43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_2023 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_2023  von Willebrand factor type A  100 
 
 
586 aa  1146    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000927527  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1261  von Willebrand factor type A  48.31 
 
 
814 aa  477  1e-133  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.361472  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4679  von Willebrand factor type A  45.25 
 
 
515 aa  409  1e-113  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2672  extracellular solute-binding protein family 1  33.78 
 
 
599 aa  310  4e-83  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.456876  normal  0.172094 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2266  von Willebrand factor, type A  35.22 
 
 
596 aa  286  5e-76  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7651  hypothetical protein  33.57 
 
 
560 aa  268  2e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0747  hypothetical protein  33.71 
 
 
587 aa  261  2e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.222622  normal  0.398394 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1377  hypothetical protein  33.33 
 
 
584 aa  255  1.0000000000000001e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.199891  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0312  von Willebrand factor type A  34.3 
 
 
564 aa  252  2e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0567  von Willebrand factor type A  32.5 
 
 
587 aa  250  6e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0568  von Willebrand factor type A  32.23 
 
 
588 aa  226  8e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3594  von Willebrand factor, type A  33.06 
 
 
576 aa  215  9.999999999999999e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3975  von Willebrand factor type A  32.58 
 
 
583 aa  215  1.9999999999999998e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.734666  hitchhiker  0.0036434 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4775  von Willebrand factor type A  29.96 
 
 
615 aa  209  9e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0165447  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1270  von Willebrand factor type A  33.21 
 
 
593 aa  209  1e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.432707  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0463  von Willebrand factor type A  32.92 
 
 
547 aa  204  3e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5348  von Willebrand factor type A  31.51 
 
 
583 aa  203  8e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.698925 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7319  von Willebrand factor type A  32.22 
 
 
608 aa  185  2.0000000000000003e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.505027 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2441  von Willebrand factor, type A  26.75 
 
 
609 aa  160  5e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0818  von Willebrand factor type A  25.32 
 
 
607 aa  145  2e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1863  von Willebrand factor type A  27.58 
 
 
583 aa  144  5e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00271948  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1513  hypothetical protein  26.21 
 
 
605 aa  140  6e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00594342 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1514  hypothetical protein  26.48 
 
 
594 aa  137  7.000000000000001e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.283414  hitchhiker  0.00571716 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3360  von Willebrand factor type A  27.13 
 
 
527 aa  135  9.999999999999999e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.354576  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1289  von Willebrand factor type A  28.29 
 
 
594 aa  130  9.000000000000001e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1527  von Willebrand factor type A  25.97 
 
 
601 aa  127  7e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0818776  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0327  von Willebrand factor, type A  27.86 
 
 
655 aa  126  9e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4074  hypothetical protein  33.22 
 
 
355 aa  109  1e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3957  von Willebrand factor type A  24.57 
 
 
618 aa  107  6e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.136708 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3738  von Willebrand factor type A  23.82 
 
 
609 aa  88.6  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.105397 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3368  von Willebrand factor, type A  26.78 
 
 
636 aa  86.3  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.893791 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0945  von Willebrand factor type A  22.81 
 
 
647 aa  83.6  0.000000000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.651273 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11865  hypothetical protein  25.18 
 
 
677 aa  75.1  0.000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.428067  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2799  von Willebrand factor, type A  25.72 
 
 
561 aa  70.9  0.00000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2796  von Willebrand factor, type A  24.91 
 
 
543 aa  67.4  0.0000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.110662  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1116  von Willebrand factor type A  21.91 
 
 
562 aa  67  0.0000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2191  von Willebrand factor type A  23.67 
 
 
546 aa  64.3  0.000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2575  von Willebrand factor type A  25 
 
 
547 aa  63.9  0.000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2577  von Willebrand factor type A  23.51 
 
 
562 aa  63.2  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5347  von Willebrand factor type A  25.54 
 
 
596 aa  62.4  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.23692  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3644  von Willebrand factor type A  26.15 
 
 
589 aa  58.9  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3163  von Willebrand factor type A  24.8 
 
 
550 aa  55.5  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.181499  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0766  von Willebrand factor type A  23.76 
 
 
536 aa  48.1  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>