45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1672 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_1672  GDSL-like lipase/acylhydrolase  100 
 
 		 295 aa  603  9.999999999999999e-173  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03570  GDSL-like Lipase/Acylhydrolase  32.32 
 
 		 291 aa  101  2e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.312052  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5610  GDSL family lipase  32.33 
 
 		 285 aa  82.4  0.000000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.593946  normal  0.651642 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5000  GDSL family lipase  28.52 
 
 		 304 aa  78.6  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.189373  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4490  GDSL family lipase  30.4 
 
 		 299 aa  76.6  0.0000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.14839  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3726  GDSL family lipase  28.67 
 
 		 388 aa  73.2  0.000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0864  hypothetical protein  29.93 
 
 		 333 aa  72  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.159324  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2842  lipolytic protein G-D-S-L family  28.88 
 
 		 353 aa  65.1  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00148431  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0951  Triacylglycerol lipase  32.13 
 
 		 270 aa  65.1  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.105252  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1805  hypothetical protein  28.41 
 
 		 281 aa  64.3  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0114051  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4380  putative secreted hydrolase  30.09 
 
 		 305 aa  63.5  0.000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.784206  normal  0.181391 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4585  Triacylglycerol lipase  27.65 
 
 		 257 aa  60.8  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0559591  normal  0.168211 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1033  hypothetical protein  26.2 
 
 		 298 aa  61.2  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.468233  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7234  lipolytic protein G-D-S-L family  28.85 
 
 		 270 aa  60.8  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0548  hypothetical protein  30.04 
 
 		 253 aa  60.1  0.00000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.675038  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4505  hypothetical protein  26.6 
 
 		 297 aa  60.1  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0494409 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3869  hypothetical protein  26.09 
 
 		 337 aa  58.2  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.00000000820088  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1119  lipolytic protein G-D-S-L family  27.23 
 
 		 297 aa  57.8  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00446637  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4925  hypothetical protein  27.17 
 
 		 295 aa  57  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4904  Triacylglycerol lipase  26.1 
 
 		 257 aa  57.4  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4796  secreted hydrolase  29.55 
 
 		 280 aa  56.2  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.31907  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0560  hypothetical protein  29.52 
 
 		 249 aa  55.8  0.0000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.483426 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0538  hypothetical protein  29.52 
 
 		 249 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1455  hypothetical protein  27.72 
 
 		 304 aa  55.1  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0116  hypothetical protein  24.91 
 
 		 287 aa  55.1  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.307461  normal  0.0664489 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4289  hypothetical protein  33.13 
 
 		 281 aa  54.7  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.967227  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12270  hypothetical protein  29.76 
 
 		 295 aa  53.9  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.57947  normal  0.510292 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30530  hypothetical protein  24.1 
 
 		 265 aa  53.9  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.859475 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2931  hypothetical protein  34.15 
 
 		 289 aa  53.5  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.538874  normal  0.280581 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0117  GDSL family lipase  27.24 
 
 		 304 aa  53.1  0.000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.37  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3218  secreted hydrolase  29.38 
 
 		 295 aa  52.8  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0134174  normal  0.246696 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0166  hypothetical protein  26.16 
 
 		 367 aa  52.8  0.000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3390  hypothetical protein  30 
 
 		 265 aa  50.1  0.00005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.402053  normal  0.0777437 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4974  Triacylglycerol lipase  28.85 
 
 		 261 aa  49.7  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.809775  normal  0.295048 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1522  hypothetical protein  29.31 
 
 		 289 aa  48.5  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0608193  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1542  Triacylglycerol lipase  29.56 
 
 		 259 aa  48.1  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.429303  normal  0.462707 
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4280  hypothetical protein  32.3 
 
 		 263 aa  47  0.0004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2246  hypothetical protein  25.86 
 
 		 446 aa  46.6  0.0005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.421702  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1035  hypothetical protein  23.85 
 
 		 346 aa  45.4  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0174734  hitchhiker  0.00616625 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2499  lipolytic protein G-D-S-L family  31.68 
 
 		 272 aa  44.3  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2154  Triacylglycerol lipase  26.69 
 
 		 274 aa  43.5  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.349109 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3263  secreted hydrolase  27.9 
 
 		 298 aa  43.9  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0195  hypothetical protein  27.98 
 
 		 323 aa  42.7  0.008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5827  Triacylglycerol lipase  24.31 
 
 		 266 aa  42.7  0.008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1584  hypothetical protein  30.11 
 
 		 272 aa  42.4  0.01  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>