94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_19770 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_19770  lysophospholipase L1-like esterase  100 
 
 
255 aa  511  1e-144  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.057699  hitchhiker  0.000837214 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3727  lipolytic protein G-D-S-L family  56.28 
 
 
257 aa  273  2.0000000000000002e-72  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3925  GDSL family lipase  55.87 
 
 
253 aa  269  2.9999999999999997e-71  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1326  GDSL family lipase  52 
 
 
287 aa  263  2e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4413  GDSL family lipase  55.24 
 
 
266 aa  262  4e-69  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1363  lipolytic protein G-D-S-L family  51.78 
 
 
289 aa  259  3e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000348827 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0269  GDSL family lipase  51.2 
 
 
296 aa  256  4e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3930  GDSL family lipase  53.25 
 
 
283 aa  253  1.0000000000000001e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1065  lipolytic protein G-D-S-L family  51.01 
 
 
258 aa  248  7e-65  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.123175  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0855  hypothetical protein  50.98 
 
 
267 aa  243  1.9999999999999999e-63  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.335493  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2206  lipolytic protein G-D-S-L family  50 
 
 
261 aa  239  2e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.16188  normal  0.235445 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0072  GDSL family lipase  48.41 
 
 
294 aa  238  5e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3730  lipolytic protein G-D-S-L family  50.83 
 
 
281 aa  236  2e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06060  lysophospholipase L1-like esterase  47.43 
 
 
297 aa  233  2.0000000000000002e-60  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.105705  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0386  lipolytic protein G-D-S-L family  48.81 
 
 
258 aa  232  5e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0732  lipolytic protein G-D-S-L family  50.79 
 
 
263 aa  226  2e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.10792  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0263  lipolytic protein G-D-S-L family  45.6 
 
 
301 aa  225  5.0000000000000005e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6531  hypothetical protein  48.25 
 
 
262 aa  219  3e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.735834  normal  0.0269756 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34730  lysophospholipase L1-like esterase  45.85 
 
 
302 aa  218  6e-56  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0437206  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1490  lipolytic protein G-D-S-L family  54.03 
 
 
264 aa  218  7e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31650  lysophospholipase L1-like esterase  47.47 
 
 
326 aa  215  5.9999999999999996e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0684  lipolytic protein G-D-S-L family  46.33 
 
 
273 aa  213  1.9999999999999998e-54  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0974788  hitchhiker  0.0000166957 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2060  lipolytic protein G-D-S-L family  45.67 
 
 
281 aa  210  2e-53  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0854  hypothetical protein  48.98 
 
 
260 aa  210  2e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.231592  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1978  hypothetical protein  46.61 
 
 
300 aa  209  3e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5121  GDSL family lipase  46 
 
 
254 aa  208  8e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.245752  normal  0.320087 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0731  lipolytic protein G-D-S-L family  46.85 
 
 
265 aa  207  1e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645912  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0811  lipolytic protein G-D-S-L family  43.64 
 
 
333 aa  201  7e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.258357  normal  0.0157392 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5844  lipolytic protein G-D-S-L family  42.8 
 
 
258 aa  193  2e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23280  lysophospholipase L1-like esterase  43.75 
 
 
290 aa  192  5e-48  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2954  lipolytic protein G-D-S-L family  47.39 
 
 
319 aa  191  9e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2945  lipolytic protein G-D-S-L family  43.98 
 
 
289 aa  189  2.9999999999999997e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0023  GDSL family lipase  46.67 
 
 
259 aa  188  7e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0027  GDSL family lipase  45.1 
 
 
255 aa  184  1.0000000000000001e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4652  hypothetical protein  44.66 
 
 
270 aa  177  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0687952  normal  0.209987 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21860  GDSL-like Lipase/Acylhydrolase  40.37 
 
 
307 aa  174  9.999999999999999e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00185801  normal  0.684974 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2275  lipolytic protein G-D-S-L family  41.15 
 
 
278 aa  171  1e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0254  lipolytic protein G-D-S-L family  41.41 
 
 
254 aa  169  6e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2884  lipolytic enzyme, G-D-S-L  41.73 
 
 
258 aa  162  6e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0469503  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2928  GDSL family lipase  41.73 
 
 
256 aa  161  7e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2914  GDSL family lipase  41.73 
 
 
256 aa  161  7e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.308919 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3065  lipolytic protein G-D-S-L family  40.24 
 
 
262 aa  155  6e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3183  GDSL family lipase  39.22 
 
 
256 aa  153  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.209984 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0156  lipolytic protein G-D-S-L family  39.59 
 
 
256 aa  112  8.000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0132621  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2877  hypothetical protein  32.32 
 
 
196 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2532  lipase/acylhydrolase, putative  31.47 
 
 
197 aa  108  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0234064  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2458  hypothetical protein  31.79 
 
 
196 aa  107  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.755507  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2589  putative lipase/acylhydrolase  30.26 
 
 
197 aa  105  5e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00217697  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2320  GDSL family lipase  30.77 
 
 
197 aa  104  1e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000848879  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2516  putative lipase/acylhydrolase  29.74 
 
 
197 aa  103  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.118211 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2501  lipase/acylhydrolase  29.74 
 
 
197 aa  103  2e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.125082  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2242  lipase/acylhydrolase  29.74 
 
 
211 aa  103  3e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00129971  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2286  lipase/acylhydrolase  29.74 
 
 
211 aa  103  3e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000040763  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1801  lipolytic protein G-D-S-L family  30.29 
 
 
210 aa  82.8  0.000000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.798982  normal  0.790129 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2321  lipase/acylhydrolase  35.65 
 
 
143 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.183981  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1905  lipolytic enzyme, G-D-S-L  32.64 
 
 
270 aa  80.9  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00675962  normal  0.682362 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2667  GDSL family lipase  33.01 
 
 
234 aa  80.5  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.24646  hitchhiker  0.000175501 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2484  GDSL family lipase  33.16 
 
 
234 aa  79.7  0.00000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2933  lipolytic enzyme, G-D-S-L  33.33 
 
 
218 aa  77.8  0.0000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.594206  normal  0.0718245 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3278  hypothetical protein  27.04 
 
 
229 aa  75.1  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.548369 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3268  lipolytic protein G-D-S-L family  33.33 
 
 
232 aa  72.8  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3955  GDSL family lipase  32.38 
 
 
218 aa  62.4  0.000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00727916  normal  0.035201 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2237  GDSL family lipase  30.33 
 
 
284 aa  58.5  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0161232 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0074  lipolytic protein G-D-S-L family  32.05 
 
 
249 aa  57.4  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0086  lipolytic protein G-D-S-L family  32.05 
 
 
240 aa  57  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0717597  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0069  GDSL family lipase  29.63 
 
 
244 aa  53.5  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.074749  normal  0.034265 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3316  GDSL family lipase  28.44 
 
 
286 aa  52.8  0.000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.17173  normal  0.550495 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3640  lipolytic protein G-D-S-L family  28.44 
 
 
275 aa  52.4  0.000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.876075 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0503  lipase/acylhydrolase  36.96 
 
 
279 aa  50.1  0.00004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.833534  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19520  lysophospholipase L1-like esterase  30.85 
 
 
209 aa  49.3  0.00005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.347124  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0068  lipolytic protein  30.25 
 
 
247 aa  48.1  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.523857  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21100  lysophospholipase L1-like esterase  31.22 
 
 
223 aa  47.8  0.0002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8567  hypothetical protein  27.1 
 
 
324 aa  47.4  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3516  lipolytic protein G-D-S-L family  26.34 
 
 
275 aa  47  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.537403  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2673  lipolytic protein G-D-S-L family  27.52 
 
 
227 aa  45.8  0.0006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.12388  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4506  lipolytic protein G-D-S-L family  29.06 
 
 
230 aa  44.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4444  lipolytic protein G-D-S-L family  29.06 
 
 
230 aa  44.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7234  lipolytic protein G-D-S-L family  29.25 
 
 
270 aa  45.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3922  GDSL family lipase  25.94 
 
 
270 aa  44.7  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0503745  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1589  lipolytic protein G-D-S-L family  26.92 
 
 
264 aa  44.7  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0691726  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0553  lipolytic protein G-D-S-L family  23.67 
 
 
214 aa  43.9  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0761  lysophospholipase L1 related esterase  32.61 
 
 
303 aa  44.3  0.002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0704393  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2456  lipolytic protein G-D-S-L family  31.3 
 
 
219 aa  44.3  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00970732  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3144  lipolytic protein G-D-S-L family  25 
 
 
225 aa  44.3  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2484  lipolytic protein G-D-S-L family  28.92 
 
 
265 aa  43.9  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07130  lysophospholipase L1-like esterase  26.24 
 
 
368 aa  43.5  0.003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.39712  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0773  GDSL family lipase  34.07 
 
 
308 aa  43.5  0.004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3442  lipolytic enzyme, G-D-S-L  25.6 
 
 
232 aa  43.1  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2207  arylesterase  22.75 
 
 
209 aa  43.1  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.547508 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1774  lipolytic protein G-D-S-L family  37.89 
 
 
229 aa  43.1  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0825  lipolytic protein G-D-S-L family  24.86 
 
 
216 aa  42.7  0.006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000789426  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3153  lipolytic protein G-D-S-L family  29.25 
 
 
305 aa  42.4  0.007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3119  lipolytic protein G-D-S-L family  29.11 
 
 
329 aa  42.4  0.007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000200149 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2112  lipolytic protein G-D-S-L family  29.65 
 
 
218 aa  42  0.01  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.835545 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>