60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2246 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_2246  hypothetical protein  100 
 
 		 446 aa  912    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.421702  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0610  hypothetical protein  47.74 
 
 		 455 aa  342  8e-93  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.457827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2842  lipolytic protein G-D-S-L family  40.62 
 
 		 353 aa  238  1e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00148431  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0951  Triacylglycerol lipase  35.94 
 
 		 270 aa  119  1.9999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.105252  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4904  Triacylglycerol lipase  33.33 
 
 		 257 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1542  Triacylglycerol lipase  32.05 
 
 		 259 aa  108  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.429303  normal  0.462707 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4585  Triacylglycerol lipase  30.3 
 
 		 257 aa  106  7e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0559591  normal  0.168211 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4505  hypothetical protein  30.98 
 
 		 297 aa  105  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0494409 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30530  hypothetical protein  33.46 
 
 		 265 aa  105  2e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.859475 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0166  hypothetical protein  31.03 
 
 		 367 aa  105  2e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5827  Triacylglycerol lipase  32.86 
 
 		 266 aa  104  3e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3263  secreted hydrolase  28.77 
 
 		 298 aa  104  4e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4974  Triacylglycerol lipase  31.64 
 
 		 261 aa  103  5e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.809775  normal  0.295048 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3390  hypothetical protein  32.6 
 
 		 265 aa  102  2e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.402053  normal  0.0777437 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3726  GDSL family lipase  31.42 
 
 		 388 aa  101  3e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12270  hypothetical protein  30.82 
 
 		 295 aa  99.8  8e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.57947  normal  0.510292 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4289  hypothetical protein  31.82 
 
 		 281 aa  99  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.967227  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03570  GDSL-like Lipase/Acylhydrolase  28.47 
 
 		 291 aa  97.8  4e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.312052  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7234  lipolytic protein G-D-S-L family  31.6 
 
 		 270 aa  97.1  6e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4490  GDSL family lipase  33.06 
 
 		 299 aa  97.1  7e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.14839  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4380  putative secreted hydrolase  30.94 
 
 		 305 aa  95.1  2e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.784206  normal  0.181391 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0117  GDSL family lipase  30.08 
 
 		 304 aa  94.7  3e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.37  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3165  hypothetical protein  33.7 
 
 		 265 aa  93.6  6e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0214678 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3058  hypothetical protein  27.57 
 
 		 295 aa  93.6  6e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5000  GDSL family lipase  29.89 
 
 		 304 aa  91.7  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.189373  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3694  hypothetical protein  28.53 
 
 		 1357 aa  90.1  6e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1584  hypothetical protein  33.07 
 
 		 272 aa  89.7  9e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3869  hypothetical protein  25.97 
 
 		 337 aa  89.7  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.00000000820088  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0195  hypothetical protein  30.42 
 
 		 323 aa  89.4  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2499  lipolytic protein G-D-S-L family  29.57 
 
 		 272 aa  86.3  9e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0116  hypothetical protein  28.17 
 
 		 287 aa  84.7  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.307461  normal  0.0664489 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1805  hypothetical protein  26.42 
 
 		 281 aa  82  0.00000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0114051  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1035  hypothetical protein  27.41 
 
 		 346 aa  80.5  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0174734  hitchhiker  0.00616625 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4796  secreted hydrolase  27.19 
 
 		 280 aa  79  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.31907  normal  1 
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4280  hypothetical protein  27.21 
 
 		 263 aa  78.6  0.0000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4925  hypothetical protein  27.08 
 
 		 295 aa  75.1  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5610  GDSL family lipase  28.71 
 
 		 285 aa  73.9  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.593946  normal  0.651642 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0548  hypothetical protein  28.52 
 
 		 253 aa  73.9  0.000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.675038  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3218  secreted hydrolase  27.02 
 
 		 295 aa  73.9  0.000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0134174  normal  0.246696 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0560  hypothetical protein  28.25 
 
 		 249 aa  71.6  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.483426 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0538  hypothetical protein  28.25 
 
 		 249 aa  71.2  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1119  lipolytic protein G-D-S-L family  29.23 
 
 		 297 aa  70.9  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00446637  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0194  GDSL family lipase  28.83 
 
 		 253 aa  70.5  0.00000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2886  hypothetical protein  27.34 
 
 		 295 aa  70.1  0.00000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.280434  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1033  hypothetical protein  27.04 
 
 		 298 aa  69.3  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.468233  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2154  Triacylglycerol lipase  32.2 
 
 		 274 aa  68.2  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.349109 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5073  hypothetical protein  26.07 
 
 		 1349 aa  67  0.0000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.528473  hitchhiker  0.000168425 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1455  hypothetical protein  25.95 
 
 		 304 aa  65.5  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1522  hypothetical protein  27.86 
 
 		 289 aa  65.5  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0608193  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0864  hypothetical protein  26.71 
 
 		 333 aa  65.9  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.159324  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2931  hypothetical protein  29.75 
 
 		 289 aa  64.7  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.538874  normal  0.280581 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01450  hypothetical protein  24.5 
 
 		 744 aa  60.5  0.00000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.657991  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0711  hypothetical protein  29.26 
 
 		 248 aa  60.5  0.00000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0414517 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5446  hypothetical protein  23.45 
 
 		 475 aa  59.3  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.231631  normal  0.382515 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6745  hypothetical protein  24.2 
 
 		 653 aa  57.4  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0419034  normal  0.323144 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4993  hypothetical protein  26.74 
 
 		 350 aa  53.5  0.000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3125  hypothetical protein  27.12 
 
 		 304 aa  50.1  0.00009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0607025  normal  0.039851 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1672  GDSL-like lipase/acylhydrolase  25.86 
 
 		 295 aa  46.6  0.0008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4155  lipolytic protein G-D-S-L family  26.3 
 
 		 309 aa  46.6  0.0009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.285332  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6063  Ricin B lectin  23.67 
 
 		 524 aa  45.1  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>