44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1035 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_1035  hypothetical protein  100 
 
 
346 aa  716    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0174734  hitchhiker  0.00616625 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3869  hypothetical protein  39.37 
 
 
337 aa  203  3e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.00000000820088  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4505  hypothetical protein  31.65 
 
 
297 aa  115  1.0000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0494409 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5610  GDSL family lipase  32.15 
 
 
285 aa  112  9e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.593946  normal  0.651642 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3726  GDSL family lipase  31.34 
 
 
388 aa  112  9e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12270  hypothetical protein  31.97 
 
 
295 aa  112  1.0000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.57947  normal  0.510292 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03570  GDSL-like Lipase/Acylhydrolase  29.62 
 
 
291 aa  108  2e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.312052  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0116  hypothetical protein  30.5 
 
 
287 aa  101  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.307461  normal  0.0664489 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1119  lipolytic protein G-D-S-L family  31.99 
 
 
297 aa  99.4  7e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00446637  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2931  hypothetical protein  32.03 
 
 
289 aa  94.4  3e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.538874  normal  0.280581 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5000  GDSL family lipase  28.43 
 
 
304 aa  92  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.189373  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3218  secreted hydrolase  30.41 
 
 
295 aa  91.7  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0134174  normal  0.246696 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4490  GDSL family lipase  31.69 
 
 
299 aa  90.1  5e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.14839  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0610  hypothetical protein  30.48 
 
 
455 aa  85.9  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.457827  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2842  lipolytic protein G-D-S-L family  28.89 
 
 
353 aa  84.3  0.000000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00148431  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4925  hypothetical protein  27.03 
 
 
295 aa  83.6  0.000000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2246  hypothetical protein  27.41 
 
 
446 aa  80.5  0.00000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.421702  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0166  hypothetical protein  29.73 
 
 
367 aa  78.2  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0117  GDSL family lipase  26.89 
 
 
304 aa  78.6  0.0000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.37  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0195  hypothetical protein  27.63 
 
 
323 aa  76.3  0.0000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1033  hypothetical protein  27.83 
 
 
298 aa  75.5  0.000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.468233  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0951  Triacylglycerol lipase  26.35 
 
 
270 aa  74.3  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.105252  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4289  hypothetical protein  24.61 
 
 
281 aa  72.8  0.000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.967227  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4585  Triacylglycerol lipase  26.96 
 
 
257 aa  70.9  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0559591  normal  0.168211 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2886  hypothetical protein  26.3 
 
 
295 aa  69.7  0.00000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.280434  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1455  hypothetical protein  26.18 
 
 
304 aa  68.2  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1522  hypothetical protein  24.33 
 
 
289 aa  67.4  0.0000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0608193  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4904  Triacylglycerol lipase  26.52 
 
 
257 aa  66.6  0.0000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2154  Triacylglycerol lipase  27.67 
 
 
274 aa  63.9  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.349109 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3058  hypothetical protein  26.33 
 
 
295 aa  62.8  0.000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7234  lipolytic protein G-D-S-L family  25.46 
 
 
270 aa  62.4  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1542  Triacylglycerol lipase  26.39 
 
 
259 aa  60.8  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.429303  normal  0.462707 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1805  hypothetical protein  24.13 
 
 
281 aa  59.3  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0114051  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4380  putative secreted hydrolase  27.65 
 
 
305 aa  57.4  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.784206  normal  0.181391 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30530  hypothetical protein  24.6 
 
 
265 aa  54.7  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.859475 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3694  hypothetical protein  22.87 
 
 
1357 aa  51.6  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3125  hypothetical protein  25 
 
 
304 aa  49.7  0.00007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0607025  normal  0.039851 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4974  Triacylglycerol lipase  21.61 
 
 
261 aa  49.3  0.00009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.809775  normal  0.295048 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4993  hypothetical protein  21.46 
 
 
350 aa  48.1  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3390  hypothetical protein  24.89 
 
 
265 aa  47.8  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.402053  normal  0.0777437 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1673  hypothetical protein  30.68 
 
 
418 aa  44.7  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.595687 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1672  GDSL-like lipase/acylhydrolase  23.85 
 
 
295 aa  45.4  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4796  secreted hydrolase  24.64 
 
 
280 aa  44.7  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.31907  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5073  hypothetical protein  25.91 
 
 
1349 aa  43.9  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.528473  hitchhiker  0.000168425 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>