50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0864 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_0864  hypothetical protein  100 
 
 		 333 aa  650    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.159324  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2886  hypothetical protein  40.71 
 
 		 295 aa  147  2.0000000000000003e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.280434  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1455  hypothetical protein  37.73 
 
 		 304 aa  141  9.999999999999999e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1805  hypothetical protein  37.11 
 
 		 281 aa  139  7.999999999999999e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0114051  n/a   
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4280  hypothetical protein  38.78 
 
 		 263 aa  129  1.0000000000000001e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0548  hypothetical protein  40.08 
 
 		 253 aa  128  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.675038  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0683  hypothetical protein  42.41 
 
 		 256 aa  123  4e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0560  hypothetical protein  39.92 
 
 		 249 aa  121  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.483426 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0538  hypothetical protein  39.92 
 
 		 249 aa  121  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0194  GDSL family lipase  38.61 
 
 		 253 aa  116  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4490  GDSL family lipase  34.59 
 
 		 299 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.14839  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03570  GDSL-like Lipase/Acylhydrolase  31.66 
 
 		 291 aa  99.4  8e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.312052  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5000  GDSL family lipase  32.75 
 
 		 304 aa  99.4  8e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.189373  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4585  Triacylglycerol lipase  31.45 
 
 		 257 aa  97.8  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0559591  normal  0.168211 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0711  hypothetical protein  38.8 
 
 		 248 aa  97.4  3e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0414517 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1033  hypothetical protein  34.88 
 
 		 298 aa  94.4  3e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.468233  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1522  hypothetical protein  29.59 
 
 		 289 aa  90.5  4e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0608193  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1119  lipolytic protein G-D-S-L family  32.69 
 
 		 297 aa  90.1  5e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00446637  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12270  hypothetical protein  29.66 
 
 		 295 aa  87  4e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.57947  normal  0.510292 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0117  GDSL family lipase  31 
 
 		 304 aa  86.3  6e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.37  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4925  hypothetical protein  32.95 
 
 		 295 aa  85.9  9e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4904  Triacylglycerol lipase  31.12 
 
 		 257 aa  82.4  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3218  secreted hydrolase  32.05 
 
 		 295 aa  81.6  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0134174  normal  0.246696 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4974  Triacylglycerol lipase  30.8 
 
 		 261 aa  80.9  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.809775  normal  0.295048 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1672  GDSL-like lipase/acylhydrolase  29.81 
 
 		 295 aa  80.1  0.00000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5610  GDSL family lipase  31.7 
 
 		 285 aa  78.6  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.593946  normal  0.651642 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5827  Triacylglycerol lipase  31.85 
 
 		 266 aa  77.8  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4505  hypothetical protein  29.5 
 
 		 297 aa  76.6  0.0000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0494409 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1542  Triacylglycerol lipase  29.03 
 
 		 259 aa  75.5  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.429303  normal  0.462707 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0116  hypothetical protein  29.06 
 
 		 287 aa  74.3  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.307461  normal  0.0664489 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3726  GDSL family lipase  29.75 
 
 		 388 aa  73.9  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2842  lipolytic protein G-D-S-L family  30.79 
 
 		 353 aa  73.6  0.000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00148431  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2246  hypothetical protein  26.71 
 
 		 446 aa  72.8  0.000000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.421702  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1584  hypothetical protein  33.6 
 
 		 272 aa  72.4  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0951  Triacylglycerol lipase  29.22 
 
 		 270 aa  70.9  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.105252  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2499  lipolytic protein G-D-S-L family  30.35 
 
 		 272 aa  70.5  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0610  hypothetical protein  26.84 
 
 		 455 aa  69.7  0.00000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.457827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3390  hypothetical protein  28.15 
 
 		 265 aa  69.3  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.402053  normal  0.0777437 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4289  hypothetical protein  29.07 
 
 		 281 aa  68.6  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.967227  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2931  hypothetical protein  32.6 
 
 		 289 aa  67  0.0000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.538874  normal  0.280581 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0166  hypothetical protein  29.05 
 
 		 367 aa  64.3  0.000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0195  hypothetical protein  27.86 
 
 		 323 aa  63.9  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3869  hypothetical protein  27.68 
 
 		 337 aa  64.3  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.00000000820088  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30530  hypothetical protein  28.05 
 
 		 265 aa  63.5  0.000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.859475 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4796  secreted hydrolase  29.65 
 
 		 280 aa  62.8  0.000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.31907  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4380  putative secreted hydrolase  28.52 
 
 		 305 aa  62  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.784206  normal  0.181391 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3165  hypothetical protein  28.33 
 
 		 265 aa  60.5  0.00000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0214678 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7234  lipolytic protein G-D-S-L family  29.2 
 
 		 270 aa  58.9  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5446  hypothetical protein  29.36 
 
 		 475 aa  56.2  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.231631  normal  0.382515 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3058  hypothetical protein  27.07 
 
 		 295 aa  53.5  0.000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>