20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1600 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_1600  von Willebrand factor type A  100 
 
 		 481 aa  914    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.261392  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2918  von Willebrand factor, type A  39.24 
 
 		 534 aa  239  5.999999999999999e-62  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.306616 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3212  von Willebrand factor type A  35.22 
 
 		 514 aa  193  7e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0502803  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0759  von Willebrand factor type A  37.35 
 
 		 547 aa  186  5e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.09187  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0766  von Willebrand factor type A  33.86 
 
 		 536 aa  173  7.999999999999999e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2484  von Willebrand factor type A  33.33 
 
 		 559 aa  160  4e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000228446  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1968  von Willebrand factor type A  23.52 
 
 		 513 aa  112  2.0000000000000002e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00234323  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1580  von Willebrand factor type A  24.6 
 
 		 522 aa  92  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.743111 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1527  von Willebrand factor type A  26.55 
 
 		 601 aa  61.6  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0818776  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1514  hypothetical protein  26.37 
 
 		 594 aa  57.8  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.283414  hitchhiker  0.00571716 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1116  von Willebrand factor type A  23.8 
 
 		 562 aa  56.6  0.0000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2796  von Willebrand factor, type A  23.63 
 
 		 543 aa  52  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.110662  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2191  von Willebrand factor type A  22.63 
 
 		 546 aa  49.3  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2577  von Willebrand factor type A  24.46 
 
 		 562 aa  46.6  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0818  von Willebrand factor type A  25.62 
 
 		 607 aa  46.6  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2768  hypothetical protein  31.38 
 
 		 344 aa  46.6  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3644  von Willebrand factor type A  22.61 
 
 		 589 aa  45.8  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2914  hypothetical protein  31.38 
 
 		 344 aa  45.4  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0648  von Willebrand factor, type A  28.79 
 
 		 307 aa  43.5  0.007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2634  von Willebrand factor type A  28.93 
 
 		 313 aa  43.5  0.008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>