78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0254 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_0254  lipolytic protein G-D-S-L family  100 
 
 
254 aa  512  1e-144  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3065  lipolytic protein G-D-S-L family  55.83 
 
 
262 aa  256  2e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0023  GDSL family lipase  41.04 
 
 
259 aa  177  1e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4413  GDSL family lipase  43.08 
 
 
266 aa  174  9.999999999999999e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0027  GDSL family lipase  40.31 
 
 
255 aa  172  2.9999999999999996e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0854  hypothetical protein  40.62 
 
 
260 aa  169  4e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.231592  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19770  lysophospholipase L1-like esterase  41.41 
 
 
255 aa  169  6e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.057699  hitchhiker  0.000837214 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2060  lipolytic protein G-D-S-L family  39.2 
 
 
281 aa  163  3e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31650  lysophospholipase L1-like esterase  40.23 
 
 
326 aa  157  2e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34730  lysophospholipase L1-like esterase  36.8 
 
 
302 aa  156  4e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0437206  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1978  hypothetical protein  36.36 
 
 
300 aa  154  2e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2206  lipolytic protein G-D-S-L family  36.05 
 
 
261 aa  152  2.9999999999999998e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.16188  normal  0.235445 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5844  lipolytic protein G-D-S-L family  37.35 
 
 
258 aa  153  2.9999999999999998e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0731  lipolytic protein G-D-S-L family  38.67 
 
 
265 aa  152  4e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645912  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0684  lipolytic protein G-D-S-L family  40 
 
 
273 aa  151  1e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0974788  hitchhiker  0.0000166957 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2954  lipolytic protein G-D-S-L family  40.48 
 
 
319 aa  151  1e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3727  lipolytic protein G-D-S-L family  38.62 
 
 
257 aa  150  2e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1363  lipolytic protein G-D-S-L family  37.88 
 
 
289 aa  149  3e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000348827 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3730  lipolytic protein G-D-S-L family  38.67 
 
 
281 aa  149  4e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3925  GDSL family lipase  40.66 
 
 
253 aa  148  9e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3930  GDSL family lipase  39.22 
 
 
283 aa  146  3e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0855  hypothetical protein  38.89 
 
 
267 aa  146  4.0000000000000006e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.335493  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6531  hypothetical protein  36.22 
 
 
262 aa  145  6e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.735834  normal  0.0269756 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1490  lipolytic protein G-D-S-L family  39.38 
 
 
264 aa  145  7.0000000000000006e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0732  lipolytic protein G-D-S-L family  37.45 
 
 
263 aa  143  2e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.10792  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0386  lipolytic protein G-D-S-L family  34.92 
 
 
258 aa  143  2e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1326  GDSL family lipase  38 
 
 
287 aa  142  4e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2275  lipolytic protein G-D-S-L family  36.78 
 
 
278 aa  140  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0263  lipolytic protein G-D-S-L family  37.14 
 
 
301 aa  139  3e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1065  lipolytic protein G-D-S-L family  38.46 
 
 
258 aa  137  2e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.123175  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06060  lysophospholipase L1-like esterase  37.65 
 
 
297 aa  134  9.999999999999999e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.105705  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21860  GDSL-like Lipase/Acylhydrolase  35.38 
 
 
307 aa  131  9e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00185801  normal  0.684974 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0269  GDSL family lipase  33.74 
 
 
296 aa  131  1.0000000000000001e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0072  GDSL family lipase  36.33 
 
 
294 aa  131  1.0000000000000001e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0811  lipolytic protein G-D-S-L family  35.93 
 
 
333 aa  129  5.0000000000000004e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.258357  normal  0.0157392 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23280  lysophospholipase L1-like esterase  35.21 
 
 
290 aa  129  6e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2945  lipolytic protein G-D-S-L family  33.59 
 
 
289 aa  125  7e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4652  hypothetical protein  35.06 
 
 
270 aa  120  3e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0687952  normal  0.209987 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2914  GDSL family lipase  33.33 
 
 
256 aa  119  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.308919 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2928  GDSL family lipase  33.33 
 
 
256 aa  119  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2884  lipolytic enzyme, G-D-S-L  33.47 
 
 
258 aa  119  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0469503  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5121  GDSL family lipase  35.29 
 
 
254 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.245752  normal  0.320087 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2458  hypothetical protein  32.47 
 
 
196 aa  112  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.755507  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2877  hypothetical protein  32.31 
 
 
196 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2286  lipase/acylhydrolase  31.96 
 
 
211 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000040763  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3183  GDSL family lipase  30.16 
 
 
256 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.209984 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2516  putative lipase/acylhydrolase  31.44 
 
 
197 aa  110  3e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.118211 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2501  lipase/acylhydrolase  31.44 
 
 
197 aa  110  3e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.125082  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2589  putative lipase/acylhydrolase  31.96 
 
 
197 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00217697  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2242  lipase/acylhydrolase  31.44 
 
 
211 aa  109  5e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00129971  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2320  GDSL family lipase  32.49 
 
 
197 aa  106  4e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000848879  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2532  lipase/acylhydrolase, putative  31.98 
 
 
197 aa  105  8e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0234064  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1801  lipolytic protein G-D-S-L family  33.16 
 
 
210 aa  87.8  1e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.798982  normal  0.790129 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2321  lipase/acylhydrolase  34.65 
 
 
143 aa  82.4  0.000000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.183981  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1905  lipolytic enzyme, G-D-S-L  31.68 
 
 
270 aa  80.9  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00675962  normal  0.682362 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2933  lipolytic enzyme, G-D-S-L  28.06 
 
 
218 aa  64.3  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.594206  normal  0.0718245 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3278  hypothetical protein  27.32 
 
 
229 aa  57.4  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.548369 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0156  lipolytic protein G-D-S-L family  27.51 
 
 
256 aa  57  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0132621  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07130  lysophospholipase L1-like esterase  28.37 
 
 
368 aa  53.5  0.000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.39712  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3268  lipolytic protein G-D-S-L family  39.76 
 
 
232 aa  51.6  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3119  lipolytic protein G-D-S-L family  30.24 
 
 
329 aa  51.6  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000200149 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2237  GDSL family lipase  29.35 
 
 
284 aa  49.7  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0161232 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8567  hypothetical protein  27.64 
 
 
324 aa  48.9  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2546  hypothetical protein  25.24 
 
 
239 aa  47.8  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.109536  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0503  lipase/acylhydrolase  34.44 
 
 
279 aa  47  0.0003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.833534  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0069  GDSL family lipase  27.66 
 
 
244 aa  46.6  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.074749  normal  0.034265 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2149  putative lipase  29.28 
 
 
203 aa  46.2  0.0006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.208079 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2484  lipolytic protein G-D-S-L family  34.75 
 
 
265 aa  45.8  0.0007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7234  lipolytic protein G-D-S-L family  28.97 
 
 
270 aa  45.8  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3955  GDSL family lipase  29.32 
 
 
218 aa  45.1  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00727916  normal  0.035201 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1812  lipolytic protein G-D-S-L family  26.61 
 
 
264 aa  44.7  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000302668  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10529  hypothetical protein  30.32 
 
 
231 aa  43.1  0.004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1047  lipolytic protein G-D-S-L family  29.92 
 
 
343 aa  42.7  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1722  GDSL family lipase  25.46 
 
 
202 aa  42.7  0.006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.862782  normal  0.0152444 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1154  lipolytic protein  26.2 
 
 
213 aa  42.4  0.006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21100  lysophospholipase L1-like esterase  27.42 
 
 
223 aa  42.7  0.006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0087  GDSL family lipase  22.84 
 
 
266 aa  42.4  0.007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3922  GDSL family lipase  32.18 
 
 
270 aa  42  0.009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0503745  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>