71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7234 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_7234  lipolytic protein G-D-S-L family  100 
 
 
270 aa  540  9.999999999999999e-153  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4796  secreted hydrolase  75.29 
 
 
280 aa  365  1e-100  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.31907  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30530  hypothetical protein  51.13 
 
 
265 aa  229  3e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.859475 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3390  hypothetical protein  49.45 
 
 
265 aa  208  6e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.402053  normal  0.0777437 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1542  Triacylglycerol lipase  46.06 
 
 
259 aa  201  9.999999999999999e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.429303  normal  0.462707 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4904  Triacylglycerol lipase  45.83 
 
 
257 aa  186  3e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3165  hypothetical protein  48.86 
 
 
265 aa  184  2.0000000000000003e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0214678 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2499  lipolytic protein G-D-S-L family  44.4 
 
 
272 aa  181  1e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4974  Triacylglycerol lipase  45.38 
 
 
261 aa  175  7e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.809775  normal  0.295048 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2154  Triacylglycerol lipase  42.68 
 
 
274 aa  166  4e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.349109 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0951  Triacylglycerol lipase  42.06 
 
 
270 aa  156  4e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.105252  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1584  hypothetical protein  38.52 
 
 
272 aa  147  1.0000000000000001e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4585  Triacylglycerol lipase  38.98 
 
 
257 aa  141  9.999999999999999e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0559591  normal  0.168211 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5827  Triacylglycerol lipase  36.67 
 
 
266 aa  127  3e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03570  GDSL-like Lipase/Acylhydrolase  32.93 
 
 
291 aa  114  2.0000000000000002e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.312052  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0195  hypothetical protein  33.05 
 
 
323 aa  114  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0166  hypothetical protein  33.96 
 
 
367 aa  106  4e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2842  lipolytic protein G-D-S-L family  36.72 
 
 
353 aa  103  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00148431  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4380  putative secreted hydrolase  32.7 
 
 
305 aa  102  9e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.784206  normal  0.181391 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2246  hypothetical protein  31.23 
 
 
446 aa  101  1e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.421702  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0610  hypothetical protein  32.3 
 
 
455 aa  100  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.457827  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3726  GDSL family lipase  31.52 
 
 
388 aa  97.1  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3263  secreted hydrolase  31.52 
 
 
298 aa  94  3e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3218  secreted hydrolase  32.11 
 
 
295 aa  90.1  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0134174  normal  0.246696 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1119  lipolytic protein G-D-S-L family  28.8 
 
 
297 aa  87.8  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00446637  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0116  hypothetical protein  29.55 
 
 
287 aa  84.7  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.307461  normal  0.0664489 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3058  hypothetical protein  29.96 
 
 
295 aa  81.3  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4505  hypothetical protein  31.1 
 
 
297 aa  81.3  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0494409 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5073  hypothetical protein  30.74 
 
 
1349 aa  80.5  0.00000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.528473  hitchhiker  0.000168425 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4289  hypothetical protein  29.01 
 
 
281 aa  80.1  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.967227  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5000  GDSL family lipase  28.4 
 
 
304 aa  80.1  0.00000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.189373  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3125  hypothetical protein  28.62 
 
 
304 aa  79.7  0.00000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0607025  normal  0.039851 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4925  hypothetical protein  27.39 
 
 
295 aa  77.4  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3694  hypothetical protein  28.62 
 
 
1357 aa  77.4  0.0000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12270  hypothetical protein  27.8 
 
 
295 aa  74.3  0.000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.57947  normal  0.510292 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1522  hypothetical protein  23.73 
 
 
289 aa  73.6  0.000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0608193  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1033  hypothetical protein  28.23 
 
 
298 aa  73.2  0.000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.468233  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4490  GDSL family lipase  27.64 
 
 
299 aa  71.6  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.14839  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1455  hypothetical protein  27.45 
 
 
304 aa  71.2  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5610  GDSL family lipase  28.84 
 
 
285 aa  70.5  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.593946  normal  0.651642 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2886  hypothetical protein  29.43 
 
 
295 aa  70.5  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.280434  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1035  hypothetical protein  26.71 
 
 
346 aa  66.6  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0174734  hitchhiker  0.00616625 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3869  hypothetical protein  28.71 
 
 
337 aa  64.7  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.00000000820088  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1672  GDSL-like lipase/acylhydrolase  28.85 
 
 
295 aa  60.8  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2931  hypothetical protein  30.2 
 
 
289 aa  61.2  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.538874  normal  0.280581 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1805  hypothetical protein  33.55 
 
 
281 aa  60.5  0.00000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0114051  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0117  GDSL family lipase  27.92 
 
 
304 aa  59.3  0.00000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.37  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0864  hypothetical protein  29.2 
 
 
333 aa  58.5  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.159324  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4155  lipolytic protein G-D-S-L family  28.37 
 
 
309 aa  58.9  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.285332  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0194  GDSL family lipase  39.18 
 
 
253 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0548  hypothetical protein  30.46 
 
 
253 aa  53.9  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.675038  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0711  hypothetical protein  31.97 
 
 
248 aa  53.1  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0414517 
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4280  hypothetical protein  28.63 
 
 
263 aa  53.1  0.000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6745  hypothetical protein  25.93 
 
 
653 aa  49.7  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0419034  normal  0.323144 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0560  hypothetical protein  29.74 
 
 
249 aa  49.3  0.00007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.483426 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0538  hypothetical protein  29.59 
 
 
249 aa  48.9  0.00008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0254  lipolytic protein G-D-S-L family  28.97 
 
 
254 aa  45.8  0.0007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0263  lipolytic protein G-D-S-L family  29.09 
 
 
301 aa  45.1  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19770  lysophospholipase L1-like esterase  29.25 
 
 
255 aa  45.1  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.057699  hitchhiker  0.000837214 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0854  hypothetical protein  26.92 
 
 
260 aa  44.3  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.231592  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0269  GDSL family lipase  29.03 
 
 
296 aa  44.7  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06060  lysophospholipase L1-like esterase  27.54 
 
 
297 aa  43.5  0.003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.105705  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21100  lysophospholipase L1-like esterase  29.57 
 
 
223 aa  43.9  0.003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0684  lipolytic protein G-D-S-L family  34.78 
 
 
273 aa  43.9  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0974788  hitchhiker  0.0000166957 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2286  hypothetical protein  36.84 
 
 
239 aa  43.5  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.419706  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0503  lipase/acylhydrolase  27.7 
 
 
279 aa  43.1  0.005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.833534  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3930  GDSL family lipase  30.12 
 
 
283 aa  43.1  0.005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1655  hypothetical protein  26.63 
 
 
667 aa  42.7  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.656688  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4413  GDSL family lipase  34.88 
 
 
266 aa  42.7  0.006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31650  lysophospholipase L1-like esterase  29.17 
 
 
326 aa  42.7  0.006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4993  hypothetical protein  24.14 
 
 
350 aa  42.4  0.008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>