23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2701 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_2701  hypothetical protein  100 
 
 		 353 aa  720    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000302317  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4993  hypothetical protein  45.83 
 
 		 350 aa  273  3e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21860  hypothetical protein  46.51 
 
 		 354 aa  265  7e-70  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.218372  normal  0.0328594 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6745  hypothetical protein  38.51 
 
 		 653 aa  189  5e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0419034  normal  0.323144 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6063  Ricin B lectin  29.72 
 
 		 524 aa  150  3e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7163  hypothetical protein  32.19 
 
 		 417 aa  101  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4260  hypothetical protein  28.12 
 
 		 397 aa  97.8  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.50651  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5213  hypothetical protein  29.86 
 
 		 423 aa  94.7  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0312335  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3769  hypothetical protein  31.65 
 
 		 410 aa  85.5  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.657962  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2941  hypothetical protein  29.35 
 
 		 410 aa  82.4  0.00000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1673  hypothetical protein  24.69 
 
 		 418 aa  76.6  0.0000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.595687 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1679  hypothetical protein  23.27 
 
 		 416 aa  65.1  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.882455  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1894  hypothetical protein  26.16 
 
 		 413 aa  62.8  0.000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0166  hypothetical protein  27.24 
 
 		 367 aa  62.8  0.000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2746  hypothetical protein  25.36 
 
 		 414 aa  60.5  0.00000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.0000246717  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4289  hypothetical protein  25.4 
 
 		 281 aa  58.5  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.967227  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1033  hypothetical protein  29.96 
 
 		 298 aa  57.4  0.0000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.468233  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30530  hypothetical protein  25.4 
 
 		 265 aa  54.7  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.859475 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2842  lipolytic protein G-D-S-L family  29.06 
 
 		 353 aa  49.3  0.00009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00148431  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5073  hypothetical protein  29.53 
 
 		 1349 aa  48.1  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.528473  hitchhiker  0.000168425 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3694  hypothetical protein  31.97 
 
 		 1357 aa  47.8  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4490  GDSL family lipase  27.5 
 
 		 299 aa  46.6  0.0007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.14839  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3869  hypothetical protein  24.83 
 
 		 337 aa  44.3  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.00000000820088  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>