45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_3131 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_3131  von Willebrand factor, type A  100 
 
 		 565 aa  1142    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1830  von Willebrand factor type A  31.89 
 
 		 573 aa  259  1e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2796  von Willebrand factor, type A  22.94 
 
 		 543 aa  113  8.000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.110662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3134  hypothetical protein  79.37 
 
 		 66 aa  106  1e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2191  von Willebrand factor type A  22.65 
 
 		 546 aa  105  2e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2575  von Willebrand factor type A  22.74 
 
 		 547 aa  103  9e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3163  von Willebrand factor type A  21.64 
 
 		 550 aa  80.5  0.00000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.181499  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2577  von Willebrand factor type A  21.85 
 
 		 562 aa  60.8  0.00000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_54892  predicted protein  29.08 
 
 		 523 aa  59.3  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0818  von Willebrand factor type A  21.02 
 
 		 607 aa  57.4  0.0000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4902  von Willebrand factor type A  27.78 
 
 		 319 aa  54.3  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.745453  normal  0.578056 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3644  von Willebrand factor type A  25.62 
 
 		 589 aa  53.9  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0759  von Willebrand factor type A  20.72 
 
 		 547 aa  53.9  0.000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.09187  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01450  hypothetical protein  34.78 
 
 		 744 aa  53.5  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.657991  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2441  von Willebrand factor, type A  21.52 
 
 		 609 aa  52.8  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3783  outer membrane adhesin like proteiin  27.78 
 
 		 1215 aa  52.4  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0723  von Willebrand factor type A  24.28 
 
 		 419 aa  52  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0959383  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3594  outer membrane adhesin like proteiin  27.78 
 
 		 1215 aa  52  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2484  von Willebrand factor type A  24.86 
 
 		 559 aa  51.2  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000228446  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0567  von Willebrand factor type A  20.27 
 
 		 587 aa  51.2  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0560  putative outer membrane adhesin like protein  26.54 
 
 		 1215 aa  50.1  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3393  putative outer membrane adhesin like protein  26.54 
 
 		 1215 aa  50.1  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0139307 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3660  putative outer membrane adhesin like proteiin  27.27 
 
 		 1215 aa  50.1  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6113  von Willebrand factor type A  32.14 
 
 		 430 aa  49.3  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0766  von Willebrand factor type A  26.42 
 
 		 536 aa  49.3  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2578  hypothetical protein  21.6 
 
 		 414 aa  49.3  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0477  von Willebrand factor, type A  31.21 
 
 		 571 aa  48.5  0.0003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1754  von Willebrand factor, type A  28.99 
 
 		 327 aa  48.1  0.0004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.294878  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2029  von Willebrand factor type A domain-containing protein  31.17 
 
 		 358 aa  47.8  0.0005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.34439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3713  von Willebrand factor, type A  31.17 
 
 		 358 aa  47.8  0.0006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.512513  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1561  von Willebrand factor type A  30.52 
 
 		 358 aa  47  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.604958 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3690  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  22.65 
 
 		 680 aa  46.2  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1492  von Willebrand factor, type A  31.47 
 
 		 892 aa  45.4  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0036  von Willebrand factor type A  28.37 
 
 		 1446 aa  45.4  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1421  von Willebrand factor type A  27.82 
 
 		 329 aa  45.8  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.301249  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1744  BatB protein, putative  30.67 
 
 		 341 aa  45.1  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6039  Magnesium chelatase  24.68 
 
 		 719 aa  45.1  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02145  hypothetical protein  31.16 
 
 		 346 aa  44.7  0.005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1589  von Willebrand factor type A  29.87 
 
 		 358 aa  44.7  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.327037  hitchhiker  0.00013363 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0810  von Willebrand factor, type A  23.46 
 
 		 233 aa  44.3  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0073  von Willebrand factor, type A  28.57 
 
 		 349 aa  44.3  0.007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5861  Magnesium chelatase  24.67 
 
 		 680 aa  43.5  0.01  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2880  von Willebrand factor type A domain protein  25.3 
 
 		 225 aa  43.5  0.01  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.158441  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2394  von Willebrand factor, type A  25.17 
 
 		 972 aa  43.5  0.01  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.400523  hitchhiker  0.00000432302 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2499  von Willebrand factor type A  25.3 
 
 		 225 aa  43.5  0.01  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.950174  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>