50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0568 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_0568  von Willebrand factor type A  100 
 
 
588 aa  1170    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1377  hypothetical protein  33.71 
 
 
584 aa  258  2e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.199891  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0747  hypothetical protein  34.2 
 
 
587 aa  253  6e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.222622  normal  0.398394 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0567  von Willebrand factor type A  30.47 
 
 
587 aa  230  5e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2672  extracellular solute-binding protein family 1  30.34 
 
 
599 aa  220  3.9999999999999997e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.456876  normal  0.172094 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4679  von Willebrand factor type A  31.6 
 
 
515 aa  220  6e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2023  von Willebrand factor type A  32.75 
 
 
586 aa  216  9.999999999999999e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000927527  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0312  von Willebrand factor type A  32.54 
 
 
564 aa  216  9.999999999999999e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3594  von Willebrand factor, type A  32.01 
 
 
576 aa  207  5e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7651  hypothetical protein  30.68 
 
 
560 aa  206  8e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1261  von Willebrand factor type A  30.27 
 
 
814 aa  200  7e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.361472  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3975  von Willebrand factor type A  31.8 
 
 
583 aa  199  9e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.734666  hitchhiker  0.0036434 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2266  von Willebrand factor, type A  29.53 
 
 
596 aa  196  1e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2441  von Willebrand factor, type A  31.12 
 
 
609 aa  176  9.999999999999999e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0327  von Willebrand factor, type A  29.51 
 
 
655 aa  160  8e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5348  von Willebrand factor type A  27.98 
 
 
583 aa  157  4e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.698925 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0463  von Willebrand factor type A  29.67 
 
 
547 aa  157  7e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4775  von Willebrand factor type A  28.11 
 
 
615 aa  156  1e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0165447  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1527  von Willebrand factor type A  28 
 
 
601 aa  145  2e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0818776  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1270  von Willebrand factor type A  29.3 
 
 
593 aa  144  5e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.432707  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1514  hypothetical protein  29.38 
 
 
594 aa  140  6e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.283414  hitchhiker  0.00571716 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7319  von Willebrand factor type A  27.87 
 
 
608 aa  139  1e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.505027 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0818  von Willebrand factor type A  26.73 
 
 
607 aa  138  3.0000000000000003e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1513  hypothetical protein  28.74 
 
 
605 aa  137  4e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00594342 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1289  von Willebrand factor type A  27.14 
 
 
594 aa  123  9.999999999999999e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3738  von Willebrand factor type A  26.33 
 
 
609 aa  120  4.9999999999999996e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.105397 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3360  von Willebrand factor type A  27.81 
 
 
527 aa  112  2.0000000000000002e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.354576  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3957  von Willebrand factor type A  26.28 
 
 
618 aa  102  2e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.136708 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1863  von Willebrand factor type A  27.32 
 
 
583 aa  99.4  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00271948  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4074  hypothetical protein  29.9 
 
 
355 aa  84  0.000000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3163  von Willebrand factor type A  21.2 
 
 
550 aa  76.6  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.181499  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2577  von Willebrand factor type A  25.39 
 
 
562 aa  72  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1116  von Willebrand factor type A  26.71 
 
 
562 aa  71.6  0.00000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3644  von Willebrand factor type A  26.84 
 
 
589 aa  66.6  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2818  hypothetical protein  22.87 
 
 
685 aa  65.9  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2862  hypothetical protein  22.87 
 
 
685 aa  65.9  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2799  von Willebrand factor, type A  23.74 
 
 
561 aa  65.5  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2796  von Willebrand factor, type A  23.04 
 
 
543 aa  65.1  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.110662  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2575  von Willebrand factor type A  22.28 
 
 
547 aa  62.4  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2845  hypothetical protein  22.68 
 
 
688 aa  61.6  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.602456  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3368  von Willebrand factor, type A  23.79 
 
 
636 aa  58.2  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.893791 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0945  von Willebrand factor type A  23.53 
 
 
647 aa  58.5  0.0000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.651273 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2191  von Willebrand factor type A  21.45 
 
 
546 aa  55.1  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1359  von Willebrand factor, type A  31.68 
 
 
570 aa  50.1  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00054034  normal  0.0176573 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5347  von Willebrand factor type A  30.1 
 
 
596 aa  49.7  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.23692  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2330  hypothetical protein  33.33 
 
 
368 aa  48.9  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.489785  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3212  von Willebrand factor type A  26.87 
 
 
514 aa  46.2  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0502803  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2484  von Willebrand factor type A  27.16 
 
 
559 aa  45.8  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000228446  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2918  von Willebrand factor, type A  28.62 
 
 
534 aa  45.4  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.306616 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11865  hypothetical protein  24.25 
 
 
677 aa  43.9  0.009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.428067  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>