52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_4280 on replicon NC_014159
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014159  Tpau_4280  hypothetical protein  100 
 
 		 263 aa  516  1.0000000000000001e-145  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0683  hypothetical protein  52.96 
 
 		 256 aa  194  9e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0548  hypothetical protein  42.53 
 
 		 253 aa  144  2e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.675038  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0560  hypothetical protein  42.53 
 
 		 249 aa  144  2e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.483426 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0538  hypothetical protein  42.53 
 
 		 249 aa  143  2e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0194  GDSL family lipase  40.46 
 
 		 253 aa  137  2e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1455  hypothetical protein  35.56 
 
 		 304 aa  132  3.9999999999999996e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0711  hypothetical protein  40.73 
 
 		 248 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0414517 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0864  hypothetical protein  38.78 
 
 		 333 aa  120  1.9999999999999998e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.159324  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2886  hypothetical protein  32.81 
 
 		 295 aa  107  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.280434  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1805  hypothetical protein  32.13 
 
 		 281 aa  100  2e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0114051  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1033  hypothetical protein  32.05 
 
 		 298 aa  90.5  2e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.468233  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0117  GDSL family lipase  30.19 
 
 		 304 aa  90.1  3e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.37  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4925  hypothetical protein  33.21 
 
 		 295 aa  88.6  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1119  lipolytic protein G-D-S-L family  31.08 
 
 		 297 aa  85.1  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00446637  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4490  GDSL family lipase  31.17 
 
 		 299 aa  84.3  0.000000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.14839  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03570  GDSL-like Lipase/Acylhydrolase  30.83 
 
 		 291 aa  83.2  0.000000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.312052  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4505  hypothetical protein  29.6 
 
 		 297 aa  80.5  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0494409 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2246  hypothetical protein  27.21 
 
 		 446 aa  78.6  0.00000000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.421702  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0116  hypothetical protein  28.63 
 
 		 287 aa  77.4  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.307461  normal  0.0664489 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4380  putative secreted hydrolase  28.68 
 
 		 305 aa  77.4  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.784206  normal  0.181391 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0195  hypothetical protein  28.85 
 
 		 323 aa  75.5  0.0000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4289  hypothetical protein  31.99 
 
 		 281 aa  71.6  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.967227  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5000  GDSL family lipase  27.41 
 
 		 304 aa  71.6  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.189373  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2842  lipolytic protein G-D-S-L family  29.23 
 
 		 353 aa  71.2  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00148431  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12270  hypothetical protein  30.29 
 
 		 295 aa  70.5  0.00000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.57947  normal  0.510292 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1522  hypothetical protein  28.57 
 
 		 289 aa  69.3  0.00000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0608193  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0951  Triacylglycerol lipase  31.3 
 
 		 270 aa  68.9  0.00000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.105252  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4585  Triacylglycerol lipase  27.82 
 
 		 257 aa  68.6  0.00000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0559591  normal  0.168211 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5610  GDSL family lipase  30.97 
 
 		 285 aa  68.2  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.593946  normal  0.651642 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1542  Triacylglycerol lipase  29.67 
 
 		 259 aa  68.6  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.429303  normal  0.462707 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0610  hypothetical protein  27.6 
 
 		 455 aa  67.8  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.457827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4974  Triacylglycerol lipase  29.84 
 
 		 261 aa  65.5  0.0000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.809775  normal  0.295048 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3726  GDSL family lipase  28.68 
 
 		 388 aa  65.5  0.0000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30530  hypothetical protein  26.8 
 
 		 265 aa  64.3  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.859475 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3218  secreted hydrolase  28.91 
 
 		 295 aa  64.7  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0134174  normal  0.246696 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5827  Triacylglycerol lipase  29.88 
 
 		 266 aa  62.4  0.000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3390  hypothetical protein  27.64 
 
 		 265 aa  62.4  0.000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.402053  normal  0.0777437 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4904  Triacylglycerol lipase  27.8 
 
 		 257 aa  61.2  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4796  secreted hydrolase  26.6 
 
 		 280 aa  53.5  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.31907  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2499  lipolytic protein G-D-S-L family  30.49 
 
 		 272 aa  51.6  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3058  hypothetical protein  28.89 
 
 		 295 aa  49.7  0.00005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1584  hypothetical protein  28.24 
 
 		 272 aa  49.3  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7234  lipolytic protein G-D-S-L family  28.63 
 
 		 270 aa  48.9  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3694  hypothetical protein  29.28 
 
 		 1357 aa  47.8  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3165  hypothetical protein  26.61 
 
 		 265 aa  47.4  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0214678 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0166  hypothetical protein  27.95 
 
 		 367 aa  47.8  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1672  GDSL-like lipase/acylhydrolase  32.3 
 
 		 295 aa  47  0.0004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3869  hypothetical protein  23.37 
 
 		 337 aa  46.2  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.00000000820088  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2931  hypothetical protein  30.65 
 
 		 289 aa  43.9  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.538874  normal  0.280581 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5446  hypothetical protein  28.52 
 
 		 475 aa  43.1  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.231631  normal  0.382515 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2154  Triacylglycerol lipase  29.41 
 
 		 274 aa  42  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.349109 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>