26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_3756 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_3756  hypothetical protein  100 
 
 		 437 aa  881    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3346  von Willebrand factor type A  42.3 
 
 		 411 aa  278  1e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.688988 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3648  hypothetical protein  39.18 
 
 		 400 aa  255  8e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2738  von Willebrand factor type A  39.63 
 
 		 419 aa  244  3e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0399  hypothetical protein  32.17 
 
 		 566 aa  58.9  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2052  hypothetical protein  32.17 
 
 		 566 aa  58.5  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0227  von Willebrand factor type A  26.54 
 
 		 436 aa  55.8  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2151  hypothetical protein  44.23 
 
 		 582 aa  53.5  0.000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.940031  normal  0.0926842 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01450  hypothetical protein  30.37 
 
 		 744 aa  53.1  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.657991  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0183  Flp pilus assembly protein TadG  39.34 
 
 		 562 aa  51.2  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.44527 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3558  hypothetical protein  27.17 
 
 		 455 aa  50.1  0.00008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2796  hypothetical protein  44.83 
 
 		 135 aa  50.1  0.00008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.260349  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7591  hypothetical protein  23.7 
 
 		 449 aa  50.1  0.00008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.29036  normal  0.0579833 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2499  hypothetical protein  33.64 
 
 		 631 aa  49.7  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.33724  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1637  von Willebrand factor (vWF) domain containing protein  25.51 
 
 		 794 aa  49.7  0.0001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2394  hypothetical protein  27.03 
 
 		 456 aa  48.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.600984  normal  0.360592 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2418  hypothetical protein  28.57 
 
 		 483 aa  47.8  0.0004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.00315022  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2267  hypothetical protein  32.86 
 
 		 553 aa  47.4  0.0005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.593229 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1938  putative signal peptide protein  33 
 
 		 126 aa  46.6  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.608545 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3496  hypothetical protein  35.06 
 
 		 568 aa  45.4  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.280319  normal  0.0769646 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2733  von Willebrand factor type A  30.38 
 
 		 406 aa  45.4  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0838  hypothetical protein  37.25 
 
 		 563 aa  45.8  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.296759  normal  0.604194 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2227  hypothetical protein  22.22 
 
 		 429 aa  45.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.410036  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2084  hypothetical protein  39.78 
 
 		 549 aa  44.7  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0811  hypothetical protein  30.27 
 
 		 435 aa  44.7  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.563774  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2717  hypothetical protein  34.55 
 
 		 432 aa  43.5  0.008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.452061 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>