50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_0560 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008705  Mkms_0560  hypothetical protein  100 
 
 
249 aa  487  1e-137  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.483426 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0548  hypothetical protein  99.6 
 
 
253 aa  486  1e-136  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.675038  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0538  hypothetical protein  99.6 
 
 
249 aa  485  1e-136  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0194  GDSL family lipase  66.27 
 
 
253 aa  303  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0711  hypothetical protein  68.49 
 
 
248 aa  292  4e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0414517 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1805  hypothetical protein  41.06 
 
 
281 aa  158  1e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0114051  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1455  hypothetical protein  40.23 
 
 
304 aa  150  2e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4280  hypothetical protein  42.53 
 
 
263 aa  144  1e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2886  hypothetical protein  41.39 
 
 
295 aa  138  1e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.280434  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0683  hypothetical protein  42.86 
 
 
256 aa  121  9e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1033  hypothetical protein  35.38 
 
 
298 aa  112  8.000000000000001e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.468233  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0864  hypothetical protein  39.92 
 
 
333 aa  109  4.0000000000000004e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.159324  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4490  GDSL family lipase  34.8 
 
 
299 aa  100  2e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.14839  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4925  hypothetical protein  36.74 
 
 
295 aa  97.8  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3726  GDSL family lipase  33.45 
 
 
388 aa  92  7e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4289  hypothetical protein  34.08 
 
 
281 aa  90.5  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.967227  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1119  lipolytic protein G-D-S-L family  34.02 
 
 
297 aa  90.1  3e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00446637  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5000  GDSL family lipase  32.41 
 
 
304 aa  88.6  8e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.189373  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03570  GDSL-like Lipase/Acylhydrolase  34.77 
 
 
291 aa  88.2  1e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.312052  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3218  secreted hydrolase  35.63 
 
 
295 aa  82.8  0.000000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0134174  normal  0.246696 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0116  hypothetical protein  32.58 
 
 
287 aa  82  0.000000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.307461  normal  0.0664489 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12270  hypothetical protein  34.21 
 
 
295 aa  80.9  0.00000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.57947  normal  0.510292 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4505  hypothetical protein  31.34 
 
 
297 aa  74.3  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0494409 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5610  GDSL family lipase  33.2 
 
 
285 aa  73.2  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.593946  normal  0.651642 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2842  lipolytic protein G-D-S-L family  30.94 
 
 
353 aa  72.4  0.000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00148431  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2246  hypothetical protein  28.25 
 
 
446 aa  71.6  0.00000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.421702  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30530  hypothetical protein  28.51 
 
 
265 aa  70.5  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.859475 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0195  hypothetical protein  29.08 
 
 
323 aa  68.2  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0166  hypothetical protein  29.82 
 
 
367 aa  67.4  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0117  GDSL family lipase  29.63 
 
 
304 aa  67.4  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.37  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4380  putative secreted hydrolase  28.46 
 
 
305 aa  66.2  0.0000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.784206  normal  0.181391 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0951  Triacylglycerol lipase  27.23 
 
 
270 aa  64.7  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.105252  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4585  Triacylglycerol lipase  28.33 
 
 
257 aa  61.2  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0559591  normal  0.168211 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0610  hypothetical protein  28.57 
 
 
455 aa  59.7  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.457827  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2931  hypothetical protein  30.94 
 
 
289 aa  59.7  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.538874  normal  0.280581 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4974  Triacylglycerol lipase  30.51 
 
 
261 aa  56.2  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.809775  normal  0.295048 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1672  GDSL-like lipase/acylhydrolase  29.52 
 
 
295 aa  55.8  0.0000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2499  lipolytic protein G-D-S-L family  31.02 
 
 
272 aa  51.2  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1522  hypothetical protein  28.24 
 
 
289 aa  50.4  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0608193  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4796  secreted hydrolase  28.67 
 
 
280 aa  51.2  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.31907  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3694  hypothetical protein  34.23 
 
 
1357 aa  50.1  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3390  hypothetical protein  30.67 
 
 
265 aa  49.7  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.402053  normal  0.0777437 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3869  hypothetical protein  29.51 
 
 
337 aa  49.7  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.00000000820088  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4904  Triacylglycerol lipase  25.6 
 
 
257 aa  47  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1542  Triacylglycerol lipase  27.43 
 
 
259 aa  46.6  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.429303  normal  0.462707 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7234  lipolytic protein G-D-S-L family  30.07 
 
 
270 aa  46.2  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1584  hypothetical protein  29.76 
 
 
272 aa  45.4  0.0009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3058  hypothetical protein  27.84 
 
 
295 aa  45.1  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4155  lipolytic protein G-D-S-L family  35.85 
 
 
309 aa  43.1  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.285332  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01450  hypothetical protein  21.39 
 
 
744 aa  42.7  0.005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.657991  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>