56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0610 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_0610  hypothetical protein  100 
 
 		 455 aa  907    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.457827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2246  hypothetical protein  47.01 
 
 		 446 aa  344  2e-93  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.421702  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2842  lipolytic protein G-D-S-L family  39.63 
 
 		 353 aa  215  9.999999999999999e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00148431  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1542  Triacylglycerol lipase  34.38 
 
 		 259 aa  121  1.9999999999999998e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.429303  normal  0.462707 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0166  hypothetical protein  32.18 
 
 		 367 aa  110  7.000000000000001e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30530  hypothetical protein  32.68 
 
 		 265 aa  108  2e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.859475 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03570  GDSL-like Lipase/Acylhydrolase  30.47 
 
 		 291 aa  106  7e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.312052  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4974  Triacylglycerol lipase  32.44 
 
 		 261 aa  103  7e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.809775  normal  0.295048 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4505  hypothetical protein  28.21 
 
 		 297 aa  99.4  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0494409 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7234  lipolytic protein G-D-S-L family  32.3 
 
 		 270 aa  99.4  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4904  Triacylglycerol lipase  31.76 
 
 		 257 aa  98.6  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0951  Triacylglycerol lipase  31.23 
 
 		 270 aa  97.8  4e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.105252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3726  GDSL family lipase  29.23 
 
 		 388 aa  97.4  5e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3390  hypothetical protein  39.75 
 
 		 265 aa  96.7  7e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.402053  normal  0.0777437 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4585  Triacylglycerol lipase  31.58 
 
 		 257 aa  96.3  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0559591  normal  0.168211 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12270  hypothetical protein  31.75 
 
 		 295 aa  95.5  2e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.57947  normal  0.510292 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3694  hypothetical protein  28.72 
 
 		 1357 aa  93.6  7e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5827  Triacylglycerol lipase  33.07 
 
 		 266 aa  90.9  4e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3165  hypothetical protein  34.91 
 
 		 265 aa  90.9  4e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0214678 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4490  GDSL family lipase  29.75 
 
 		 299 aa  89.7  8e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.14839  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1584  hypothetical protein  30.69 
 
 		 272 aa  89.4  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0195  hypothetical protein  29.04 
 
 		 323 aa  87.8  4e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4380  putative secreted hydrolase  28.41 
 
 		 305 aa  85.9  0.000000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.784206  normal  0.181391 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3869  hypothetical protein  25.56 
 
 		 337 aa  85.1  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.00000000820088  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1035  hypothetical protein  29.11 
 
 		 346 aa  85.1  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0174734  hitchhiker  0.00616625 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5000  GDSL family lipase  29.39 
 
 		 304 aa  84.3  0.000000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.189373  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3263  secreted hydrolase  25.81 
 
 		 298 aa  84  0.000000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4289  hypothetical protein  27.11 
 
 		 281 aa  82  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.967227  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2154  Triacylglycerol lipase  31.84 
 
 		 274 aa  82  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.349109 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3218  secreted hydrolase  28.07 
 
 		 295 aa  81.3  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0134174  normal  0.246696 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0116  hypothetical protein  27.64 
 
 		 287 aa  80.5  0.00000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.307461  normal  0.0664489 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4796  secreted hydrolase  28.38 
 
 		 280 aa  79.7  0.00000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.31907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5073  hypothetical protein  26.13 
 
 		 1349 aa  79.3  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.528473  hitchhiker  0.000168425 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5610  GDSL family lipase  24.91 
 
 		 285 aa  78.6  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.593946  normal  0.651642 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2499  lipolytic protein G-D-S-L family  33.33 
 
 		 272 aa  73.9  0.000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3058  hypothetical protein  25.09 
 
 		 295 aa  72.8  0.00000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1805  hypothetical protein  31.65 
 
 		 281 aa  71.6  0.00000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0114051  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4925  hypothetical protein  26.2 
 
 		 295 aa  72.4  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1119  lipolytic protein G-D-S-L family  27.07 
 
 		 297 aa  69.7  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00446637  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0117  GDSL family lipase  25.9 
 
 		 304 aa  69.3  0.0000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.37  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2931  hypothetical protein  26.52 
 
 		 289 aa  68.6  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.538874  normal  0.280581 
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4280  hypothetical protein  27.6 
 
 		 263 aa  67.8  0.0000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0194  GDSL family lipase  33.33 
 
 		 253 aa  66.2  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0864  hypothetical protein  26.84 
 
 		 333 aa  64.7  0.000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.159324  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0548  hypothetical protein  29.1 
 
 		 253 aa  63.5  0.000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.675038  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2886  hypothetical protein  25.66 
 
 		 295 aa  63.2  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.280434  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0711  hypothetical protein  33.14 
 
 		 248 aa  62  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0414517 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1522  hypothetical protein  26.11 
 
 		 289 aa  62  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0608193  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1033  hypothetical protein  27.04 
 
 		 298 aa  60.5  0.00000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.468233  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0560  hypothetical protein  28.57 
 
 		 249 aa  59.7  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.483426 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1455  hypothetical protein  28.18 
 
 		 304 aa  59.3  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0538  hypothetical protein  28.57 
 
 		 249 aa  59.3  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3125  hypothetical protein  29.66 
 
 		 304 aa  57.4  0.0000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0607025  normal  0.039851 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6063  Ricin B lectin  25.41 
 
 		 524 aa  56.6  0.0000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01450  hypothetical protein  24.14 
 
 		 744 aa  54.3  0.000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.657991  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0503  lipase/acylhydrolase  26.67 
 
 		 279 aa  50.1  0.00009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.833534  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>