49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1289 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_1289  von Willebrand factor type A  100 
 
 		 594 aa  1180    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3360  von Willebrand factor type A  37.48 
 
 		 527 aa  273  9e-72  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.354576  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0312  von Willebrand factor type A  33.03 
 
 		 564 aa  193  7e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0463  von Willebrand factor type A  39.76 
 
 		 547 aa  181  4.999999999999999e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4679  von Willebrand factor type A  31.05 
 
 		 515 aa  179  2e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1261  von Willebrand factor type A  34.26 
 
 		 814 aa  176  8e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.361472  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1270  von Willebrand factor type A  33.96 
 
 		 593 aa  169  1e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.432707  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2672  extracellular solute-binding protein family 1  27.46 
 
 		 599 aa  168  2.9999999999999998e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.456876  normal  0.172094 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2266  von Willebrand factor, type A  31.45 
 
 		 596 aa  163  9e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0747  hypothetical protein  29.47 
 
 		 587 aa  152  1e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.222622  normal  0.398394 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0567  von Willebrand factor type A  28.78 
 
 		 587 aa  152  2e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1377  hypothetical protein  31.19 
 
 		 584 aa  148  3e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.199891  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2441  von Willebrand factor, type A  28.62 
 
 		 609 aa  142  1.9999999999999998e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5348  von Willebrand factor type A  34.87 
 
 		 583 aa  139  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.698925 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3975  von Willebrand factor type A  31.95 
 
 		 583 aa  136  9.999999999999999e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.734666  hitchhiker  0.0036434 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0818  von Willebrand factor type A  33.12 
 
 		 607 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7319  von Willebrand factor type A  35.18 
 
 		 608 aa  135  3e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.505027 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3594  von Willebrand factor, type A  30.06 
 
 		 576 aa  134  3.9999999999999996e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0327  von Willebrand factor, type A  35.49 
 
 		 655 aa  133  6.999999999999999e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2023  von Willebrand factor type A  28.49 
 
 		 586 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000927527  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0568  von Willebrand factor type A  32.05 
 
 		 588 aa  132  2.0000000000000002e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7651  hypothetical protein  29.07 
 
 		 560 aa  128  3e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1513  hypothetical protein  32.91 
 
 		 605 aa  125  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00594342 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4775  von Willebrand factor type A  27.79 
 
 		 615 aa  122  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0165447  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1527  von Willebrand factor type A  31.95 
 
 		 601 aa  119  1.9999999999999998e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0818776  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1514  hypothetical protein  32.04 
 
 		 594 aa  115  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.283414  hitchhiker  0.00571716 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1863  von Willebrand factor type A  33.44 
 
 		 583 aa  113  1.0000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00271948  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3957  von Willebrand factor type A  28.62 
 
 		 618 aa  80.9  0.00000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.136708 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3738  von Willebrand factor type A  28.3 
 
 		 609 aa  68.9  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.105397 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3098  von Willebrand factor, type A  26.21 
 
 		 640 aa  61.6  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.298521  normal  0.039864 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3368  von Willebrand factor, type A  26.4 
 
 		 636 aa  54.7  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.893791 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11865  hypothetical protein  23.1 
 
 		 677 aa  53.1  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.428067  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2484  von Willebrand factor type A  28.48 
 
 		 559 aa  53.5  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000228446  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3212  von Willebrand factor type A  29 
 
 		 514 aa  52.4  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0502803  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2918  von Willebrand factor, type A  34 
 
 		 534 aa  52  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.306616 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0945  von Willebrand factor type A  25.32 
 
 		 647 aa  51.6  0.00004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.651273 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3163  von Willebrand factor type A  23.96 
 
 		 550 aa  50.8  0.00007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.181499  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4074  hypothetical protein  34.78 
 
 		 355 aa  50.8  0.00008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1606  von Willebrand factor, type A  28.77 
 
 		 715 aa  49.7  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2845  hypothetical protein  24.53 
 
 		 688 aa  50.1  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.602456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2818  hypothetical protein  24.67 
 
 		 685 aa  50.1  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2862  hypothetical protein  24.67 
 
 		 685 aa  50.1  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2799  von Willebrand factor, type A  32 
 
 		 561 aa  49.7  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2520  von Willebrand factor, type A  31.39 
 
 		 452 aa  48.9  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.579263 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2577  von Willebrand factor type A  27.76 
 
 		 562 aa  48.9  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1773  von Willebrand factor type A  30.47 
 
 		 316 aa  46.6  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.229115  normal  0.320362 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1359  von Willebrand factor, type A  31.3 
 
 		 570 aa  47  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00054034  normal  0.0176573 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3644  von Willebrand factor type A  38 
 
 		 589 aa  45.8  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1017  von Willebrand factor type A; type II secretion system protein  30.43 
 
 		 643 aa  45.1  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>