53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2886 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_2886  hypothetical protein  100 
 
 		 295 aa  597  1e-170  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.280434  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1455  hypothetical protein  40.08 
 
 		 304 aa  168  8e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0194  GDSL family lipase  44.05 
 
 		 253 aa  159  7e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1805  hypothetical protein  40.5 
 
 		 281 aa  156  3e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0114051  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0711  hypothetical protein  43.62 
 
 		 248 aa  149  7e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0414517 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0548  hypothetical protein  41.87 
 
 		 253 aa  142  7e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.675038  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0560  hypothetical protein  41.39 
 
 		 249 aa  138  1e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.483426 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0538  hypothetical protein  41.39 
 
 		 249 aa  137  2e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0864  hypothetical protein  40.71 
 
 		 333 aa  136  4e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.159324  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3726  GDSL family lipase  33.82 
 
 		 388 aa  124  2e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0683  hypothetical protein  38.85 
 
 		 256 aa  124  2e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1119  lipolytic protein G-D-S-L family  35.63 
 
 		 297 aa  123  3e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00446637  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1033  hypothetical protein  33.6 
 
 		 298 aa  117  1.9999999999999998e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.468233  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4490  GDSL family lipase  33.2 
 
 		 299 aa  112  8.000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.14839  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03570  GDSL-like Lipase/Acylhydrolase  31.12 
 
 		 291 aa  110  3e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.312052  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12270  hypothetical protein  30.53 
 
 		 295 aa  108  1e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.57947  normal  0.510292 
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4280  hypothetical protein  32.81 
 
 		 263 aa  107  2e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4289  hypothetical protein  32.46 
 
 		 281 aa  102  8e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.967227  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5000  GDSL family lipase  29.88 
 
 		 304 aa  100  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.189373  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4925  hypothetical protein  32.82 
 
 		 295 aa  100  3e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4505  hypothetical protein  32.45 
 
 		 297 aa  100  4e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0494409 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5610  GDSL family lipase  33.21 
 
 		 285 aa  99.4  6e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.593946  normal  0.651642 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3218  secreted hydrolase  35.02 
 
 		 295 aa  98.6  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0134174  normal  0.246696 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0116  hypothetical protein  31.2 
 
 		 287 aa  95.9  7e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.307461  normal  0.0664489 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4974  Triacylglycerol lipase  31.54 
 
 		 261 aa  95.5  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.809775  normal  0.295048 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0117  GDSL family lipase  30.86 
 
 		 304 aa  93.2  5e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.37  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3869  hypothetical protein  30.75 
 
 		 337 aa  89.4  6e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.00000000820088  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4585  Triacylglycerol lipase  28.67 
 
 		 257 aa  87.8  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0559591  normal  0.168211 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1542  Triacylglycerol lipase  31.4 
 
 		 259 aa  86.3  6e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.429303  normal  0.462707 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4904  Triacylglycerol lipase  31.67 
 
 		 257 aa  84.3  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1522  hypothetical protein  30.12 
 
 		 289 aa  84  0.000000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0608193  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0951  Triacylglycerol lipase  30 
 
 		 270 aa  81.3  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.105252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3390  hypothetical protein  30.83 
 
 		 265 aa  79  0.00000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.402053  normal  0.0777437 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1584  hypothetical protein  31.67 
 
 		 272 aa  79  0.00000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0195  hypothetical protein  29.13 
 
 		 323 aa  78.2  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2931  hypothetical protein  32.41 
 
 		 289 aa  78.2  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.538874  normal  0.280581 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0166  hypothetical protein  31.03 
 
 		 367 aa  74.7  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4380  putative secreted hydrolase  27.17 
 
 		 305 aa  72  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.784206  normal  0.181391 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30530  hypothetical protein  26.52 
 
 		 265 aa  70.5  0.00000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.859475 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2246  hypothetical protein  27.34 
 
 		 446 aa  70.1  0.00000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.421702  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1035  hypothetical protein  26.3 
 
 		 346 aa  69.7  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0174734  hitchhiker  0.00616625 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3165  hypothetical protein  30.19 
 
 		 265 aa  68.6  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0214678 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5827  Triacylglycerol lipase  26.4 
 
 		 266 aa  67.8  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7234  lipolytic protein G-D-S-L family  28.98 
 
 		 270 aa  65.9  0.0000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2842  lipolytic protein G-D-S-L family  29.74 
 
 		 353 aa  63.5  0.000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00148431  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0610  hypothetical protein  25.66 
 
 		 455 aa  63.5  0.000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.457827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2154  Triacylglycerol lipase  27.24 
 
 		 274 aa  62  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.349109 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2499  lipolytic protein G-D-S-L family  28.22 
 
 		 272 aa  62  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4796  secreted hydrolase  27.14 
 
 		 280 aa  60.8  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.31907  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3125  hypothetical protein  30.43 
 
 		 304 aa  59.7  0.00000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0607025  normal  0.039851 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5446  hypothetical protein  25.33 
 
 		 475 aa  46.6  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.231631  normal  0.382515 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3263  secreted hydrolase  24.24 
 
 		 298 aa  44.3  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3058  hypothetical protein  26.6 
 
 		 295 aa  43.5  0.005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>