59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3726 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_3726  GDSL family lipase  100 
 
 
388 aa  791    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03570  GDSL-like Lipase/Acylhydrolase  44.7 
 
 
291 aa  204  2e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.312052  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4505  hypothetical protein  45.45 
 
 
297 aa  202  6e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0494409 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2931  hypothetical protein  45.52 
 
 
289 aa  189  1e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.538874  normal  0.280581 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5610  GDSL family lipase  41.54 
 
 
285 aa  183  4.0000000000000006e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.593946  normal  0.651642 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5000  GDSL family lipase  38.87 
 
 
304 aa  167  2.9999999999999998e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.189373  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4289  hypothetical protein  39.19 
 
 
281 aa  165  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.967227  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12270  hypothetical protein  38.81 
 
 
295 aa  156  5.0000000000000005e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.57947  normal  0.510292 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3218  secreted hydrolase  38.11 
 
 
295 aa  150  3e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0134174  normal  0.246696 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1119  lipolytic protein G-D-S-L family  41.15 
 
 
297 aa  149  6e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00446637  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0116  hypothetical protein  37.91 
 
 
287 aa  146  6e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.307461  normal  0.0664489 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1033  hypothetical protein  38.55 
 
 
298 aa  145  1e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.468233  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4925  hypothetical protein  34.3 
 
 
295 aa  144  4e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4490  GDSL family lipase  37.45 
 
 
299 aa  127  4.0000000000000003e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.14839  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2886  hypothetical protein  33.82 
 
 
295 aa  124  4e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.280434  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1035  hypothetical protein  31.34 
 
 
346 aa  113  6e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0174734  hitchhiker  0.00616625 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1805  hypothetical protein  31.16 
 
 
281 aa  103  4e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0114051  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2246  hypothetical protein  31.33 
 
 
446 aa  103  7e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.421702  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3869  hypothetical protein  29.55 
 
 
337 aa  100  4e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.00000000820088  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0610  hypothetical protein  28.3 
 
 
455 aa  99.4  9e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.457827  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1455  hypothetical protein  31.88 
 
 
304 aa  99.4  9e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0194  GDSL family lipase  33.33 
 
 
253 aa  98.2  2e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0117  GDSL family lipase  31.18 
 
 
304 aa  97.4  4e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.37  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7234  lipolytic protein G-D-S-L family  31.7 
 
 
270 aa  96.7  7e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0548  hypothetical protein  32.97 
 
 
253 aa  95.9  1e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.675038  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2154  Triacylglycerol lipase  32.13 
 
 
274 aa  94.4  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.349109 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4904  Triacylglycerol lipase  33.59 
 
 
257 aa  93.2  7e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0560  hypothetical protein  33.45 
 
 
249 aa  91.7  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.483426 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30530  hypothetical protein  29.64 
 
 
265 aa  91.3  2e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.859475 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0166  hypothetical protein  28.42 
 
 
367 aa  90.5  5e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2842  lipolytic protein G-D-S-L family  29.87 
 
 
353 aa  89.7  7e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00148431  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0538  hypothetical protein  33.09 
 
 
249 aa  89.7  7e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4974  Triacylglycerol lipase  30.31 
 
 
261 aa  89.7  8e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.809775  normal  0.295048 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1542  Triacylglycerol lipase  30.42 
 
 
259 aa  88.6  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.429303  normal  0.462707 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1522  hypothetical protein  28.03 
 
 
289 aa  86.7  7e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0608193  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0711  hypothetical protein  32.95 
 
 
248 aa  85.5  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0414517 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4796  secreted hydrolase  32.34 
 
 
280 aa  82.8  0.000000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.31907  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0195  hypothetical protein  26.79 
 
 
323 aa  79.7  0.00000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2499  lipolytic protein G-D-S-L family  29.82 
 
 
272 aa  79.3  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0951  Triacylglycerol lipase  28.79 
 
 
270 aa  78.2  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.105252  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4380  putative secreted hydrolase  27.96 
 
 
305 aa  77.4  0.0000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.784206  normal  0.181391 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1672  GDSL-like lipase/acylhydrolase  28.33 
 
 
295 aa  74.3  0.000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3390  hypothetical protein  30.04 
 
 
265 aa  73.6  0.000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.402053  normal  0.0777437 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1584  hypothetical protein  28.28 
 
 
272 aa  73.2  0.000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4585  Triacylglycerol lipase  28.84 
 
 
257 aa  70.1  0.00000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0559591  normal  0.168211 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0864  hypothetical protein  29.32 
 
 
333 aa  68.9  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.159324  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3058  hypothetical protein  29.07 
 
 
295 aa  68.2  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5827  Triacylglycerol lipase  29.82 
 
 
266 aa  67.8  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4280  hypothetical protein  28.68 
 
 
263 aa  65.1  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3165  hypothetical protein  30.37 
 
 
265 aa  58.5  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0214678 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0269  GDSL family lipase  35.54 
 
 
296 aa  50.8  0.00004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5073  hypothetical protein  24.53 
 
 
1349 aa  50.1  0.00007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.528473  hitchhiker  0.000168425 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3263  secreted hydrolase  24.82 
 
 
298 aa  47.4  0.0004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4155  lipolytic protein G-D-S-L family  34.96 
 
 
309 aa  47  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.285332  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01450  hypothetical protein  26.67 
 
 
744 aa  46.6  0.0008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.657991  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0683  hypothetical protein  40 
 
 
256 aa  45.8  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3125  hypothetical protein  34.29 
 
 
304 aa  44.7  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0607025  normal  0.039851 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3694  hypothetical protein  28.57 
 
 
1357 aa  44.3  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4993  hypothetical protein  22.71 
 
 
350 aa  43.9  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>