15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2941 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_2941  hypothetical protein  100 
 
 
410 aa  837    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5213  hypothetical protein  69.01 
 
 
423 aa  536  1e-151  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0312335  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4260  hypothetical protein  62.53 
 
 
397 aa  470  1.0000000000000001e-131  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.50651  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3769  hypothetical protein  58.49 
 
 
410 aa  432  1e-120  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.657962  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7163  hypothetical protein  52.38 
 
 
417 aa  406  1.0000000000000001e-112  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2746  hypothetical protein  52.56 
 
 
414 aa  384  1e-105  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.0000246717  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4993  hypothetical protein  28.31 
 
 
350 aa  96.3  8e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2701  hypothetical protein  29.35 
 
 
353 aa  87  6e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000302317  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1679  hypothetical protein  27.32 
 
 
416 aa  77.4  0.0000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.882455  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6745  hypothetical protein  25.61 
 
 
653 aa  77.4  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0419034  normal  0.323144 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21860  hypothetical protein  25.54 
 
 
354 aa  72.8  0.000000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.218372  normal  0.0328594 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1673  hypothetical protein  25 
 
 
418 aa  65.1  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.595687 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6063  Ricin B lectin  23.82 
 
 
524 aa  64.3  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1894  hypothetical protein  26.32 
 
 
413 aa  62  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3694  hypothetical protein  25.33 
 
 
1357 aa  45.1  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>