21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2286 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_2286  hypothetical protein  100 
 
 
239 aa  457  9.999999999999999e-129  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.419706  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2000  lipolytic enzyme, G-D-S-L  32.82 
 
 
243 aa  60.5  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2090  hypothetical protein  31.65 
 
 
243 aa  60.1  0.00000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2673  lipolytic protein G-D-S-L family  29.54 
 
 
227 aa  57.8  0.0000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.12388  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5844  lipolytic protein G-D-S-L family  31.15 
 
 
258 aa  50.1  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0386  lipolytic protein G-D-S-L family  28.23 
 
 
258 aa  47  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4413  GDSL family lipase  32.96 
 
 
266 aa  47  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1363  lipolytic protein G-D-S-L family  30.17 
 
 
289 aa  46.2  0.0004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000348827 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2886  hypothetical protein  28.57 
 
 
295 aa  45.8  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.280434  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1326  GDSL family lipase  30.22 
 
 
287 aa  45.8  0.0006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4904  Triacylglycerol lipase  30.28 
 
 
257 aa  45.4  0.0007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3183  GDSL family lipase  30.16 
 
 
256 aa  45.4  0.0008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.209984 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3730  lipolytic protein G-D-S-L family  35.38 
 
 
281 aa  44.3  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03570  GDSL-like Lipase/Acylhydrolase  31.17 
 
 
291 aa  44.3  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.312052  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6531  hypothetical protein  36 
 
 
262 aa  43.9  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.735834  normal  0.0269756 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1542  Triacylglycerol lipase  33.13 
 
 
259 aa  43.9  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.429303  normal  0.462707 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7234  lipolytic protein G-D-S-L family  30.14 
 
 
270 aa  43.5  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0116  hypothetical protein  31.31 
 
 
287 aa  42.7  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.307461  normal  0.0664489 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2582  lipolytic protein G-D-S-L family  28.03 
 
 
260 aa  42  0.008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2914  GDSL family lipase  32.43 
 
 
256 aa  42  0.009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.308919 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2928  GDSL family lipase  32.43 
 
 
256 aa  42  0.009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>