51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_0548 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_0548  hypothetical protein  100 
 
 		 253 aa  496  1e-139  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.675038  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0560  hypothetical protein  99.6 
 
 		 249 aa  486  1e-136  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.483426 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0538  hypothetical protein  99.2 
 
 		 249 aa  483  1e-135  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0194  GDSL family lipase  66.8 
 
 		 253 aa  311  5.999999999999999e-84  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0711  hypothetical protein  68.07 
 
 		 248 aa  290  1e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0414517 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1805  hypothetical protein  41.94 
 
 		 281 aa  164  9e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0114051  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1455  hypothetical protein  40.84 
 
 		 304 aa  154  9e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4280  hypothetical protein  42.53 
 
 		 263 aa  144  1e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2886  hypothetical protein  41.87 
 
 		 295 aa  142  6e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.280434  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0683  hypothetical protein  42.86 
 
 		 256 aa  122  7e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0864  hypothetical protein  40.08 
 
 		 333 aa  116  3.9999999999999997e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.159324  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1033  hypothetical protein  35.74 
 
 		 298 aa  115  5e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.468233  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4490  GDSL family lipase  35.37 
 
 		 299 aa  105  7e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.14839  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4925  hypothetical protein  36.84 
 
 		 295 aa  100  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3726  GDSL family lipase  34.06 
 
 		 388 aa  96.3  4e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1119  lipolytic protein G-D-S-L family  34.69 
 
 		 297 aa  94.4  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00446637  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4289  hypothetical protein  34.7 
 
 		 281 aa  94.4  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.967227  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5000  GDSL family lipase  33.07 
 
 		 304 aa  92.4  5e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.189373  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03570  GDSL-like Lipase/Acylhydrolase  35.27 
 
 		 291 aa  92.4  6e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.312052  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0116  hypothetical protein  33.71 
 
 		 287 aa  87  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.307461  normal  0.0664489 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3218  secreted hydrolase  36.26 
 
 		 295 aa  86.7  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0134174  normal  0.246696 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12270  hypothetical protein  34.94 
 
 		 295 aa  86.7  4e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.57947  normal  0.510292 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4505  hypothetical protein  32.1 
 
 		 297 aa  81.6  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0494409 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5610  GDSL family lipase  33.73 
 
 		 285 aa  78.6  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.593946  normal  0.651642 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2842  lipolytic protein G-D-S-L family  31.58 
 
 		 353 aa  76.3  0.0000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00148431  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30530  hypothetical protein  29.11 
 
 		 265 aa  74.7  0.000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.859475 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0166  hypothetical protein  30.66 
 
 		 367 aa  73.9  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2246  hypothetical protein  28.52 
 
 		 446 aa  73.9  0.000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.421702  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0117  GDSL family lipase  30.26 
 
 		 304 aa  71.6  0.00000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.37  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0195  hypothetical protein  29.08 
 
 		 323 aa  68.2  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0951  Triacylglycerol lipase  27.85 
 
 		 270 aa  67.8  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.105252  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4380  putative secreted hydrolase  28.46 
 
 		 305 aa  66.2  0.0000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.784206  normal  0.181391 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4585  Triacylglycerol lipase  28.69 
 
 		 257 aa  66.2  0.0000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0559591  normal  0.168211 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2931  hypothetical protein  31.58 
 
 		 289 aa  63.5  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.538874  normal  0.280581 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0610  hypothetical protein  29.1 
 
 		 455 aa  63.5  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.457827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4974  Triacylglycerol lipase  31.09 
 
 		 261 aa  61.2  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.809775  normal  0.295048 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1672  GDSL-like lipase/acylhydrolase  30.04 
 
 		 295 aa  60.1  0.00000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2499  lipolytic protein G-D-S-L family  31.58 
 
 		 272 aa  56.6  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1522  hypothetical protein  28.9 
 
 		 289 aa  54.7  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0608193  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3390  hypothetical protein  31.58 
 
 		 265 aa  53.9  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.402053  normal  0.0777437 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3869  hypothetical protein  29.35 
 
 		 337 aa  52.4  0.000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.00000000820088  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4796  secreted hydrolase  28.67 
 
 		 280 aa  51.2  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.31907  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1542  Triacylglycerol lipase  28.15 
 
 		 259 aa  50.4  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.429303  normal  0.462707 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4904  Triacylglycerol lipase  25.74 
 
 		 257 aa  50.8  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3694  hypothetical protein  34.23 
 
 		 1357 aa  50.1  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7234  lipolytic protein G-D-S-L family  30.97 
 
 		 270 aa  50.4  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4155  lipolytic protein G-D-S-L family  37.38 
 
 		 309 aa  47.8  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.285332  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1584  hypothetical protein  29.53 
 
 		 272 aa  45.4  0.0008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3058  hypothetical protein  27.84 
 
 		 295 aa  45.1  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01450  hypothetical protein  21.39 
 
 		 744 aa  42.7  0.006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.657991  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5827  Triacylglycerol lipase  26.94 
 
 		 266 aa  42  0.01  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>