17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4155 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_4155  lipolytic protein G-D-S-L family  100 
 
 
309 aa  614  1e-175  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.285332  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5529  hypothetical protein  40.38 
 
 
309 aa  181  2e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0117  hypothetical protein  30.51 
 
 
294 aa  96.3  5e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0855011  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3994  hypothetical protein  27.05 
 
 
329 aa  77  0.0000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.540911 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0410  hypothetical protein  25 
 
 
301 aa  62.4  0.000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.616027  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7234  lipolytic protein G-D-S-L family  28.37 
 
 
270 aa  57.4  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1033  hypothetical protein  25.35 
 
 
298 aa  53.1  0.000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.468233  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03570  GDSL-like Lipase/Acylhydrolase  27.9 
 
 
291 aa  51.2  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.312052  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1455  hypothetical protein  32.56 
 
 
304 aa  51.6  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0548  hypothetical protein  37.38 
 
 
253 aa  47.8  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.675038  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0538  hypothetical protein  36.79 
 
 
249 aa  47  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2246  hypothetical protein  26.3 
 
 
446 aa  47  0.0005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.421702  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1805  hypothetical protein  33.94 
 
 
281 aa  45.1  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0114051  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4490  GDSL family lipase  27.09 
 
 
299 aa  43.5  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.14839  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0560  hypothetical protein  35.85 
 
 
249 aa  43.5  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.483426 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3726  GDSL family lipase  34.86 
 
 
388 aa  42.7  0.008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7163  hypothetical protein  30.98 
 
 
417 aa  42.4  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>