60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_30530 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_30530  hypothetical protein  100 
 
 
265 aa  539  9.999999999999999e-153  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.859475 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3390  hypothetical protein  50.19 
 
 
265 aa  239  4e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.402053  normal  0.0777437 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3165  hypothetical protein  50.56 
 
 
265 aa  223  2e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0214678 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7234  lipolytic protein G-D-S-L family  52 
 
 
270 aa  219  3.9999999999999997e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2499  lipolytic protein G-D-S-L family  49.79 
 
 
272 aa  216  4e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4904  Triacylglycerol lipase  49.56 
 
 
257 aa  211  7e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4796  secreted hydrolase  48.3 
 
 
280 aa  203  2e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.31907  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1584  hypothetical protein  48.7 
 
 
272 aa  200  1.9999999999999998e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4974  Triacylglycerol lipase  45.53 
 
 
261 aa  194  2e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.809775  normal  0.295048 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0951  Triacylglycerol lipase  43.22 
 
 
270 aa  181  1e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.105252  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2154  Triacylglycerol lipase  39.86 
 
 
274 aa  181  1e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.349109 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1542  Triacylglycerol lipase  40.37 
 
 
259 aa  177  1e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.429303  normal  0.462707 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4585  Triacylglycerol lipase  40.48 
 
 
257 aa  174  1.9999999999999998e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0559591  normal  0.168211 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5827  Triacylglycerol lipase  42.74 
 
 
266 aa  161  1e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0166  hypothetical protein  35.42 
 
 
367 aa  115  7.999999999999999e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0610  hypothetical protein  32.68 
 
 
455 aa  109  5e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.457827  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2842  lipolytic protein G-D-S-L family  34.83 
 
 
353 aa  108  8.000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00148431  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2246  hypothetical protein  33.46 
 
 
446 aa  105  1e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.421702  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03570  GDSL-like Lipase/Acylhydrolase  31.56 
 
 
291 aa  104  1e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.312052  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4380  putative secreted hydrolase  30.68 
 
 
305 aa  97.4  2e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.784206  normal  0.181391 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5073  hypothetical protein  27.71 
 
 
1349 aa  91.7  1e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.528473  hitchhiker  0.000168425 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0195  hypothetical protein  30.33 
 
 
323 aa  91.7  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3058  hypothetical protein  29.24 
 
 
295 aa  86.7  4e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4925  hypothetical protein  27.57 
 
 
295 aa  86.3  4e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3726  GDSL family lipase  29.26 
 
 
388 aa  85.1  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4490  GDSL family lipase  30.16 
 
 
299 aa  84.7  0.000000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.14839  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3263  secreted hydrolase  28.98 
 
 
298 aa  83.2  0.000000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5000  GDSL family lipase  27.71 
 
 
304 aa  81.6  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.189373  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4505  hypothetical protein  28.98 
 
 
297 aa  79.3  0.00000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0494409 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12270  hypothetical protein  29.96 
 
 
295 aa  79.3  0.00000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.57947  normal  0.510292 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3694  hypothetical protein  25.68 
 
 
1357 aa  78.2  0.0000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0548  hypothetical protein  29.11 
 
 
253 aa  74.7  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.675038  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1805  hypothetical protein  27.24 
 
 
281 aa  72.8  0.000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0114051  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0560  hypothetical protein  28.51 
 
 
249 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.483426 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0538  hypothetical protein  28.51 
 
 
249 aa  70.9  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3869  hypothetical protein  25.95 
 
 
337 aa  70.9  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.00000000820088  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4289  hypothetical protein  31.2 
 
 
281 aa  70.9  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.967227  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2886  hypothetical protein  26.52 
 
 
295 aa  70.5  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.280434  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0116  hypothetical protein  28.16 
 
 
287 aa  69.3  0.00000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.307461  normal  0.0664489 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0117  GDSL family lipase  26.98 
 
 
304 aa  67.8  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.37  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0194  GDSL family lipase  28.81 
 
 
253 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3125  hypothetical protein  25.77 
 
 
304 aa  66.2  0.0000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0607025  normal  0.039851 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1455  hypothetical protein  27.43 
 
 
304 aa  65.5  0.0000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1119  lipolytic protein G-D-S-L family  25.91 
 
 
297 aa  65.1  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00446637  normal 
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4280  hypothetical protein  26.8 
 
 
263 aa  64.3  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3218  secreted hydrolase  28.69 
 
 
295 aa  64.3  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0134174  normal  0.246696 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1033  hypothetical protein  25.93 
 
 
298 aa  62.8  0.000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.468233  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2931  hypothetical protein  29.92 
 
 
289 aa  62  0.000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.538874  normal  0.280581 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0711  hypothetical protein  29.63 
 
 
248 aa  62  0.000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0414517 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5610  GDSL family lipase  27.63 
 
 
285 aa  61.2  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.593946  normal  0.651642 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1522  hypothetical protein  27.71 
 
 
289 aa  60.8  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0608193  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1035  hypothetical protein  24.6 
 
 
346 aa  54.7  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0174734  hitchhiker  0.00616625 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1672  GDSL-like lipase/acylhydrolase  24.1 
 
 
295 aa  53.9  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0864  hypothetical protein  28.05 
 
 
333 aa  53.5  0.000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.159324  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21860  hypothetical protein  24.82 
 
 
354 aa  52  0.000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.218372  normal  0.0328594 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2701  hypothetical protein  26.96 
 
 
353 aa  52  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000302317  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6745  hypothetical protein  26.46 
 
 
653 aa  48.1  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0419034  normal  0.323144 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01450  hypothetical protein  23.47 
 
 
744 aa  44.7  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.657991  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4993  hypothetical protein  26.32 
 
 
350 aa  42.7  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6063  Ricin B lectin  21.68 
 
 
524 aa  42.7  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>