52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5827 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_5827  Triacylglycerol lipase  100 
 
 
266 aa  540  9.999999999999999e-153  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4585  Triacylglycerol lipase  42.19 
 
 
257 aa  179  2.9999999999999997e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0559591  normal  0.168211 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1542  Triacylglycerol lipase  42.54 
 
 
259 aa  170  2e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.429303  normal  0.462707 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30530  hypothetical protein  41.8 
 
 
265 aa  163  3e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.859475 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3390  hypothetical protein  40.71 
 
 
265 aa  155  9e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.402053  normal  0.0777437 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4974  Triacylglycerol lipase  40.27 
 
 
261 aa  154  1e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.809775  normal  0.295048 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1584  hypothetical protein  42.79 
 
 
272 aa  152  7e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3165  hypothetical protein  38.34 
 
 
265 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0214678 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0951  Triacylglycerol lipase  35.63 
 
 
270 aa  142  6e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.105252  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4904  Triacylglycerol lipase  37.62 
 
 
257 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7234  lipolytic protein G-D-S-L family  37.17 
 
 
270 aa  122  8e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2499  lipolytic protein G-D-S-L family  35.87 
 
 
272 aa  116  3e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2154  Triacylglycerol lipase  32.08 
 
 
274 aa  112  9e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.349109 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2246  hypothetical protein  32.86 
 
 
446 aa  105  1e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.421702  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4796  secreted hydrolase  30.19 
 
 
280 aa  102  8e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.31907  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2842  lipolytic protein G-D-S-L family  32.57 
 
 
353 aa  96.7  3e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00148431  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0610  hypothetical protein  33.07 
 
 
455 aa  91.7  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.457827  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3263  secreted hydrolase  31.62 
 
 
298 aa  87.8  1e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0195  hypothetical protein  28.57 
 
 
323 aa  84.7  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5073  hypothetical protein  28.16 
 
 
1349 aa  84  0.000000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.528473  hitchhiker  0.000168425 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4925  hypothetical protein  29.93 
 
 
295 aa  83.2  0.000000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4380  putative secreted hydrolase  29.76 
 
 
305 aa  79.7  0.00000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.784206  normal  0.181391 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0166  hypothetical protein  30.88 
 
 
367 aa  73.2  0.000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0864  hypothetical protein  32.26 
 
 
333 aa  71.2  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.159324  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2886  hypothetical protein  26.21 
 
 
295 aa  70.1  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.280434  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3058  hypothetical protein  30.21 
 
 
295 aa  69.3  0.00000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4490  GDSL family lipase  30.31 
 
 
299 aa  69.3  0.00000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.14839  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03570  GDSL-like Lipase/Acylhydrolase  25.78 
 
 
291 aa  67.4  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.312052  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3726  GDSL family lipase  28.41 
 
 
388 aa  65.9  0.0000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1455  hypothetical protein  28.52 
 
 
304 aa  64.7  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4280  hypothetical protein  29.88 
 
 
263 aa  62  0.000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4993  hypothetical protein  25.86 
 
 
350 aa  61.2  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1805  hypothetical protein  26.94 
 
 
281 aa  60.5  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0114051  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0117  GDSL family lipase  26.1 
 
 
304 aa  58.9  0.00000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.37  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5000  GDSL family lipase  26.51 
 
 
304 aa  58.2  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.189373  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3218  secreted hydrolase  27.27 
 
 
295 aa  58.2  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0134174  normal  0.246696 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12270  hypothetical protein  25.51 
 
 
295 aa  57.4  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.57947  normal  0.510292 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3694  hypothetical protein  29.66 
 
 
1357 aa  56.6  0.0000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3125  hypothetical protein  27.7 
 
 
304 aa  55.5  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0607025  normal  0.039851 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5610  GDSL family lipase  25.97 
 
 
285 aa  52.4  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.593946  normal  0.651642 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1119  lipolytic protein G-D-S-L family  26.59 
 
 
297 aa  52  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00446637  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3869  hypothetical protein  24.92 
 
 
337 aa  51.6  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.00000000820088  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1035  hypothetical protein  25 
 
 
346 aa  48.5  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0174734  hitchhiker  0.00616625 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1033  hypothetical protein  24.7 
 
 
298 aa  48.1  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.468233  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21860  hypothetical protein  25.96 
 
 
354 aa  48.1  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.218372  normal  0.0328594 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4505  hypothetical protein  25.2 
 
 
297 aa  46.6  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0494409 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0194  GDSL family lipase  27.6 
 
 
253 aa  46.2  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2931  hypothetical protein  25.3 
 
 
289 aa  44.3  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.538874  normal  0.280581 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4289  hypothetical protein  24 
 
 
281 aa  44.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.967227  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6745  hypothetical protein  24.27 
 
 
653 aa  43.5  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0419034  normal  0.323144 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0116  hypothetical protein  24.51 
 
 
287 aa  42.7  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.307461  normal  0.0664489 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1672  GDSL-like lipase/acylhydrolase  24.31 
 
 
295 aa  42.4  0.009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>