41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0759 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_0759  von Willebrand factor type A  100 
 
 
547 aa  1065    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.09187  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2484  von Willebrand factor type A  47.47 
 
 
559 aa  422  1e-116  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000228446  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3212  von Willebrand factor type A  47.38 
 
 
514 aa  405  1e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0502803  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2918  von Willebrand factor, type A  45.9 
 
 
534 aa  377  1e-103  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.306616 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0766  von Willebrand factor type A  41.2 
 
 
536 aa  338  9.999999999999999e-92  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1968  von Willebrand factor type A  30.21 
 
 
513 aa  194  3e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00234323  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1580  von Willebrand factor type A  32.2 
 
 
522 aa  193  6e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.743111 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1600  von Willebrand factor type A  37.45 
 
 
481 aa  176  9.999999999999999e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.261392  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1513  hypothetical protein  26.03 
 
 
605 aa  102  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00594342 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2577  von Willebrand factor type A  26.01 
 
 
562 aa  102  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2575  von Willebrand factor type A  25.21 
 
 
547 aa  100  8e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1116  von Willebrand factor type A  22.52 
 
 
562 aa  99  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2796  von Willebrand factor, type A  25.76 
 
 
543 aa  97.4  6e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.110662  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2441  von Willebrand factor, type A  27.13 
 
 
609 aa  94.4  5e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1527  von Willebrand factor type A  27.37 
 
 
601 aa  92.4  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0818776  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2799  von Willebrand factor, type A  25.9 
 
 
561 aa  91.3  4e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1374  hypothetical protein  30.41 
 
 
380 aa  87  9e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2191  von Willebrand factor type A  24.73 
 
 
546 aa  85.9  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0818  von Willebrand factor type A  26.16 
 
 
607 aa  82.8  0.00000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3957  von Willebrand factor type A  24.63 
 
 
618 aa  77.4  0.0000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.136708 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1514  hypothetical protein  24.7 
 
 
594 aa  72.4  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.283414  hitchhiker  0.00571716 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1359  von Willebrand factor, type A  23.98 
 
 
570 aa  72.4  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00054034  normal  0.0176573 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1863  von Willebrand factor type A  26.07 
 
 
583 aa  69.7  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00271948  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0312  von Willebrand factor type A  26.52 
 
 
564 aa  63.2  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3163  von Willebrand factor type A  21.15 
 
 
550 aa  63.2  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.181499  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3644  von Willebrand factor type A  25.86 
 
 
589 aa  61.6  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1830  von Willebrand factor type A  23.69 
 
 
573 aa  59.7  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1261  von Willebrand factor type A  26.91 
 
 
814 aa  55.8  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.361472  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3975  von Willebrand factor type A  26.36 
 
 
583 aa  53.9  0.000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.734666  hitchhiker  0.0036434 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7651  hypothetical protein  25.81 
 
 
560 aa  53.1  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1270  von Willebrand factor type A  34.19 
 
 
593 aa  52.8  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.432707  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3690  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  32.12 
 
 
680 aa  52  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3131  von Willebrand factor, type A  20.53 
 
 
565 aa  51.6  0.00004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3594  von Willebrand factor, type A  26.62 
 
 
576 aa  49.3  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3738  von Willebrand factor type A  23.73 
 
 
609 aa  49.7  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.105397 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4679  von Willebrand factor type A  28.83 
 
 
515 aa  48.5  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2672  extracellular solute-binding protein family 1  22.54 
 
 
599 aa  48.9  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.456876  normal  0.172094 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0567  von Willebrand factor type A  23.64 
 
 
587 aa  48.5  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1115  hypothetical protein  26.54 
 
 
387 aa  47.8  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.483933  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0924  extracellular solute-binding protein family 1  22.15 
 
 
334 aa  47.8  0.0006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4902  von Willebrand factor type A  28.26 
 
 
319 aa  44.3  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.745453  normal  0.578056 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>