16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5213 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_5213  hypothetical protein  100 
 
 		 423 aa  863    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0312335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2941  hypothetical protein  65 
 
 		 410 aa  527  1e-148  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4260  hypothetical protein  65.78 
 
 		 397 aa  506  9.999999999999999e-143  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.50651  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7163  hypothetical protein  54.86 
 
 		 417 aa  461  1e-129  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2746  hypothetical protein  56.99 
 
 		 414 aa  419  1e-116  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.0000246717  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3769  hypothetical protein  54.74 
 
 		 410 aa  408  1e-113  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.657962  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6745  hypothetical protein  27.09 
 
 		 653 aa  102  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0419034  normal  0.323144 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4993  hypothetical protein  26.93 
 
 		 350 aa  96.7  8e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2701  hypothetical protein  30.18 
 
 		 353 aa  93.6  6e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000302317  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21860  hypothetical protein  25.89 
 
 		 354 aa  84.3  0.000000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.218372  normal  0.0328594 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6063  Ricin B lectin  24.51 
 
 		 524 aa  82.8  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1679  hypothetical protein  26.76 
 
 		 416 aa  76.6  0.0000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.882455  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1894  hypothetical protein  26.74 
 
 		 413 aa  74.3  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1673  hypothetical protein  25.58 
 
 		 418 aa  69.3  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.595687 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3869  hypothetical protein  28.91 
 
 		 337 aa  48.1  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.00000000820088  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0166  hypothetical protein  25.56 
 
 		 367 aa  45.1  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>