19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7163 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_7163  hypothetical protein  100 
 
 
417 aa  862    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5213  hypothetical protein  54.86 
 
 
423 aa  459  9.999999999999999e-129  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0312335  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4260  hypothetical protein  55.26 
 
 
397 aa  406  1.0000000000000001e-112  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.50651  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2941  hypothetical protein  52.38 
 
 
410 aa  399  9.999999999999999e-111  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2746  hypothetical protein  49.59 
 
 
414 aa  350  3e-95  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.0000246717  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3769  hypothetical protein  47.72 
 
 
410 aa  313  4.999999999999999e-84  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.657962  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2701  hypothetical protein  32.25 
 
 
353 aa  100  4e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000302317  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6745  hypothetical protein  28.84 
 
 
653 aa  94  5e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0419034  normal  0.323144 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4993  hypothetical protein  28.18 
 
 
350 aa  90.5  6e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21860  hypothetical protein  28.19 
 
 
354 aa  83.2  0.000000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.218372  normal  0.0328594 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6063  Ricin B lectin  26.59 
 
 
524 aa  82.4  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1679  hypothetical protein  25.71 
 
 
416 aa  80.5  0.00000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.882455  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1894  hypothetical protein  26.35 
 
 
413 aa  75.9  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1673  hypothetical protein  26.04 
 
 
418 aa  65.5  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.595687 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3694  hypothetical protein  27.86 
 
 
1357 aa  55.5  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0166  hypothetical protein  25.52 
 
 
367 aa  50.1  0.00008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4380  putative secreted hydrolase  35.56 
 
 
305 aa  49.7  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.784206  normal  0.181391 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2499  lipolytic protein G-D-S-L family  24.85 
 
 
272 aa  47.4  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5073  hypothetical protein  22.95 
 
 
1349 aa  45.4  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.528473  hitchhiker  0.000168425 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>