42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0683 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_0683  hypothetical protein  100 
 
 		 256 aa  493  1e-139  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4280  hypothetical protein  52.57 
 
 		 263 aa  208  7e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0548  hypothetical protein  42.86 
 
 		 253 aa  139  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.675038  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0560  hypothetical protein  42.86 
 
 		 249 aa  139  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.483426 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0538  hypothetical protein  42.86 
 
 		 249 aa  139  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1805  hypothetical protein  41.89 
 
 		 281 aa  134  1.9999999999999998e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0114051  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2886  hypothetical protein  38.85 
 
 		 295 aa  132  3.9999999999999996e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.280434  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0864  hypothetical protein  42.41 
 
 		 333 aa  128  8.000000000000001e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.159324  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0194  GDSL family lipase  40.32 
 
 		 253 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1455  hypothetical protein  36.23 
 
 		 304 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0711  hypothetical protein  39.84 
 
 		 248 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0414517 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4490  GDSL family lipase  32.11 
 
 		 299 aa  95.1  9e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.14839  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1119  lipolytic protein G-D-S-L family  33.07 
 
 		 297 aa  84.3  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00446637  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0117  GDSL family lipase  30.74 
 
 		 304 aa  80.1  0.00000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.37  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12270  hypothetical protein  31.3 
 
 		 295 aa  78.2  0.0000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.57947  normal  0.510292 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03570  GDSL-like Lipase/Acylhydrolase  32.33 
 
 		 291 aa  77  0.0000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.312052  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1033  hypothetical protein  32.05 
 
 		 298 aa  74.7  0.000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.468233  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4925  hypothetical protein  34.77 
 
 		 295 aa  75.1  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0116  hypothetical protein  28.89 
 
 		 287 aa  74.3  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.307461  normal  0.0664489 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4505  hypothetical protein  30.56 
 
 		 297 aa  70.9  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0494409 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3218  secreted hydrolase  30.77 
 
 		 295 aa  70.9  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0134174  normal  0.246696 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4289  hypothetical protein  30.74 
 
 		 281 aa  69.3  0.00000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.967227  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5610  GDSL family lipase  32.69 
 
 		 285 aa  68.9  0.00000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.593946  normal  0.651642 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5000  GDSL family lipase  28.73 
 
 		 304 aa  66.2  0.0000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.189373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0195  hypothetical protein  26.44 
 
 		 323 aa  64.7  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2842  lipolytic protein G-D-S-L family  28.47 
 
 		 353 aa  63.9  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00148431  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1522  hypothetical protein  27.03 
 
 		 289 aa  63.5  0.000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0608193  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3058  hypothetical protein  27.65 
 
 		 295 aa  60.8  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4380  putative secreted hydrolase  26.52 
 
 		 305 aa  60.1  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.784206  normal  0.181391 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3869  hypothetical protein  26.62 
 
 		 337 aa  52.8  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.00000000820088  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4974  Triacylglycerol lipase  25.91 
 
 		 261 aa  52.8  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.809775  normal  0.295048 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2931  hypothetical protein  41.05 
 
 		 289 aa  52.8  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.538874  normal  0.280581 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2246  hypothetical protein  24.47 
 
 		 446 aa  51.2  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.421702  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4796  secreted hydrolase  26.22 
 
 		 280 aa  50.4  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.31907  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2499  lipolytic protein G-D-S-L family  25.93 
 
 		 272 aa  48.9  0.00008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4585  Triacylglycerol lipase  23.01 
 
 		 257 aa  48.5  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0559591  normal  0.168211 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0951  Triacylglycerol lipase  26.02 
 
 		 270 aa  47.8  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.105252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3726  GDSL family lipase  40 
 
 		 388 aa  47  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1672  GDSL-like lipase/acylhydrolase  27.86 
 
 		 295 aa  47  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1542  Triacylglycerol lipase  24.07 
 
 		 259 aa  46.6  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.429303  normal  0.462707 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1584  hypothetical protein  29.13 
 
 		 272 aa  43.5  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3263  secreted hydrolase  27.84 
 
 		 298 aa  42.7  0.005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>