20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5446 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_5446  hypothetical protein  100 
 
 		 475 aa  947    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.231631  normal  0.382515 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0951  Triacylglycerol lipase  28.27 
 
 		 270 aa  82  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.105252  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03570  GDSL-like Lipase/Acylhydrolase  28.52 
 
 		 291 aa  68.6  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.312052  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4380  putative secreted hydrolase  29.46 
 
 		 305 aa  62.8  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.784206  normal  0.181391 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2246  hypothetical protein  23.45 
 
 		 446 aa  59.3  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.421702  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0195  hypothetical protein  27.95 
 
 		 323 aa  58.9  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2842  lipolytic protein G-D-S-L family  25.84 
 
 		 353 aa  57.4  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00148431  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4585  Triacylglycerol lipase  25.93 
 
 		 257 aa  55.8  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0559591  normal  0.168211 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4925  hypothetical protein  29.55 
 
 		 295 aa  53.1  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0864  hypothetical protein  29.36 
 
 		 333 aa  50.4  0.00007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.159324  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0166  hypothetical protein  26.06 
 
 		 367 aa  50.1  0.00009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0117  GDSL family lipase  23.22 
 
 		 304 aa  49.7  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.37  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4904  Triacylglycerol lipase  24.69 
 
 		 257 aa  49.7  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3058  hypothetical protein  29.09 
 
 		 295 aa  49.7  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1805  hypothetical protein  24.35 
 
 		 281 aa  48.9  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0114051  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1542  Triacylglycerol lipase  23.72 
 
 		 259 aa  48.1  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.429303  normal  0.462707 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2886  hypothetical protein  25.33 
 
 		 295 aa  46.6  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.280434  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1033  hypothetical protein  27.67 
 
 		 298 aa  45.8  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.468233  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5610  GDSL family lipase  25.78 
 
 		 285 aa  45.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.593946  normal  0.651642 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4993  hypothetical protein  23.63 
 
 		 350 aa  44.3  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>