56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2918 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2918  von Willebrand factor, type A  100 
 
 		 534 aa  1048    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.306616 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3212  von Willebrand factor type A  48.87 
 
 		 514 aa  439  9.999999999999999e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0502803  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0759  von Willebrand factor type A  45.7 
 
 		 547 aa  382  1e-105  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.09187  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2484  von Willebrand factor type A  42.75 
 
 		 559 aa  363  3e-99  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000228446  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0766  von Willebrand factor type A  40.98 
 
 		 536 aa  335  9e-91  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1600  von Willebrand factor type A  39.24 
 
 		 481 aa  246  8e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.261392  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1968  von Willebrand factor type A  30.68 
 
 		 513 aa  197  3e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00234323  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1580  von Willebrand factor type A  31.6 
 
 		 522 aa  184  3e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.743111 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1527  von Willebrand factor type A  26.02 
 
 		 601 aa  106  1e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0818776  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2799  von Willebrand factor, type A  26.92 
 
 		 561 aa  104  5e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0818  von Willebrand factor type A  25.92 
 
 		 607 aa  101  4e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2191  von Willebrand factor type A  23.87 
 
 		 546 aa  98.2  3e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1513  hypothetical protein  26.35 
 
 		 605 aa  98.2  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00594342 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1116  von Willebrand factor type A  24.04 
 
 		 562 aa  95.1  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1514  hypothetical protein  24.89 
 
 		 594 aa  94.7  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.283414  hitchhiker  0.00571716 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3957  von Willebrand factor type A  25.1 
 
 		 618 aa  95.1  3e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.136708 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2575  von Willebrand factor type A  24.06 
 
 		 547 aa  94.4  5e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2577  von Willebrand factor type A  25.64 
 
 		 562 aa  94  6e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2796  von Willebrand factor, type A  24.36 
 
 		 543 aa  92.8  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.110662  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1863  von Willebrand factor type A  25.99 
 
 		 583 aa  90.5  7e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00271948  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1359  von Willebrand factor, type A  24.45 
 
 		 570 aa  88.2  3e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00054034  normal  0.0176573 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1374  hypothetical protein  28.11 
 
 		 380 aa  79.7  0.0000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3644  von Willebrand factor type A  24.26 
 
 		 589 aa  76.6  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2441  von Willebrand factor, type A  24.32 
 
 		 609 aa  68.6  0.0000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0747  hypothetical protein  26.72 
 
 		 587 aa  67.4  0.0000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.222622  normal  0.398394 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3975  von Willebrand factor type A  26.73 
 
 		 583 aa  66.2  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.734666  hitchhiker  0.0036434 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3163  von Willebrand factor type A  22 
 
 		 550 aa  60.5  0.00000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.181499  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1830  von Willebrand factor type A  22 
 
 		 573 aa  59.3  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0945  von Willebrand factor type A  25.27 
 
 		 647 aa  53.9  0.000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.651273 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3594  von Willebrand factor, type A  25.15 
 
 		 576 aa  53.5  0.000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1952  von Willebrand factor type A  29.95 
 
 		 315 aa  52.8  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.159987  hitchhiker  0.00398429 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2700  von Willebrand factor, type A  31.87 
 
 		 566 aa  50.8  0.00006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.557808  normal  0.158328 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2410  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  28.19 
 
 		 751 aa  49.7  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.177672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1384  von Willebrand factor, type A  32.34 
 
 		 319 aa  50.1  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.410804  hitchhiker  0.00717595 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3424  von Willebrand factor type A  29.7 
 
 		 592 aa  48.9  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.236212 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0482  von Willebrand factor type A  29.94 
 
 		 222 aa  48.9  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0122  inter-alpha-trypsin inhibitor domain-containing protein  28.9 
 
 		 763 aa  48.5  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1017  von Willebrand factor type A; type II secretion system protein  30.61 
 
 		 643 aa  48.1  0.0004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3137  von Willebrand factor type A  28.82 
 
 		 224 aa  47.8  0.0005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2195  inter-alpha-trypsin inhibitor domain-containing protein  28.65 
 
 		 760 aa  47  0.0008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0477  von Willebrand factor, type A  27.7 
 
 		 571 aa  47  0.0008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2277  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  27.13 
 
 		 755 aa  46.6  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0645539  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1289  von Willebrand factor type A  34 
 
 		 594 aa  46.2  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0312  von Willebrand factor type A  24.08 
 
 		 564 aa  45.8  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2200  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  27.32 
 
 		 759 aa  45.8  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0567  von Willebrand factor type A  23.88 
 
 		 587 aa  45.8  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01616  von Willebrand factor type A domain protein  29.73 
 
 		 350 aa  45.1  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0568  von Willebrand factor type A  28.62 
 
 		 588 aa  45.1  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4762  von Willebrand factor type A domain protein  30.3 
 
 		 224 aa  45.1  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0183  von Willebrand factor, type A  29.79 
 
 		 563 aa  44.3  0.006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.174598  normal  0.439463 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0616  von Willebrand factor type A  27.09 
 
 		 308 aa  44.3  0.006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.544287  normal  0.600223 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1007  von Willebrand factor type A  29.77 
 
 		 324 aa  43.9  0.007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0193109  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4679  von Willebrand factor type A  24.9 
 
 		 515 aa  43.5  0.009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2426  von Willebrand factor type A domain-containing protein  25.79 
 
 		 588 aa  43.5  0.009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2419  von Willebrand factor type A domain-containing protein  25.26 
 
 		 575 aa  43.5  0.009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.433183  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1387  von Willebrand factor type A  25.26 
 
 		 575 aa  43.5  0.009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.336718  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>