54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4925 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_4925  hypothetical protein  100 
 
 		 295 aa  586  1e-166  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3218  secreted hydrolase  58.89 
 
 		 295 aa  288  9e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0134174  normal  0.246696 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0116  hypothetical protein  45.59 
 
 		 287 aa  216  5e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.307461  normal  0.0664489 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4289  hypothetical protein  43.85 
 
 		 281 aa  192  4e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.967227  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5000  GDSL family lipase  38.85 
 
 		 304 aa  162  5.0000000000000005e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.189373  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5610  GDSL family lipase  42.69 
 
 		 285 aa  160  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.593946  normal  0.651642 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4505  hypothetical protein  40.96 
 
 		 297 aa  155  6e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0494409 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1033  hypothetical protein  39.31 
 
 		 298 aa  152  5.9999999999999996e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.468233  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03570  GDSL-like Lipase/Acylhydrolase  37.37 
 
 		 291 aa  152  7e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.312052  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12270  hypothetical protein  37.37 
 
 		 295 aa  149  7e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.57947  normal  0.510292 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2931  hypothetical protein  42.13 
 
 		 289 aa  146  4.0000000000000006e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.538874  normal  0.280581 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3726  GDSL family lipase  34.3 
 
 		 388 aa  144  2e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1119  lipolytic protein G-D-S-L family  38.4 
 
 		 297 aa  142  5e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00446637  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4490  GDSL family lipase  38.33 
 
 		 299 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.14839  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1522  hypothetical protein  32.27 
 
 		 289 aa  120  1.9999999999999998e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0608193  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1805  hypothetical protein  36.21 
 
 		 281 aa  112  6e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0114051  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0117  GDSL family lipase  33.6 
 
 		 304 aa  104  2e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.37  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2886  hypothetical protein  32.39 
 
 		 295 aa  102  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.280434  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0548  hypothetical protein  36.84 
 
 		 253 aa  100  2e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.675038  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0538  hypothetical protein  35.98 
 
 		 249 aa  98.2  1e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0560  hypothetical protein  36.36 
 
 		 249 aa  97.8  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.483426 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1455  hypothetical protein  32.92 
 
 		 304 aa  97.1  3e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4585  Triacylglycerol lipase  29.82 
 
 		 257 aa  93.6  3e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0559591  normal  0.168211 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30530  hypothetical protein  28.31 
 
 		 265 aa  92.8  6e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.859475 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3869  hypothetical protein  28.74 
 
 		 337 aa  92.4  9e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.00000000820088  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1035  hypothetical protein  27.22 
 
 		 346 aa  89  8e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0174734  hitchhiker  0.00616625 
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4280  hypothetical protein  33.21 
 
 		 263 aa  88.2  2e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0194  GDSL family lipase  36.33 
 
 		 253 aa  86.7  4e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1542  Triacylglycerol lipase  28.63 
 
 		 259 aa  85.1  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.429303  normal  0.462707 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5827  Triacylglycerol lipase  29.93 
 
 		 266 aa  84.7  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4796  secreted hydrolase  29.71 
 
 		 280 aa  84  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.31907  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2154  Triacylglycerol lipase  32.14 
 
 		 274 aa  83.2  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.349109 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4974  Triacylglycerol lipase  30.77 
 
 		 261 aa  82.8  0.000000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.809775  normal  0.295048 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2842  lipolytic protein G-D-S-L family  31.14 
 
 		 353 aa  82.4  0.000000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00148431  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0951  Triacylglycerol lipase  28.87 
 
 		 270 aa  81.6  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.105252  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1584  hypothetical protein  33.21 
 
 		 272 aa  80.5  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3390  hypothetical protein  31.85 
 
 		 265 aa  80.5  0.00000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.402053  normal  0.0777437 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4904  Triacylglycerol lipase  30.4 
 
 		 257 aa  77.8  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0864  hypothetical protein  32.95 
 
 		 333 aa  76.3  0.0000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.159324  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0711  hypothetical protein  35.71 
 
 		 248 aa  75.9  0.0000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0414517 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0195  hypothetical protein  28.63 
 
 		 323 aa  75.5  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4380  putative secreted hydrolase  31.18 
 
 		 305 aa  74.3  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.784206  normal  0.181391 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7234  lipolytic protein G-D-S-L family  27.39 
 
 		 270 aa  74.3  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2246  hypothetical protein  27.08 
 
 		 446 aa  74.7  0.000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.421702  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0610  hypothetical protein  26.2 
 
 		 455 aa  72.8  0.000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.457827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3165  hypothetical protein  32.97 
 
 		 265 aa  72  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0214678 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2499  lipolytic protein G-D-S-L family  28.35 
 
 		 272 aa  72  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0166  hypothetical protein  29.31 
 
 		 367 aa  67.8  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0683  hypothetical protein  34.77 
 
 		 256 aa  64.7  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3125  hypothetical protein  29.06 
 
 		 304 aa  56.6  0.0000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0607025  normal  0.039851 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1672  GDSL-like lipase/acylhydrolase  27.17 
 
 		 295 aa  56.6  0.0000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3263  secreted hydrolase  28.49 
 
 		 298 aa  55.5  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5446  hypothetical protein  29.84 
 
 		 475 aa  52.8  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.231631  normal  0.382515 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01450  hypothetical protein  26.92 
 
 		 744 aa  47.8  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.657991  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>