69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0386 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_0386  lipolytic protein G-D-S-L family  100 
 
 
258 aa  525  1e-148  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0855  hypothetical protein  57.59 
 
 
267 aa  302  4.0000000000000003e-81  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.335493  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34730  lysophospholipase L1-like esterase  56.52 
 
 
302 aa  299  2e-80  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0437206  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0732  lipolytic protein G-D-S-L family  57.59 
 
 
263 aa  286  2.9999999999999996e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.10792  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2206  lipolytic protein G-D-S-L family  52.34 
 
 
261 aa  275  4e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.16188  normal  0.235445 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6531  hypothetical protein  51.55 
 
 
262 aa  265  5e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.735834  normal  0.0269756 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0854  hypothetical protein  51.44 
 
 
260 aa  238  5e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.231592  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0731  lipolytic protein G-D-S-L family  49 
 
 
265 aa  232  4.0000000000000004e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645912  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19770  lysophospholipase L1-like esterase  48.81 
 
 
255 aa  232  5e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.057699  hitchhiker  0.000837214 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1363  lipolytic protein G-D-S-L family  49.19 
 
 
289 aa  219  3e-56  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000348827 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1978  hypothetical protein  47.45 
 
 
300 aa  218  7.999999999999999e-56  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1490  lipolytic protein G-D-S-L family  49.6 
 
 
264 aa  216  2.9999999999999998e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1326  GDSL family lipase  46.72 
 
 
287 aa  213  1.9999999999999998e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5844  lipolytic protein G-D-S-L family  41.67 
 
 
258 aa  213  1.9999999999999998e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0269  GDSL family lipase  45.6 
 
 
296 aa  205  5e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31650  lysophospholipase L1-like esterase  45.74 
 
 
326 aa  204  8e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2954  lipolytic protein G-D-S-L family  48.39 
 
 
319 aa  204  1e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0811  lipolytic protein G-D-S-L family  42.01 
 
 
333 aa  197  2.0000000000000003e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.258357  normal  0.0157392 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0684  lipolytic protein G-D-S-L family  43.53 
 
 
273 aa  196  3e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0974788  hitchhiker  0.0000166957 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0263  lipolytic protein G-D-S-L family  42.74 
 
 
301 aa  195  5.000000000000001e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2060  lipolytic protein G-D-S-L family  43.92 
 
 
281 aa  195  8.000000000000001e-49  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3727  lipolytic protein G-D-S-L family  42.69 
 
 
257 aa  193  3e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0023  GDSL family lipase  43.24 
 
 
259 aa  192  4e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0027  GDSL family lipase  43.24 
 
 
255 aa  192  4e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3925  GDSL family lipase  42.51 
 
 
253 aa  191  9e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0072  GDSL family lipase  42.91 
 
 
294 aa  191  1e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1065  lipolytic protein G-D-S-L family  41.96 
 
 
258 aa  191  1e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.123175  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06060  lysophospholipase L1-like esterase  43.65 
 
 
297 aa  190  2e-47  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.105705  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2945  lipolytic protein G-D-S-L family  43.02 
 
 
289 aa  187  1e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21860  GDSL-like Lipase/Acylhydrolase  41.11 
 
 
307 aa  187  2e-46  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00185801  normal  0.684974 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4413  GDSL family lipase  42.35 
 
 
266 aa  186  2e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3930  GDSL family lipase  41.7 
 
 
283 aa  184  1.0000000000000001e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23280  lysophospholipase L1-like esterase  39.46 
 
 
290 aa  183  2.0000000000000003e-45  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2275  lipolytic protein G-D-S-L family  41.5 
 
 
278 aa  183  2.0000000000000003e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3730  lipolytic protein G-D-S-L family  41.13 
 
 
281 aa  173  2.9999999999999996e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5121  GDSL family lipase  39.61 
 
 
254 aa  156  3e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.245752  normal  0.320087 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2914  GDSL family lipase  36.86 
 
 
256 aa  152  7e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.308919 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2928  GDSL family lipase  36.86 
 
 
256 aa  152  7e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2884  lipolytic enzyme, G-D-S-L  37.35 
 
 
258 aa  150  1e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0469503  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4652  hypothetical protein  38.71 
 
 
270 aa  144  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0687952  normal  0.209987 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0254  lipolytic protein G-D-S-L family  34.92 
 
 
254 aa  143  2e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3065  lipolytic protein G-D-S-L family  34.82 
 
 
262 aa  137  1e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3183  GDSL family lipase  35.2 
 
 
256 aa  132  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.209984 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2877  hypothetical protein  29.12 
 
 
196 aa  89  7e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2458  hypothetical protein  28.57 
 
 
196 aa  87.4  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.755507  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2933  lipolytic enzyme, G-D-S-L  33.87 
 
 
218 aa  85.9  6e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.594206  normal  0.0718245 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2501  lipase/acylhydrolase  29.12 
 
 
197 aa  85.5  7e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.125082  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2286  lipase/acylhydrolase  28.57 
 
 
211 aa  85.9  7e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000040763  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2516  putative lipase/acylhydrolase  29.12 
 
 
197 aa  85.5  7e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.118211 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2242  lipase/acylhydrolase  29.12 
 
 
211 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00129971  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2320  GDSL family lipase  28.57 
 
 
197 aa  84  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000848879  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2532  lipase/acylhydrolase, putative  28.57 
 
 
197 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0234064  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2589  putative lipase/acylhydrolase  28.02 
 
 
197 aa  82.8  0.000000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00217697  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0156  lipolytic protein G-D-S-L family  34.83 
 
 
256 aa  81.6  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0132621  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1905  lipolytic enzyme, G-D-S-L  32 
 
 
270 aa  77  0.0000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00675962  normal  0.682362 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3278  hypothetical protein  28.98 
 
 
229 aa  72.4  0.000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.548369 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2484  GDSL family lipase  29.65 
 
 
234 aa  68.9  0.00000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1801  lipolytic protein G-D-S-L family  28.27 
 
 
210 aa  67.4  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.798982  normal  0.790129 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2321  lipase/acylhydrolase  33.03 
 
 
143 aa  64.7  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.183981  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3955  GDSL family lipase  31.91 
 
 
218 aa  63.5  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00727916  normal  0.035201 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2667  GDSL family lipase  27.91 
 
 
234 aa  60.1  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.24646  hitchhiker  0.000175501 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3268  lipolytic protein G-D-S-L family  29.89 
 
 
232 aa  53.5  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2237  GDSL family lipase  28.99 
 
 
284 aa  50.1  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0161232 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2484  lipolytic protein G-D-S-L family  28.84 
 
 
265 aa  48.9  0.00009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1812  lipolytic protein G-D-S-L family  25.24 
 
 
264 aa  46.6  0.0004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000302668  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0069  GDSL family lipase  28.42 
 
 
244 aa  44.3  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.074749  normal  0.034265 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_18481  predicted protein  28.3 
 
 
213 aa  43.5  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.228231  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2286  hypothetical protein  27.75 
 
 
239 aa  42.7  0.006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.419706  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0074  lipolytic protein G-D-S-L family  29.77 
 
 
249 aa  42  0.01  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>