54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_0116 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_0116  hypothetical protein  100 
 
 
287 aa  584  1e-166  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.307461  normal  0.0664489 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4289  hypothetical protein  47.39 
 
 
281 aa  218  7e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.967227  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3218  secreted hydrolase  46.27 
 
 
295 aa  218  7e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0134174  normal  0.246696 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4925  hypothetical protein  46.69 
 
 
295 aa  215  8e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5610  GDSL family lipase  42.32 
 
 
285 aa  182  5.0000000000000004e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.593946  normal  0.651642 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03570  GDSL-like Lipase/Acylhydrolase  40.47 
 
 
291 aa  170  2e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.312052  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4505  hypothetical protein  41.41 
 
 
297 aa  162  4.0000000000000004e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0494409 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5000  GDSL family lipase  37.02 
 
 
304 aa  159  6e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.189373  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12270  hypothetical protein  38.7 
 
 
295 aa  157  2e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.57947  normal  0.510292 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3726  GDSL family lipase  37.59 
 
 
388 aa  145  8.000000000000001e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1119  lipolytic protein G-D-S-L family  37.45 
 
 
297 aa  142  4e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00446637  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2931  hypothetical protein  37.83 
 
 
289 aa  132  9e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.538874  normal  0.280581 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4490  GDSL family lipase  35.45 
 
 
299 aa  123  3e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.14839  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1033  hypothetical protein  33.46 
 
 
298 aa  116  6e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.468233  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1035  hypothetical protein  30.27 
 
 
346 aa  105  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0174734  hitchhiker  0.00616625 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1455  hypothetical protein  33.46 
 
 
304 aa  102  1e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2886  hypothetical protein  30.45 
 
 
295 aa  96.3  5e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.280434  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3869  hypothetical protein  31.43 
 
 
337 aa  95.1  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.00000000820088  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1522  hypothetical protein  27.24 
 
 
289 aa  93.6  3e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0608193  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1805  hypothetical protein  31.48 
 
 
281 aa  91.7  1e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0114051  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0548  hypothetical protein  33.71 
 
 
253 aa  86.7  4e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.675038  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0117  GDSL family lipase  29.74 
 
 
304 aa  85.1  0.000000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.37  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2246  hypothetical protein  28.17 
 
 
446 aa  85.1  0.000000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.421702  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4585  Triacylglycerol lipase  28.97 
 
 
257 aa  84.7  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0559591  normal  0.168211 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0560  hypothetical protein  33.46 
 
 
249 aa  82  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.483426 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7234  lipolytic protein G-D-S-L family  29.55 
 
 
270 aa  81.3  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0538  hypothetical protein  32.58 
 
 
249 aa  81.3  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0610  hypothetical protein  27.64 
 
 
455 aa  80.5  0.00000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.457827  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0166  hypothetical protein  27.03 
 
 
367 aa  80.9  0.00000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4796  secreted hydrolase  28.83 
 
 
280 aa  80.1  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.31907  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0194  GDSL family lipase  32.21 
 
 
253 aa  78.6  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4280  hypothetical protein  28.63 
 
 
263 aa  77  0.0000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0711  hypothetical protein  34.66 
 
 
248 aa  77  0.0000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0414517 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2154  Triacylglycerol lipase  29.64 
 
 
274 aa  75.5  0.0000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.349109 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2842  lipolytic protein G-D-S-L family  27.64 
 
 
353 aa  75.5  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00148431  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0951  Triacylglycerol lipase  29.67 
 
 
270 aa  74.7  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.105252  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1542  Triacylglycerol lipase  26.94 
 
 
259 aa  72.4  0.000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.429303  normal  0.462707 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0195  hypothetical protein  26.64 
 
 
323 aa  71.6  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4380  putative secreted hydrolase  28.29 
 
 
305 aa  71.2  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.784206  normal  0.181391 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30530  hypothetical protein  28.16 
 
 
265 aa  69.3  0.00000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.859475 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4904  Triacylglycerol lipase  28.63 
 
 
257 aa  68.6  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0864  hypothetical protein  33.33 
 
 
333 aa  67.8  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.159324  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4974  Triacylglycerol lipase  28.74 
 
 
261 aa  67.4  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.809775  normal  0.295048 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3390  hypothetical protein  32.64 
 
 
265 aa  67  0.0000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.402053  normal  0.0777437 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2499  lipolytic protein G-D-S-L family  28.69 
 
 
272 aa  62.8  0.000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0683  hypothetical protein  28.89 
 
 
256 aa  60.8  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3165  hypothetical protein  32.5 
 
 
265 aa  58.9  0.00000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0214678 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3125  hypothetical protein  30.29 
 
 
304 aa  58.2  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0607025  normal  0.039851 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1672  GDSL-like lipase/acylhydrolase  24.91 
 
 
295 aa  55.5  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1584  hypothetical protein  28.14 
 
 
272 aa  52  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5073  hypothetical protein  26.33 
 
 
1349 aa  47.4  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.528473  hitchhiker  0.000168425 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3058  hypothetical protein  27.96 
 
 
295 aa  45.1  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01450  hypothetical protein  24.89 
 
 
744 aa  43.5  0.004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.657991  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5827  Triacylglycerol lipase  24.81 
 
 
266 aa  43.1  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>