16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_1673 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_1679  hypothetical protein  82.34 
 
 
416 aa  660    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.882455  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1673  hypothetical protein  100 
 
 
418 aa  852    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.595687 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1894  hypothetical protein  69.23 
 
 
413 aa  544  1e-154  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21860  hypothetical protein  25.65 
 
 
354 aa  89  1e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.218372  normal  0.0328594 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4260  hypothetical protein  28.16 
 
 
397 aa  89.4  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.50651  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4993  hypothetical protein  25.74 
 
 
350 aa  85.5  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2701  hypothetical protein  26.34 
 
 
353 aa  79.7  0.00000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000302317  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7163  hypothetical protein  26.17 
 
 
417 aa  76.6  0.0000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5213  hypothetical protein  26.57 
 
 
423 aa  75.1  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0312335  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3769  hypothetical protein  26.8 
 
 
410 aa  71.2  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.657962  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2746  hypothetical protein  26.25 
 
 
414 aa  68.2  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.0000246717  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2941  hypothetical protein  25.23 
 
 
410 aa  68.2  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6745  hypothetical protein  26.05 
 
 
653 aa  66.6  0.0000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0419034  normal  0.323144 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6063  Ricin B lectin  26.54 
 
 
524 aa  57.8  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3694  hypothetical protein  33.33 
 
 
1357 aa  50.1  0.00008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1035  hypothetical protein  30.68 
 
 
346 aa  44.7  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0174734  hitchhiker  0.00616625 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>