S-L family  34.27 
 
 
353 aa  83.2  0.000000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00148431  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1672  GDSL-like lipase/acylhydrolase  32.33 
 
 
295 aa  81.6  0.00000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0166  hypothetical protein  30.14 
 
 
367 aa  80.9  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3125  hypothetical protein  30.99 
 
 
304 aa  80.9  0.00000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0607025  normal  0.039851 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0610  hypothetical protein  28.64 
 
 
455 aa  78.6  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.457827  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3390  hypothetical protein  30.66 
 
 
265 aa  78.6  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.402053  normal  0.0777437 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0548  hypothetical protein  33.73 
 
 
253 aa  78.6  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.675038  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0864  hypothetical protein  36.16 
 
 
333 aa  77.4  0.0000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.159324  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0538  hypothetical protein  33.6 
 
 
249 aa  75.9  0.0000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0194  GDSL family lipase  32.2 
 
 
253 aa  75.9  0.0000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0711  hypothetical protein  34.68 
 
 
248 aa  75.1  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0414517 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2246  hypothetical protein  29.03 
 
 
446 aa  74.7  0.000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.421702  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0560  hypothetical protein  33.2 
 
 
249 aa  72.8  0.000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.483426 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2499  lipolytic protein G-D-S-L family  32.79 
 
 
272 aa  72.4  0.000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0195  hypothetical protein  29.28 
 
 
323 aa  71.6  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1542  Triacylglycerol lipase  28.29 
 
 
259 aa  70.9  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.429303  normal  0.462707 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4585  Triacylglycerol lipase  30.53 
 
 
257 aa  70.9  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0559591  normal  0.168211 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3165  hypothetical protein  34.85 
 
 
265 aa  69.7  0.00000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0214678 
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4280  hypothetical protein  30.97 
 
 
263 aa  68.2  0.0000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7234  lipolytic protein G-D-S-L family  28.85 
 
 
270 aa  67.4  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4796  secreted hydrolase  26.55 
 
 
280 aa  64.3  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.31907  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30530  hypothetical protein  27.02 
 
 
265 aa  63.2  0.000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.859475 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4904  Triacylglycerol lipase  32.39 
 
 
257 aa  63.2  0.000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0951  Triacylglycerol lipase  30.12 
 
 
270 aa  63.2  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.105252  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0683  hypothetical protein  31.54 
 
 
256 aa  56.2  0.0000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4380  putative secreted hydrolase  26.36 
 
 
305 aa  53.9  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.784206  normal  0.181391 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5827  Triacylglycerol lipase  25.97 
 
 
266 aa  52.4  0.000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1584  hypothetical protein  32.09 
 
 
272 aa  50.4  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3263  secreted hydrolase  22.83 
 
 
298 aa  46.6  0.0004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5446  hypothetical protein  26.17 
 
 
475 aa  45.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.231631  normal  0.382515 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2154  Triacylglycerol lipase  29.25 
 
 
274 aa  45.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.349109 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3694  hypothetical protein  26.09 
 
 
1357 aa  44.3  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01450  hypothetical protein  26.75 
 
 
744 aa  43.1  0.005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.657991  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3058  hypothetical protein  31.55 
 
 
295 aa  42.7  0.007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>