55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2484 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_2484  von Willebrand factor type A  100 
 
 		 559 aa  1104    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000228446  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0759  von Willebrand factor type A  47.64 
 
 		 547 aa  414  1e-114  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.09187  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3212  von Willebrand factor type A  45.37 
 
 		 514 aa  408  1.0000000000000001e-112  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0502803  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2918  von Willebrand factor, type A  43.18 
 
 		 534 aa  353  4e-96  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.306616 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0766  von Willebrand factor type A  38.91 
 
 		 536 aa  303  4.0000000000000003e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1580  von Willebrand factor type A  30.08 
 
 		 522 aa  174  3.9999999999999995e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.743111 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1968  von Willebrand factor type A  27.82 
 
 		 513 aa  174  3.9999999999999995e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00234323  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1600  von Willebrand factor type A  33.6 
 
 		 481 aa  155  1e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.261392  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2796  von Willebrand factor, type A  25.93 
 
 		 543 aa  110  5e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.110662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1116  von Willebrand factor type A  24.34 
 
 		 562 aa  110  8.000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2575  von Willebrand factor type A  26.76 
 
 		 547 aa  108  2e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2577  von Willebrand factor type A  25.25 
 
 		 562 aa  106  1e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0818  von Willebrand factor type A  25.75 
 
 		 607 aa  103  1e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2441  von Willebrand factor, type A  26.75 
 
 		 609 aa  101  3e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2799  von Willebrand factor, type A  25.57 
 
 		 561 aa  101  4e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2191  von Willebrand factor type A  23.08 
 
 		 546 aa  100  6e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3957  von Willebrand factor type A  24.89 
 
 		 618 aa  93.6  8e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.136708 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3163  von Willebrand factor type A  23.09 
 
 		 550 aa  91.3  4e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.181499  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1513  hypothetical protein  26.01 
 
 		 605 aa  89.4  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00594342 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0945  von Willebrand factor type A  26.76 
 
 		 647 aa  85.9  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.651273 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1374  hypothetical protein  27.78 
 
 		 380 aa  82.4  0.00000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1527  von Willebrand factor type A  24.15 
 
 		 601 aa  73.6  0.000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0818776  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1863  von Willebrand factor type A  26.57 
 
 		 583 aa  72  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00271948  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1261  von Willebrand factor type A  26.79 
 
 		 814 aa  65.9  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.361472  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1830  von Willebrand factor type A  23.52 
 
 		 573 aa  64.7  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2672  extracellular solute-binding protein family 1  23.83 
 
 		 599 aa  64.7  0.000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.456876  normal  0.172094 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1359  von Willebrand factor, type A  24.2 
 
 		 570 aa  62.8  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00054034  normal  0.0176573 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3644  von Willebrand factor type A  25.31 
 
 		 589 aa  63.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1514  hypothetical protein  24.26 
 
 		 594 aa  62.4  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.283414  hitchhiker  0.00571716 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4679  von Willebrand factor type A  25.61 
 
 		 515 aa  62.4  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3738  von Willebrand factor type A  28.37 
 
 		 609 aa  62  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.105397 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3975  von Willebrand factor type A  24.71 
 
 		 583 aa  58.9  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.734666  hitchhiker  0.0036434 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3131  von Willebrand factor, type A  22.93 
 
 		 565 aa  58.9  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7651  hypothetical protein  24.57 
 
 		 560 aa  58.5  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0312  von Willebrand factor type A  25.61 
 
 		 564 aa  57  0.0000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2266  von Willebrand factor, type A  23.45 
 
 		 596 aa  56.2  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3690  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  32.3 
 
 		 680 aa  54.3  0.000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0463  von Willebrand factor type A  27.01 
 
 		 547 aa  52.4  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0327  von Willebrand factor, type A  26.05 
 
 		 655 aa  52  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0567  von Willebrand factor type A  24.94 
 
 		 587 aa  51.2  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5348  von Willebrand factor type A  27.61 
 
 		 583 aa  51.2  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.698925 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0747  hypothetical protein  24.21 
 
 		 587 aa  48.9  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.222622  normal  0.398394 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0753  hypothetical protein  24.72 
 
 		 367 aa  48.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0308132 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3594  von Willebrand factor, type A  23.29 
 
 		 576 aa  48.1  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3922  vault protein inter-alpha-trypsin  27.31 
 
 		 701 aa  47.8  0.0006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3232  von Willebrand factor type A  30.87 
 
 		 334 aa  45.8  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.34963  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4775  von Willebrand factor type A  22.32 
 
 		 615 aa  45.4  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0165447  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4074  hypothetical protein  27.13 
 
 		 355 aa  45.4  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_49215  predicted protein  28.68 
 
 		 582 aa  45.1  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.108223  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0263  von Willebrand factor type A  28.82 
 
 		 551 aa  45.4  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02705  von Willebrand factor, type A  28.06 
 
 		 349 aa  45.1  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7319  von Willebrand factor type A  24.44 
 
 		 608 aa  44.3  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.505027 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1377  hypothetical protein  24.38 
 
 		 584 aa  44.3  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.199891  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3108  von Willebrand factor type A (vWA) domain-containing protein  29.94 
 
 		 713 aa  43.9  0.007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0355813 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1270  von Willebrand factor type A  29.9 
 
 		 593 aa  43.5  0.01  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.432707  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>